MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_014834	GAT	2	6	3182670	3182675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9502	NC_014834	ACT	2	6	3182693	3182698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9503	NC_014834	GCC	2	6	3182708	3182713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9504	NC_014834	A	8	8	3182762	3182769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9505	NC_014834	TCG	2	6	3183611	3183616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9506	NC_014834	CGA	2	6	3183617	3183622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9507	NC_014834	GCG	2	6	3183631	3183636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9508	NC_014834	CGA	2	6	3183650	3183655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9509	NC_014834	CCAAGG	2	12	3183663	3183674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9510	NC_014834	CTCG	2	8	3183676	3183683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9511	NC_014834	T	7	7	3183724	3183730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9512	NC_014834	CCT	2	6	3183784	3183789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9513	NC_014834	CG	3	6	3183802	3183807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9514	NC_014834	TCG	2	6	3183830	3183835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9515	NC_014834	GCCG	2	8	3183857	3183864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9516	NC_014834	CGC	2	6	3183867	3183872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9517	NC_014834	CCT	2	6	3183879	3183884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9518	NC_014834	CCT	2	6	3183895	3183900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9519	NC_014834	GACC	2	8	3183934	3183941	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9520	NC_014834	GGC	2	6	3183959	3183964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9521	NC_014834	CGG	2	6	3183993	3183998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9522	NC_014834	GAC	2	6	3184031	3184036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9523	NC_014834	CGG	2	6	3184512	3184517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9524	NC_014834	CG	3	6	3184531	3184536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9525	NC_014834	AAC	2	6	3184585	3184590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9526	NC_014834	GGA	2	6	3184595	3184600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9527	NC_014834	TCA	2	6	3184652	3184657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9528	NC_014834	CGCGC	2	10	3184684	3184693	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9529	NC_014834	T	6	6	3184744	3184749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9530	NC_014834	GC	3	6	3185080	3185085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9531	NC_014834	ACA	2	6	3185097	3185102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9532	NC_014834	A	6	6	3185161	3185166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9533	NC_014834	GCA	2	6	3185210	3185215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9534	NC_014834	CGC	2	6	3185253	3185258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9535	NC_014834	CGG	2	6	3185266	3185271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9536	NC_014834	CTG	2	6	3185286	3185291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9537	NC_014834	CGTG	2	8	3185313	3185320	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9538	NC_014834	CG	3	6	3185345	3185350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9539	NC_014834	CGG	2	6	3185355	3185360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9540	NC_014834	GA	3	6	3185407	3185412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9541	NC_014834	CCT	2	6	3185656	3185661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9542	NC_014834	ACCA	2	8	3185698	3185705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9543	NC_014834	CCAAT	2	10	3185751	3185760	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9544	NC_014834	CAG	2	6	3185821	3185826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9545	NC_014834	CAC	2	6	3185865	3185870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9546	NC_014834	CCG	2	6	3185871	3185876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9547	NC_014834	ATC	2	6	3185984	3185989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9548	NC_014834	GTC	2	6	3186007	3186012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9549	NC_014834	GAC	2	6	3186077	3186082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9550	NC_014834	CCTG	2	8	3186135	3186142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9551	NC_014834	TCCA	2	8	3187069	3187076	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9552	NC_014834	CCCG	2	8	3187141	3187148	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9553	NC_014834	TCA	2	6	3187162	3187167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9554	NC_014834	CCCGG	2	10	3187170	3187179	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9555	NC_014834	CTTGC	2	10	3187188	3187197	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9556	NC_014834	CCG	2	6	3187207	3187212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9557	NC_014834	TGC	2	6	3190082	3190087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9558	NC_014834	CGC	2	6	3190095	3190100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9559	NC_014834	CGG	2	6	3190105	3190110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9560	NC_014834	CG	3	6	3191152	3191157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9561	NC_014834	GT	4	8	3191191	3191198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9562	NC_014834	CGG	2	6	3191205	3191210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9563	NC_014834	CGG	2	6	3191308	3191313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9564	NC_014834	AAT	2	6	3193737	3193742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9565	NC_014834	TTC	2	6	3193756	3193761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9566	NC_014834	CCAT	2	8	3194133	3194140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9567	NC_014834	GTC	2	6	3196158	3196163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9568	NC_014834	GCGA	2	8	3196172	3196179	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9569	NC_014834	GCG	3	9	3196197	3196205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9570	NC_014834	GCC	2	6	3196231	3196236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9571	NC_014834	GCG	3	9	3196242	3196250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9572	NC_014834	TCC	2	6	3197023	3197028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9573	NC_014834	GTC	2	6	3197044	3197049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9574	NC_014834	CCTG	2	8	3197054	3197061	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9575	NC_014834	TTC	2	6	3197066	3197071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9576	NC_014834	TC	3	6	3197070	3197075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9577	NC_014834	GC	3	6	3197097	3197102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9578	NC_014834	CGA	2	6	3197640	3197645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9580	NC_014834	GCG	2	6	3198690	3198695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9581	NC_014834	CTG	2	6	3200055	3200060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9582	NC_014834	CGG	2	6	3200097	3200102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9583	NC_014834	GCA	2	6	3201410	3201415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9584	NC_014834	TCGA	2	8	3201426	3201433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9585	NC_014834	CGG	3	9	3201492	3201500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9586	NC_014834	GTC	2	6	3201501	3201506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9587	NC_014834	GGC	2	6	3201510	3201515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9588	NC_014834	GCC	2	6	3201835	3201840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9589	NC_014834	C	7	7	3201850	3201856	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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9591	NC_014834	TCG	2	6	3201910	3201915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9593	NC_014834	ACCG	2	8	3201982	3201989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9594	NC_014834	CCGAC	2	10	3202000	3202009	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9595	NC_014834	GCA	2	6	3202060	3202065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9598	NC_014834	T	6	6	3202133	3202138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9599	NC_014834	CG	3	6	3203972	3203977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9600	NC_014834	AGC	3	9	3203985	3203993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9601	NC_014834	CG	3	6	3203994	3203999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9602	NC_014834	TCGA	2	8	3204000	3204007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9603	NC_014834	TC	3	6	3205327	3205332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9604	NC_014834	TGG	2	6	3206366	3206371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9605	NC_014834	CCAA	2	8	3208102	3208109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9606	NC_014834	CGC	3	9	3208178	3208186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9607	NC_014834	CCG	2	6	3208200	3208205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9608	NC_014834	CGG	2	6	3208284	3208289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9609	NC_014834	GCC	2	6	3208310	3208315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9610	NC_014834	CGA	2	6	3208325	3208330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9611	NC_014834	AATGG	2	10	3209476	3209485	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9612	NC_014834	CGG	2	6	3209502	3209507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9613	NC_014834	CG	3	6	3209558	3209563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9614	NC_014834	CCG	2	6	3209605	3209610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9615	NC_014834	GCG	2	6	3209619	3209624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9616	NC_014834	GC	4	8	3209665	3209672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9617	NC_014834	AGC	2	6	3209691	3209696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9619	NC_014834	ACTC	2	8	3211602	3211609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9621	NC_014834	GCC	2	6	3214120	3214125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9622	NC_014834	CGG	2	6	3214177	3214182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9623	NC_014834	GAC	2	6	3214187	3214192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9625	NC_014834	GCG	3	9	3214230	3214238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9626	NC_014834	GGT	2	6	3214248	3214253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9627	NC_014834	GC	4	8	3214310	3214317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9628	NC_014834	GAC	2	6	3214337	3214342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9629	NC_014834	CGCA	2	8	3214348	3214355	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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9631	NC_014834	GCC	2	6	3214482	3214487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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