MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_014834	CAT	2	6	2974357	2974362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_014834	GC	3	6	2974369	2974374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9003	NC_014834	CGG	2	6	2974931	2974936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_014834	GTC	2	6	2975794	2975799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_014834	ATG	2	6	2976080	2976085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_014834	CGG	2	6	2976110	2976115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_014834	GAC	2	6	2976156	2976161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_014834	GC	3	6	2976179	2976184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9009	NC_014834	AGC	2	6	2976202	2976207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_014834	CGG	2	6	2976212	2976217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_014834	GCCG	2	8	2976221	2976228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9012	NC_014834	GGA	2	6	2976244	2976249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_014834	GTC	2	6	2976784	2976789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_014834	T	6	6	2976790	2976795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_014834	CGA	2	6	2976808	2976813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9016	NC_014834	TTCG	2	8	2977013	2977020	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9017	NC_014834	CG	3	6	2977050	2977055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9018	NC_014834	GTT	2	6	2978710	2978715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_014834	CGCC	2	8	2978726	2978733	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9020	NC_014834	TGC	2	6	2978738	2978743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_014834	GGC	2	6	2978744	2978749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_014834	CGG	2	6	2979247	2979252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_014834	GCA	2	6	2979284	2979289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_014834	AATC	2	8	2979291	2979298	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9025	NC_014834	CAG	2	6	2979385	2979390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_014834	CCG	2	6	2980480	2980485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9027	NC_014834	CGG	2	6	2980516	2980521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9028	NC_014834	GATG	2	8	2980525	2980532	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_014834	CGT	2	6	2980562	2980567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_014834	GGC	2	6	2980607	2980612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_014834	CGG	3	9	2981179	2981187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9032	NC_014834	CGA	2	6	2981218	2981223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_014834	GTC	2	6	2982042	2982047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_014834	GCGTGC	2	12	2982083	2982094	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_014834	GCC	2	6	2985317	2985322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9036	NC_014834	GTCG	2	8	2987722	2987729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9037	NC_014834	ACG	2	6	2987753	2987758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_014834	CGGC	2	8	2987833	2987840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9039	NC_014834	GCC	2	6	2987895	2987900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9040	NC_014834	GGC	2	6	2988118	2988123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_014834	AGTG	2	8	2989603	2989610	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_014834	GC	3	6	2989659	2989664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9043	NC_014834	CCT	2	6	2992477	2992482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9044	NC_014834	CGG	2	6	2992491	2992496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_014834	ACC	2	6	2992531	2992536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9046	NC_014834	GC	3	6	2993428	2993433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9047	NC_014834	CAA	2	6	2994072	2994077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_014834	GAC	2	6	2994128	2994133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9049	NC_014834	AC	3	6	2994132	2994137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9050	NC_014834	AGG	2	6	2994169	2994174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_014834	GCG	2	6	2994824	2994829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_014834	GC	3	6	2995618	2995623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9053	NC_014834	GCC	2	6	2995625	2995630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9054	NC_014834	GAC	2	6	2998568	2998573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9055	NC_014834	CG	3	6	2998681	2998686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9056	NC_014834	TGT	2	6	2998696	2998701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_014834	TCAAT	2	10	2999991	3000000	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9058	NC_014834	GAG	2	6	3000010	3000015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_014834	CGA	2	6	3000021	3000026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_014834	GCTTC	2	10	3000060	3000069	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9061	NC_014834	CAA	2	6	3002406	3002411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_014834	CAA	2	6	3002426	3002431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_014834	A	6	6	3002515	3002520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_014834	GCA	2	6	3002548	3002553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9065	NC_014834	CCGCA	2	10	3002557	3002566	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9066	NC_014834	CGAG	2	8	3002578	3002585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9067	NC_014834	A	6	6	3002602	3002607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_014834	AGC	2	6	3003140	3003145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_014834	ATC	2	6	3003207	3003212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9071	NC_014834	CTT	2	6	3003250	3003255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9072	NC_014834	AGAA	2	8	3003259	3003266	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_014834	AAG	2	6	3003379	3003384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_014834	ACA	2	6	3003388	3003393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9075	NC_014834	GA	3	6	3003401	3003406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_014834	AGAA	2	8	3004740	3004747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9077	NC_014834	GAG	2	6	3004758	3004763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9078	NC_014834	CGA	2	6	3004769	3004774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9079	NC_014834	ACTTC	2	10	3004813	3004822	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9080	NC_014834	CCGC	2	8	3005456	3005463	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9081	NC_014834	TGG	2	6	3005938	3005943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9084	NC_014834	CGG	2	6	3007447	3007452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9085	NC_014834	CGG	3	9	3007469	3007477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9087	NC_014834	TCG	2	6	3008768	3008773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9088	NC_014834	CGA	2	6	3010584	3010589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9091	NC_014834	GCG	2	6	3015950	3015955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9092	NC_014834	ATCG	2	8	3016014	3016021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9093	NC_014834	ACG	2	6	3016025	3016030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9096	NC_014834	GCC	2	6	3016147	3016152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9097	NC_014834	GGC	2	6	3016164	3016169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_014834	GTCCGG	2	12	3016173	3016184	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_014834	CCG	2	6	3016215	3016220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9100	NC_014834	TCT	2	6	3016229	3016234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9101	NC_014834	CGGTT	2	10	3016238	3016247	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9102	NC_014834	GCC	2	6	3016252	3016257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9103	NC_014834	GCC	2	6	3016266	3016271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9104	NC_014834	CTC	2	6	3016284	3016289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9105	NC_014834	AC	4	8	3017658	3017665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9106	NC_014834	AG	3	6	3017706	3017711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_014834	GGC	2	6	3017768	3017773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9109	NC_014834	GGC	2	6	3020331	3020336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_014834	GCG	2	6	3020356	3020361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9111	NC_014834	GCC	2	6	3022654	3022659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9112	NC_014834	CCG	2	6	3022692	3022697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9113	NC_014834	CGA	2	6	3023082	3023087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_014834	GCG	2	6	3023151	3023156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_014834	GTC	2	6	3023162	3023167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9116	NC_014834	ATC	2	6	3023178	3023183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_014834	CGG	2	6	3023203	3023208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_014834	CAT	2	6	3024160	3024165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9119	NC_014834	CGAA	2	8	3024191	3024198	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9120	NC_014834	CAA	2	6	3024210	3024215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9121	NC_014834	TCC	2	6	3024216	3024221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9122	NC_014834	GGT	2	6	3028980	3028985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_014834	CAA	2	6	3029026	3029031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9124	NC_014834	GAG	2	6	3029048	3029053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_014834	ATCA	2	8	3029176	3029183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9126	NC_014834	TCG	2	6	3029276	3029281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9127	NC_014834	CGC	2	6	3029286	3029291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9128	NC_014834	GGC	2	6	3029305	3029310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9129	NC_014834	GGC	2	6	3033162	3033167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9130	NC_014834	CGC	2	6	3033188	3033193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9131	NC_014834	CAT	2	6	3035390	3035395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9132	NC_014834	CGCA	2	8	3035452	3035459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9133	NC_014834	CGG	2	6	3036488	3036493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9134	NC_014834	CAA	2	6	3036499	3036504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9135	NC_014834	CCGG	2	8	3036505	3036512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9136	NC_014834	GACA	2	8	3036517	3036524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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9138	NC_014834	CAA	2	6	3038452	3038457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9139	NC_014834	GAC	2	6	3039874	3039879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9140	NC_014834	GCG	2	6	3039901	3039906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9141	NC_014834	CAG	2	6	3039925	3039930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9142	NC_014834	GAA	2	6	3039952	3039957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9143	NC_014834	GC	3	6	3039996	3040001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9144	NC_014834	CGG	2	6	3041554	3041559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9145	NC_014834	TCA	2	6	3041566	3041571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9147	NC_014834	GCA	2	6	3041604	3041609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9149	NC_014834	TCG	2	6	3043603	3043608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9152	NC_014834	CGC	2	6	3044452	3044457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9154	NC_014834	CGG	2	6	3044519	3044524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9161	NC_014834	CGGC	2	8	3047831	3047838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9162	NC_014834	CG	3	6	3047862	3047867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9163	NC_014834	CAT	2	6	3047872	3047877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9165	NC_014834	GGC	2	6	3048476	3048481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9200	NC_014834	GCA	2	6	3052417	3052422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9243	NC_014834	TGAGA	2	10	3065744	3065753	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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9246	NC_014834	GCGG	2	8	3069482	3069489	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9247	NC_014834	ACA	2	6	3069509	3069514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9248	NC_014834	GCA	2	6	3073374	3073379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9251	NC_014834	CCA	2	6	3073461	3073466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9252	NC_014834	ATC	2	6	3075367	3075372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9253	NC_014834	GT	3	6	3075404	3075409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9254	NC_014834	AGCGA	2	10	3075444	3075453	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9255	NC_014834	TCG	2	6	3075488	3075493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9256	NC_014834	CTC	2	6	3075499	3075504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9257	NC_014834	CGG	2	6	3075512	3075517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9258	NC_014834	CCTA	2	8	3077032	3077039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9260	NC_014834	CGC	2	6	3077067	3077072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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