MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014834	GAT	2	6	2794444	2794449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_014834	GGC	2	6	2794485	2794490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_014834	GCG	2	6	2794532	2794537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_014834	GCC	2	6	2794538	2794543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8505	NC_014834	CCG	2	6	2797127	2797132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8506	NC_014834	CTAC	2	8	2798485	2798492	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8507	NC_014834	GACCG	2	10	2799645	2799654	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8508	NC_014834	AGG	2	6	2801586	2801591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_014834	CAT	2	6	2801649	2801654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_014834	CTG	2	6	2801727	2801732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_014834	CGC	2	6	2801738	2801743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8512	NC_014834	CTG	2	6	2802622	2802627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_014834	CG	3	6	2802664	2802669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8514	NC_014834	CG	3	6	2802683	2802688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8515	NC_014834	AGC	2	6	2802715	2802720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8516	NC_014834	CGG	2	6	2802745	2802750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_014834	GAT	2	6	2805456	2805461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_014834	CT	3	6	2805493	2805498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8519	NC_014834	GGA	2	6	2805502	2805507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_014834	TA	3	6	2806929	2806934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_014834	GCG	2	6	2806971	2806976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_014834	GCGA	2	8	2807391	2807398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8523	NC_014834	TCG	2	6	2807438	2807443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_014834	CTC	2	6	2807449	2807454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8525	NC_014834	TGG	2	6	2809234	2809239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_014834	CGAG	2	8	2812972	2812979	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8527	NC_014834	CCG	2	6	2813495	2813500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8528	NC_014834	GCG	2	6	2813616	2813621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_014834	GAT	2	6	2814960	2814965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_014834	TCG	2	6	2814970	2814975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_014834	CG	4	8	2815000	2815007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8532	NC_014834	CAT	2	6	2815012	2815017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_014834	ACAG	2	8	2815030	2815037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8534	NC_014834	GCTA	2	8	2816230	2816237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8535	NC_014834	CAA	2	6	2816242	2816247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8536	NC_014834	AGC	2	6	2816253	2816258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_014834	CGG	2	6	2817137	2817142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_014834	TAA	2	6	2817157	2817162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_014834	GC	3	6	2817785	2817790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8540	NC_014834	GC	3	6	2817839	2817844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8541	NC_014834	GCG	2	6	2819020	2819025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_014834	TCA	2	6	2819125	2819130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8543	NC_014834	CGG	2	6	2819131	2819136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8544	NC_014834	CGC	2	6	2819145	2819150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8545	NC_014834	GGA	2	6	2819171	2819176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_014834	CCG	2	6	2819759	2819764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8547	NC_014834	CG	3	6	2819799	2819804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8548	NC_014834	ACGA	2	8	2820173	2820180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8549	NC_014834	GC	3	6	2820222	2820227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8550	NC_014834	AG	3	6	2820268	2820273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_014834	CTCAT	2	10	2820275	2820284	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8552	NC_014834	GCT	2	6	2821358	2821363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8553	NC_014834	CTGA	2	8	2821370	2821377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8554	NC_014834	AGT	2	6	2822918	2822923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_014834	CT	3	6	2822946	2822951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8556	NC_014834	TC	3	6	2822958	2822963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8557	NC_014834	T	6	6	2822974	2822979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_014834	TTG	2	6	2822983	2822988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_014834	ACA	2	6	2823028	2823033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8560	NC_014834	TTC	2	6	2824896	2824901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_014834	AGCGA	2	10	2824931	2824940	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8562	NC_014834	AGA	2	6	2824956	2824961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_014834	AGT	2	6	2824965	2824970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_014834	CTA	2	6	2826403	2826408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8565	NC_014834	CCG	2	6	2826429	2826434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8566	NC_014834	TTG	2	6	2826443	2826448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_014834	CAT	2	6	2826468	2826473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8568	NC_014834	CGC	2	6	2826504	2826509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8569	NC_014834	ATC	2	6	2826534	2826539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_014834	GGC	2	6	2826601	2826606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_014834	ACG	2	6	2826635	2826640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_014834	CGA	2	6	2826657	2826662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_014834	GCC	2	6	2826663	2826668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8574	NC_014834	C	6	6	2826699	2826704	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8575	NC_014834	GCG	2	6	2826742	2826747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_014834	CAG	2	6	2826770	2826775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8577	NC_014834	CGA	2	6	2826804	2826809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8578	NC_014834	CCAA	2	8	2826826	2826833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8579	NC_014834	CCG	2	6	2826894	2826899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8580	NC_014834	AGAGG	2	10	2826943	2826952	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_014834	GT	3	6	2826959	2826964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_014834	TGGA	2	8	2826965	2826972	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_014834	CGG	2	6	2826977	2826982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8584	NC_014834	GCGA	2	8	2827880	2827887	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8585	NC_014834	AGGGC	2	10	2827913	2827922	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8586	NC_014834	CCG	2	6	2827943	2827948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8587	NC_014834	GCG	2	6	2827953	2827958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8588	NC_014834	GAT	2	6	2828806	2828811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_014834	GC	3	6	2828877	2828882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8590	NC_014834	CTG	2	6	2828893	2828898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8591	NC_014834	TGC	2	6	2829318	2829323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8592	NC_014834	TCG	2	6	2830442	2830447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8593	NC_014834	CGG	2	6	2830448	2830453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8594	NC_014834	CG	3	6	2830455	2830460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8595	NC_014834	GCC	2	6	2830481	2830486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8596	NC_014834	GCGCC	2	10	2830491	2830500	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8597	NC_014834	AG	3	6	2830515	2830520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_014834	GTC	2	6	2830521	2830526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8599	NC_014834	GCA	2	6	2831355	2831360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_014834	CGC	2	6	2831361	2831366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8601	NC_014834	GC	3	6	2833496	2833501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8602	NC_014834	GGAACC	2	12	2833565	2833576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_014834	GCC	2	6	2833651	2833656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8604	NC_014834	CGC	2	6	2834016	2834021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8605	NC_014834	CAA	2	6	2834064	2834069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_014834	CCGCA	2	10	2834082	2834091	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8607	NC_014834	CG	4	8	2834114	2834121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8608	NC_014834	GTCG	2	8	2834123	2834130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8609	NC_014834	CGG	2	6	2838918	2838923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8610	NC_014834	GC	4	8	2838941	2838948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8611	NC_014834	GAA	2	6	2840820	2840825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_014834	GAT	2	6	2842129	2842134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_014834	GC	3	6	2842241	2842246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8614	NC_014834	CGC	2	6	2842555	2842560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8615	NC_014834	CGC	2	6	2842588	2842593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8616	NC_014834	ATC	2	6	2842597	2842602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8617	NC_014834	GC	3	6	2842633	2842638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8618	NC_014834	CTG	2	6	2844081	2844086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_014834	GGC	2	6	2844159	2844164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_014834	TCT	2	6	2847314	2847319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8621	NC_014834	TCG	2	6	2848883	2848888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8622	NC_014834	CTG	2	6	2848909	2848914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8623	NC_014834	GGC	2	6	2850583	2850588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8624	NC_014834	TCC	2	6	2850620	2850625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8625	NC_014834	CGA	2	6	2850684	2850689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_014834	TCA	2	6	2850704	2850709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8627	NC_014834	TC	3	6	2850710	2850715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8628	NC_014834	TTG	2	6	2850766	2850771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_014834	TTG	2	6	2850783	2850788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_014834	GGC	2	6	2851404	2851409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8634	NC_014834	GAT	2	6	2852670	2852675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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