MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014834	GAG	2	6	2600986	2600991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_014834	CCT	2	6	2601067	2601072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_014834	CGT	2	6	2602350	2602355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_014834	TCG	2	6	2604506	2604511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_014834	CGC	3	9	2604517	2604525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8006	NC_014834	GAG	2	6	2604531	2604536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_014834	GTC	3	9	2606934	2606942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_014834	CAC	2	6	2606948	2606953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_014834	GC	3	6	2606967	2606972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8010	NC_014834	GGGC	2	8	2606973	2606980	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8011	NC_014834	ACC	2	6	2606982	2606987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8012	NC_014834	TGAT	2	8	2607032	2607039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_014834	ATTCT	2	10	2607099	2607108	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8014	NC_014834	GCG	2	6	2607131	2607136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_014834	GTTTTG	2	12	2607139	2607150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_014834	TCG	2	6	2607161	2607166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_014834	CGG	2	6	2607189	2607194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_014834	GGA	2	6	2611971	2611976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_014834	CCGT	2	8	2612186	2612193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8020	NC_014834	ACCGT	2	10	2612195	2612204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8021	NC_014834	CGA	2	6	2612245	2612250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_014834	AGGC	2	8	2612251	2612258	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8023	NC_014834	GC	3	6	2612285	2612290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8024	NC_014834	G	6	6	2612301	2612306	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_014834	CGG	2	6	2612341	2612346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_014834	CTCGTC	2	12	2612407	2612418	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8027	NC_014834	TG	4	8	2612446	2612453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_014834	GTC	3	9	2612514	2612522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_014834	GCG	2	6	2612523	2612528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_014834	CGA	2	6	2612534	2612539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_014834	AAAC	2	8	2614294	2614301	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8032	NC_014834	CCCG	2	8	2614352	2614359	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8033	NC_014834	C	6	6	2616077	2616082	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8034	NC_014834	ACG	2	6	2616113	2616118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_014834	CG	3	6	2616164	2616169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8036	NC_014834	CCA	2	6	2616213	2616218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_014834	GCC	2	6	2616238	2616243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8038	NC_014834	CG	3	6	2616249	2616254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8039	NC_014834	GCG	2	6	2616296	2616301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_014834	GC	3	6	2616309	2616314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_014834	CAA	2	6	2616340	2616345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_014834	CG	3	6	2616347	2616352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8043	NC_014834	CTC	2	6	2616358	2616363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8044	NC_014834	GCA	2	6	2616458	2616463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_014834	CGG	2	6	2616499	2616504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_014834	GCC	3	9	2616621	2616629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8047	NC_014834	GCG	2	6	2616631	2616636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_014834	CTC	2	6	2616648	2616653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8049	NC_014834	GGA	2	6	2618262	2618267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_014834	ATC	2	6	2618269	2618274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_014834	ACTG	2	8	2619680	2619687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8052	NC_014834	GATC	2	8	2623117	2623124	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8053	NC_014834	GC	3	6	2623179	2623184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8054	NC_014834	T	6	6	2623430	2623435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_014834	CGA	2	6	2623476	2623481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_014834	CAA	2	6	2623493	2623498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_014834	AAT	2	6	2623502	2623507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_014834	CGT	2	6	2623515	2623520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_014834	CCGA	2	8	2624447	2624454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8060	NC_014834	CAA	2	6	2624487	2624492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_014834	GCA	2	6	2624518	2624523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_014834	TGAT	2	8	2624568	2624575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_014834	TCG	2	6	2624584	2624589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_014834	CGT	3	9	2624596	2624604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_014834	GA	3	6	2624613	2624618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_014834	GC	4	8	2625904	2625911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8067	NC_014834	ACC	2	6	2630333	2630338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8068	NC_014834	GGA	2	6	2635566	2635571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_014834	CGG	2	6	2637186	2637191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_014834	AG	3	6	2637249	2637254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_014834	ACGG	2	8	2637257	2637264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8072	NC_014834	GACA	2	8	2637284	2637291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8073	NC_014834	CGC	2	6	2637315	2637320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8074	NC_014834	GA	3	6	2637343	2637348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_014834	GTG	2	6	2639075	2639080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_014834	TGA	2	6	2639124	2639129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_014834	TGCG	2	8	2639144	2639151	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8078	NC_014834	CTT	2	6	2639185	2639190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_014834	GCG	2	6	2639230	2639235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_014834	GC	3	6	2639238	2639243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8081	NC_014834	CGT	2	6	2639244	2639249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_014834	GAC	2	6	2639291	2639296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_014834	CCGC	2	8	2640109	2640116	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8084	NC_014834	GCT	2	6	2640191	2640196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_014834	CAG	2	6	2640199	2640204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_014834	CAT	2	6	2640205	2640210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8088	NC_014834	CTG	2	6	2640260	2640265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_014834	GGA	2	6	2640268	2640273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_014834	CG	3	6	2640303	2640308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8091	NC_014834	AGC	2	6	2640339	2640344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_014834	TCG	2	6	2640372	2640377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_014834	CGC	2	6	2640418	2640423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8094	NC_014834	GGC	2	6	2643337	2643342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_014834	GGC	2	6	2644223	2644228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_014834	CCG	2	6	2644306	2644311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_014834	ACA	2	6	2644342	2644347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_014834	GCGCCG	2	12	2644738	2644749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8099	NC_014834	TCG	2	6	2644754	2644759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_014834	AG	3	6	2644777	2644782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_014834	GC	3	6	2644814	2644819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8102	NC_014834	TCGCT	2	10	2644917	2644926	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8103	NC_014834	GT	3	6	2644970	2644975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_014834	GCG	2	6	2646234	2646239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_014834	CGG	2	6	2646243	2646248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_014834	CGCT	2	8	2646288	2646295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8107	NC_014834	ATG	2	6	2646379	2646384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_014834	CA	4	8	2646398	2646405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8109	NC_014834	ACC	2	6	2646408	2646413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8110	NC_014834	GCA	2	6	2646449	2646454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_014834	TCGC	2	8	2646469	2646476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8112	NC_014834	GCC	2	6	2647312	2647317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8113	NC_014834	GAC	2	6	2647451	2647456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_014834	CTTGC	2	10	2647467	2647476	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8115	NC_014834	GCC	2	6	2647478	2647483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8116	NC_014834	GTCG	2	8	2647484	2647491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8117	NC_014834	GCC	2	6	2647504	2647509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8118	NC_014834	GCA	2	6	2647580	2647585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8120	NC_014834	CGT	2	6	2647672	2647677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_014834	AAGC	2	8	2647746	2647753	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8122	NC_014834	CGG	3	9	2647910	2647918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_014834	GTGC	2	8	2647926	2647933	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8124	NC_014834	CG	3	6	2647938	2647943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8125	NC_014834	CTG	2	6	2647951	2647956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_014834	GAAGC	2	10	2648013	2648022	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8127	NC_014834	CAG	2	6	2648126	2648131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_014834	CG	3	6	2648152	2648157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8129	NC_014834	CGC	2	6	2648185	2648190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8130	NC_014834	AT	3	6	2648422	2648427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_014834	GCG	2	6	2649791	2649796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8133	NC_014834	CGG	2	6	2649853	2649858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8135	NC_014834	TG	3	6	2650806	2650811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8248	NC_014834	CGT	2	6	2686626	2686631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8250	NC_014834	CGCT	2	8	2686645	2686652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8251	NC_014834	CG	3	6	2688012	2688017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8252	NC_014834	GGCGG	2	10	2688063	2688072	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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8255	NC_014834	CTG	2	6	2688536	2688541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8257	NC_014834	CGT	2	6	2688605	2688610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8258	NC_014834	ATT	2	6	2688629	2688634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8259	NC_014834	TC	3	6	2688840	2688845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8260	NC_014834	CAT	2	6	2688850	2688855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8261	NC_014834	GGCCC	2	10	2693592	2693601	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8262	NC_014834	GGT	2	6	2693616	2693621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8263	NC_014834	CGGC	2	8	2693658	2693665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8264	NC_014834	CGG	2	6	2693816	2693821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8265	NC_014834	CGT	2	6	2694743	2694748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8273	NC_014834	GCCG	2	8	2695881	2695888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8274	NC_014834	GC	3	6	2695914	2695919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8283	NC_014834	ATG	2	6	2699179	2699184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8303	NC_014834	TA	3	6	2703190	2703195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8380	NC_014834	AGTC	2	8	2750659	2750666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8381	NC_014834	GTTGG	2	10	2750678	2750687	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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8387	NC_014834	TTG	2	6	2750854	2750859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8392	NC_014834	GC	3	6	2751044	2751049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8393	NC_014834	AGG	2	6	2751070	2751075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8394	NC_014834	CCG	2	6	2751514	2751519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8398	NC_014834	GGGC	2	8	2754296	2754303	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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