MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014834	CGT	2	6	2153099	2153104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_014834	GAC	2	6	2156874	2156879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_014834	ACG	2	6	2156930	2156935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_014834	CAA	2	6	2156944	2156949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_014834	CAA	2	6	2156977	2156982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_014834	ATGT	2	8	2157043	2157050	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_014834	AGG	2	6	2157065	2157070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_014834	GGC	2	6	2159031	2159036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_014834	CGG	2	6	2159799	2159804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_014834	GAC	2	6	2159821	2159826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_014834	GAA	2	6	2159887	2159892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_014834	TCG	2	6	2161182	2161187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_014834	GC	3	6	2161188	2161193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6514	NC_014834	AGCA	2	8	2161219	2161226	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6515	NC_014834	GCT	2	6	2161261	2161266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_014834	GGA	2	6	2161268	2161273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_014834	GTC	2	6	2161314	2161319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_014834	CAC	2	6	2161358	2161363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_014834	GC	3	6	2161405	2161410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6520	NC_014834	TTG	2	6	2161459	2161464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_014834	GA	3	6	2161500	2161505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_014834	CGT	2	6	2161512	2161517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_014834	AGC	2	6	2161524	2161529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_014834	GAG	2	6	2161567	2161572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_014834	TCCG	2	8	2162742	2162749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6526	NC_014834	TG	3	6	2162769	2162774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_014834	GAT	2	6	2162801	2162806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_014834	C	6	6	2162814	2162819	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6529	NC_014834	CGG	2	6	2162826	2162831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_014834	TGG	2	6	2162852	2162857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_014834	CGAC	2	8	2164379	2164386	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6532	NC_014834	GGC	2	6	2166522	2166527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_014834	ACGCGG	2	12	2166646	2166657	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_014834	ACG	2	6	2166693	2166698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_014834	TAGCC	2	10	2166727	2166736	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6536	NC_014834	CGG	2	6	2166780	2166785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_014834	GCG	2	6	2166794	2166799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_014834	G	6	6	2166801	2166806	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_014834	TTCGG	2	10	2166879	2166888	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6540	NC_014834	GGC	2	6	2166917	2166922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_014834	TGTCT	2	10	2172286	2172295	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6542	NC_014834	CCG	2	6	2172356	2172361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6543	NC_014834	GAT	2	6	2173537	2173542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_014834	ATC	2	6	2173649	2173654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_014834	TCG	2	6	2173721	2173726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_014834	GGC	2	6	2173737	2173742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_014834	AAG	2	6	2173795	2173800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_014834	TCA	2	6	2173827	2173832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_014834	GGC	3	9	2173851	2173859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_014834	CGC	2	6	2173879	2173884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6551	NC_014834	GGA	2	6	2173896	2173901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_014834	GGGTAG	2	12	2174014	2174025	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_014834	TGT	2	6	2186340	2186345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_014834	CCG	2	6	2188273	2188278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6555	NC_014834	GCC	2	6	2188341	2188346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6556	NC_014834	CGGC	2	8	2188350	2188357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6557	NC_014834	GTT	2	6	2188408	2188413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_014834	G	9	9	2188711	2188719	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_014834	GAT	2	6	2189215	2189220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_014834	GA	3	6	2189222	2189227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_014834	GTC	2	6	2189228	2189233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_014834	G	6	6	2189686	2189691	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_014834	GC	3	6	2189764	2189769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_014834	TCG	2	6	2189815	2189820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_014834	CGC	3	9	2190758	2190766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6566	NC_014834	C	6	6	2190766	2190771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6567	NC_014834	AACT	2	8	2190776	2190783	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6568	NC_014834	ACAA	2	8	2191117	2191124	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6569	NC_014834	GCTC	2	8	2191938	2191945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6570	NC_014834	GAC	2	6	2191954	2191959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_014834	CAG	3	9	2191971	2191979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_014834	GGC	2	6	2192000	2192005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_014834	CGT	2	6	2192104	2192109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_014834	TCGC	2	8	2192148	2192155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6575	NC_014834	AAC	2	6	2192187	2192192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6576	NC_014834	AATT	2	8	2192218	2192225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_014834	CGGC	2	8	2192232	2192239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6578	NC_014834	CGG	2	6	2192312	2192317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_014834	GTC	2	6	2192397	2192402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_014834	GCG	2	6	2192541	2192546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_014834	GTC	2	6	2192550	2192555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_014834	CGC	2	6	2194390	2194395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6583	NC_014834	G	6	6	2194448	2194453	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_014834	GAA	2	6	2194468	2194473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_014834	CTA	2	6	2194518	2194523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_014834	CGT	2	6	2194546	2194551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_014834	GGAT	2	8	2194556	2194563	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_014834	GCT	2	6	2194622	2194627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_014834	ACT	2	6	2194644	2194649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_014834	AGG	2	6	2194698	2194703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_014834	GC	3	6	2195144	2195149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6592	NC_014834	TGC	2	6	2195206	2195211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_014834	GGTC	2	8	2195391	2195398	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6594	NC_014834	GGCG	2	8	2195416	2195423	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6595	NC_014834	GC	3	6	2195470	2195475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6596	NC_014834	CGA	2	6	2195479	2195484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_014834	CGG	2	6	2195513	2195518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_014834	AAT	2	6	2196021	2196026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_014834	GC	3	6	2196083	2196088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6600	NC_014834	GTC	2	6	2196116	2196121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_014834	CTCGG	2	10	2196187	2196196	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6602	NC_014834	GCG	2	6	2196230	2196235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_014834	AGCG	2	8	2196254	2196261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6604	NC_014834	CCGG	2	8	2196293	2196300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_014834	CGT	2	6	2196370	2196375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_014834	GTT	2	6	2196377	2196382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_014834	GCC	2	6	2196388	2196393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6608	NC_014834	CG	3	6	2196888	2196893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6609	NC_014834	CCA	2	6	2197071	2197076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6610	NC_014834	CGTT	2	8	2197084	2197091	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6611	NC_014834	GGT	2	6	2197109	2197114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_014834	TG	3	6	2197115	2197120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_014834	CGCT	2	8	2197190	2197197	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6614	NC_014834	AGGGC	2	10	2197234	2197243	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6615	NC_014834	GC	3	6	2197242	2197247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6616	NC_014834	AACA	2	8	2197282	2197289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6617	NC_014834	GCA	2	6	2197335	2197340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_014834	GGC	2	6	2197355	2197360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_014834	GGC	2	6	2197384	2197389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_014834	CAT	2	6	2197521	2197526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6621	NC_014834	CGG	2	6	2197545	2197550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_014834	GTG	2	6	2197568	2197573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_014834	ACG	2	6	2198438	2198443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_014834	GGCCG	2	10	2198458	2198467	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6625	NC_014834	CGG	2	6	2198543	2198548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6626	NC_014834	AT	3	6	2198593	2198598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_014834	CAGTT	2	10	2198674	2198683	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6628	NC_014834	CGT	2	6	2200652	2200657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6629	NC_014834	CGA	2	6	2200736	2200741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6630	NC_014834	GGAT	2	8	2200746	2200753	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_014834	CGGC	2	8	2202262	2202269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6632	NC_014834	CG	3	6	2202272	2202277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6633	NC_014834	TG	3	6	2202312	2202317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6634	NC_014834	CCG	2	6	2202324	2202329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6635	NC_014834	CGA	2	6	2203840	2203845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6638	NC_014834	TG	3	6	2203940	2203945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6663	NC_014834	CGA	2	6	2207704	2207709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6673	NC_014834	CG	3	6	2212355	2212360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6674	NC_014834	GCGG	2	8	2212366	2212373	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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6728	NC_014834	CCCG	2	8	2219033	2219040	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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6730	NC_014834	CCA	2	6	2219133	2219138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6758	NC_014834	GCT	2	6	2223578	2223583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6891	NC_014834	ACC	2	6	2245480	2245485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6892	NC_014834	GAT	2	6	2245527	2245532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6893	NC_014834	GTC	2	6	2245557	2245562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6894	NC_014834	TTGTC	2	10	2245564	2245573	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6895	NC_014834	ATG	2	6	2247894	2247899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6896	NC_014834	CGCGG	2	10	2248095	2248104	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6897	NC_014834	CGC	2	6	2248139	2248144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6899	NC_014834	GGC	2	6	2248256	2248261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6900	NC_014834	CG	4	8	2248276	2248283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6901	NC_014834	GC	3	6	2248290	2248295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6903	NC_014834	GGT	2	6	2248398	2248403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6952	NC_014834	GAGCG	2	10	2253157	2253166	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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6979	NC_014834	GCG	2	6	2256249	2256254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6984	NC_014834	G	7	7	2256389	2256395	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6985	NC_014834	CCG	2	6	2256466	2256471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6986	NC_014834	G	6	6	2256478	2256483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6987	NC_014834	CCG	2	6	2256515	2256520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6989	NC_014834	AAGG	2	8	2265839	2265846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6990	NC_014834	AC	3	6	2265851	2265856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6991	NC_014834	AT	3	6	2265858	2265863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6992	NC_014834	GCG	2	6	2265877	2265882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6993	NC_014834	CGTG	2	8	2265894	2265901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6996	NC_014834	CCT	2	6	2265944	2265949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6999	NC_014834	CAT	2	6	2269370	2269375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7000	NC_014834	ACT	2	6	2269447	2269452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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