MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_014834	CGTG	2	8	2427221	2427228	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7502	NC_014834	CAG	2	6	2427236	2427241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7503	NC_014834	GTG	2	6	2428005	2428010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_014834	AGTC	2	8	2428040	2428047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7505	NC_014834	TCA	2	6	2428315	2428320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_014834	TTGTT	2	10	2428321	2428330	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_014834	CAC	2	6	2428458	2428463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7508	NC_014834	TGC	2	6	2428479	2428484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7509	NC_014834	GAC	2	6	2428510	2428515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_014834	CCA	2	6	2429495	2429500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7511	NC_014834	AGGGG	2	10	2429527	2429536	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_014834	CGAC	2	8	2430889	2430896	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7513	NC_014834	ACG	2	6	2430907	2430912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_014834	GCT	2	6	2430956	2430961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_014834	CGGC	2	8	2430999	2431006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7516	NC_014834	CGC	2	6	2431899	2431904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7517	NC_014834	GGC	2	6	2433490	2433495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7518	NC_014834	GCT	2	6	2433504	2433509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7519	NC_014834	TCG	2	6	2433533	2433538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7520	NC_014834	TAC	2	6	2433575	2433580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_014834	CGC	2	6	2434461	2434466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7522	NC_014834	CCT	2	6	2434473	2434478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7523	NC_014834	GC	3	6	2435650	2435655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7524	NC_014834	GATT	2	8	2435692	2435699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_014834	CGAT	2	8	2435702	2435709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7526	NC_014834	ATTC	2	8	2436410	2436417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7527	NC_014834	CGT	2	6	2436427	2436432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_014834	GCCA	2	8	2436482	2436489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7529	NC_014834	CCT	2	6	2436513	2436518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7530	NC_014834	GC	3	6	2436531	2436536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7531	NC_014834	G	6	6	2436544	2436549	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_014834	CG	3	6	2436804	2436809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7533	NC_014834	ATC	3	9	2436844	2436852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_014834	CTC	2	6	2436863	2436868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7535	NC_014834	CG	3	6	2436933	2436938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7536	NC_014834	GCT	2	6	2437121	2437126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_014834	TTC	2	6	2437149	2437154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7538	NC_014834	GCG	3	9	2438192	2438200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_014834	CGGC	2	8	2438202	2438209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7540	NC_014834	CCG	3	9	2438655	2438663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7541	NC_014834	CGT	2	6	2438664	2438669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7542	NC_014834	GGC	2	6	2439578	2439583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_014834	CGAC	2	8	2439635	2439642	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7544	NC_014834	CGG	2	6	2439643	2439648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7545	NC_014834	CGG	2	6	2439664	2439669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7546	NC_014834	TCA	2	6	2439690	2439695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_014834	TCG	2	6	2439749	2439754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7548	NC_014834	TGG	2	6	2440743	2440748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_014834	CTT	2	6	2440790	2440795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_014834	CCG	2	6	2440821	2440826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7551	NC_014834	ATG	2	6	2440833	2440838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_014834	CG	3	6	2440841	2440846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7553	NC_014834	GATG	2	8	2440975	2440982	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_014834	GCAAC	2	10	2443406	2443415	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7555	NC_014834	CGCC	2	8	2443466	2443473	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7556	NC_014834	ATCA	2	8	2443507	2443514	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7557	NC_014834	TCG	2	6	2443528	2443533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7558	NC_014834	CCGC	2	8	2443540	2443547	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7559	NC_014834	GCG	3	9	2443639	2443647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7560	NC_014834	TCA	2	6	2445400	2445405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_014834	GCA	2	6	2445653	2445658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7562	NC_014834	CGG	2	6	2445667	2445672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7563	NC_014834	CCG	2	6	2445673	2445678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7564	NC_014834	GC	4	8	2445748	2445755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7565	NC_014834	GGC	2	6	2447216	2447221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7566	NC_014834	GGA	2	6	2447244	2447249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_014834	CTG	2	6	2447302	2447307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7568	NC_014834	CGC	2	6	2447368	2447373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7569	NC_014834	CCCG	2	8	2447432	2447439	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7570	NC_014834	GCA	2	6	2447466	2447471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7571	NC_014834	CCG	2	6	2447502	2447507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7572	NC_014834	CGT	2	6	2447511	2447516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7573	NC_014834	CGT	2	6	2447538	2447543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7574	NC_014834	CGG	2	6	2448064	2448069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_014834	CTTG	2	8	2448081	2448088	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7576	NC_014834	GGAC	2	8	2448091	2448098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7577	NC_014834	GTT	3	9	2448150	2448158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_014834	GCG	2	6	2448172	2448177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7579	NC_014834	GCGA	2	8	2450630	2450637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7580	NC_014834	TCG	2	6	2450647	2450652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7581	NC_014834	GGGC	2	8	2452535	2452542	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7582	NC_014834	CG	3	6	2452559	2452564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7583	NC_014834	GGT	2	6	2452588	2452593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_014834	GCG	2	6	2452610	2452615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7585	NC_014834	GC	3	6	2452656	2452661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7586	NC_014834	GCGAC	2	10	2452721	2452730	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7587	NC_014834	TCG	2	6	2452735	2452740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7588	NC_014834	CGT	2	6	2452749	2452754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7589	NC_014834	CGG	2	6	2452763	2452768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7590	NC_014834	GGCC	2	8	2452778	2452785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7591	NC_014834	GCC	2	6	2452788	2452793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7592	NC_014834	CTT	3	9	2452800	2452808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7593	NC_014834	TTGC	2	8	2452827	2452834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7594	NC_014834	GTC	3	9	2452843	2452851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7595	NC_014834	GC	3	6	2452989	2452994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7596	NC_014834	GAGT	2	8	2453976	2453983	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7598	NC_014834	GCG	2	6	2454080	2454085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7599	NC_014834	GAG	2	6	2454092	2454097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_014834	CGG	2	6	2454102	2454107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7601	NC_014834	GATC	2	8	2454116	2454123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7602	NC_014834	CGCC	2	8	2454141	2454148	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7603	NC_014834	CAG	2	6	2455059	2455064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7604	NC_014834	CCCG	2	8	2455104	2455111	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7605	NC_014834	GCC	2	6	2455118	2455123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7606	NC_014834	AACCG	2	10	2456231	2456240	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7607	NC_014834	GCG	2	6	2456753	2456758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7608	NC_014834	CGG	2	6	2457910	2457915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7609	NC_014834	CGT	2	6	2457924	2457929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7610	NC_014834	CAGG	2	8	2457980	2457987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7611	NC_014834	GGC	2	6	2458451	2458456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7612	NC_014834	GTC	2	6	2458463	2458468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7613	NC_014834	CAA	2	6	2459735	2459740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7614	NC_014834	GCC	2	6	2461080	2461085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7615	NC_014834	GCC	2	6	2461267	2461272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7616	NC_014834	GAC	2	6	2461302	2461307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7617	NC_014834	GAG	2	6	2462199	2462204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7620	NC_014834	GC	4	8	2462297	2462304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7621	NC_014834	GCC	2	6	2464017	2464022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7622	NC_014834	AGT	2	6	2464043	2464048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_014834	TGT	2	6	2465820	2465825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_014834	CGG	3	9	2466531	2466539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7625	NC_014834	GTC	2	6	2466579	2466584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7626	NC_014834	CGC	2	6	2466611	2466616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7627	NC_014834	ATC	2	6	2466706	2466711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7628	NC_014834	GGAA	2	8	2466745	2466752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7630	NC_014834	CG	3	6	2467059	2467064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7883	NC_014834	TAC	2	6	2552274	2552279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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