MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014834	ACGA	2	8	2075543	2075550	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6002	NC_014834	CGG	2	6	2075569	2075574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_014834	CT	3	6	2075597	2075602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_014834	TC	3	6	2076350	2076355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_014834	GAGC	2	8	2076370	2076377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_014834	CTC	2	6	2077346	2077351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_014834	GCG	2	6	2077369	2077374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_014834	CCG	2	6	2077391	2077396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_014834	GCGCG	2	10	2077411	2077420	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6010	NC_014834	GGCC	2	8	2077952	2077959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6011	NC_014834	TCA	2	6	2077969	2077974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_014834	CA	3	6	2078007	2078012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6013	NC_014834	GCG	2	6	2078429	2078434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_014834	CGCGCT	2	12	2078435	2078446	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_014834	GCC	2	6	2078470	2078475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_014834	GTG	2	6	2080057	2080062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_014834	CTT	2	6	2080074	2080079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_014834	TGA	2	6	2080103	2080108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_014834	CAC	2	6	2080111	2080116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_014834	TCT	2	6	2080118	2080123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_014834	GCC	2	6	2081301	2081306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_014834	TC	3	6	2081320	2081325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_014834	ACG	2	6	2081335	2081340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_014834	GAC	2	6	2081413	2081418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_014834	CAT	2	6	2081440	2081445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_014834	ACG	2	6	2081448	2081453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_014834	GCC	2	6	2082218	2082223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_014834	TTCC	2	8	2082259	2082266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6029	NC_014834	GCA	2	6	2082269	2082274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_014834	GGCTG	2	10	2082311	2082320	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6031	NC_014834	GCG	2	6	2082398	2082403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_014834	GA	3	6	2082437	2082442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_014834	TCGA	2	8	2083302	2083309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6034	NC_014834	GCC	2	6	2083321	2083326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_014834	CGA	2	6	2083348	2083353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_014834	CG	3	6	2083400	2083405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_014834	GGC	2	6	2084371	2084376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_014834	CGA	2	6	2084384	2084389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_014834	GAC	2	6	2084402	2084407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_014834	CGC	2	6	2084460	2084465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_014834	TTC	2	6	2084497	2084502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_014834	CG	3	6	2084506	2084511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_014834	GGC	2	6	2084536	2084541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_014834	GCC	2	6	2084588	2084593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_014834	CGT	2	6	2084943	2084948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_014834	CGG	2	6	2085537	2085542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_014834	GCG	2	6	2085976	2085981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_014834	GCG	2	6	2085987	2085992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_014834	CCA	2	6	2086006	2086011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_014834	GGA	2	6	2086045	2086050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_014834	GCG	2	6	2086066	2086071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_014834	CGG	2	6	2086090	2086095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_014834	GCCC	2	8	2087694	2087701	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6054	NC_014834	GAC	2	6	2087749	2087754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_014834	C	6	6	2087765	2087770	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6056	NC_014834	TCGG	2	8	2087932	2087939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_014834	CGA	2	6	2088004	2088009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_014834	ACAA	2	8	2088113	2088120	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6059	NC_014834	GAT	2	6	2088137	2088142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_014834	GCC	2	6	2088752	2088757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_014834	CGC	2	6	2088762	2088767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_014834	GCC	2	6	2088866	2088871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_014834	CCG	2	6	2088960	2088965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_014834	CGG	2	6	2088994	2088999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_014834	CAA	2	6	2089137	2089142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_014834	GCC	2	6	2089150	2089155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_014834	ATG	2	6	2089238	2089243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_014834	TGA	2	6	2089280	2089285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_014834	GTC	2	6	2089509	2089514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_014834	TGCT	2	8	2089905	2089912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6071	NC_014834	CGC	2	6	2089914	2089919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_014834	GCA	2	6	2089943	2089948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_014834	CGC	2	6	2089952	2089957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_014834	GCA	2	6	2090024	2090029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_014834	AGG	2	6	2090145	2090150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_014834	GGC	2	6	2090514	2090519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_014834	CGC	2	6	2090664	2090669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_014834	GAT	2	6	2090721	2090726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_014834	TC	3	6	2090729	2090734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6080	NC_014834	GCC	2	6	2090975	2090980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_014834	CG	3	6	2091019	2091024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6082	NC_014834	GA	4	8	2091066	2091073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_014834	CAA	2	6	2091170	2091175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_014834	CTT	2	6	2091184	2091189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_014834	TGT	2	6	2091290	2091295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_014834	TGG	2	6	2091298	2091303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_014834	TTG	2	6	2091940	2091945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_014834	CAT	2	6	2091950	2091955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_014834	CG	3	6	2092122	2092127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_014834	GC	3	6	2092146	2092151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_014834	GTG	2	6	2092208	2092213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_014834	GCG	2	6	2092221	2092226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_014834	GGC	2	6	2092230	2092235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_014834	CGT	3	9	2092247	2092255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_014834	GCC	2	6	2092970	2092975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_014834	CGG	2	6	2093013	2093018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_014834	CTGC	2	8	2093020	2093027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_014834	AAC	2	6	2093034	2093039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_014834	CG	3	6	2093045	2093050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_014834	GCG	3	9	2093048	2093056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_014834	TCG	2	6	2093064	2093069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_014834	GCC	2	6	2093073	2093078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6103	NC_014834	CGC	2	6	2093091	2093096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_014834	GCG	2	6	2093163	2093168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_014834	CGG	2	6	2093207	2093212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_014834	GAC	2	6	2094536	2094541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_014834	GTC	2	6	2094553	2094558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_014834	TGT	2	6	2094618	2094623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_014834	CG	3	6	2094656	2094661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_014834	GCG	2	6	2094666	2094671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_014834	CGT	2	6	2094687	2094692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_014834	GC	3	6	2094717	2094722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_014834	CCG	2	6	2094730	2094735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_014834	GGC	2	6	2094743	2094748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_014834	TGG	2	6	2094782	2094787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_014834	TGCGA	2	10	2094838	2094847	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6117	NC_014834	CGGCAC	2	12	2094849	2094860	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_014834	CCCT	2	8	2094886	2094893	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6119	NC_014834	GC	3	6	2094931	2094936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_014834	GGGC	2	8	2095002	2095009	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6121	NC_014834	GTC	2	6	2095083	2095088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_014834	GTT	2	6	2095871	2095876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_014834	GCT	3	9	2096016	2096024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_014834	GCC	2	6	2096052	2096057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_014834	GGC	2	6	2096069	2096074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_014834	TCG	2	6	2097190	2097195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_014834	ACG	2	6	2097198	2097203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_014834	GTCCC	2	10	2097271	2097280	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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6130	NC_014834	CG	4	8	2097407	2097414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6394	NC_014834	CGA	2	6	2142125	2142130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6395	NC_014834	CCG	2	6	2142152	2142157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6396	NC_014834	CTT	2	6	2142194	2142199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6397	NC_014834	TCG	2	6	2142207	2142212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6398	NC_014834	ATCG	2	8	2142266	2142273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6399	NC_014834	GGCCT	2	10	2142288	2142297	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6400	NC_014834	CGC	2	6	2142342	2142347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6401	NC_014834	CTT	2	6	2142364	2142369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6402	NC_014834	CGC	2	6	2142417	2142422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6403	NC_014834	CGG	2	6	2142438	2142443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6412	NC_014834	CCG	2	6	2142754	2142759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6432	NC_014834	GCCC	2	8	2145318	2145325	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6433	NC_014834	TGCC	2	8	2145357	2145364	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6455	NC_014834	G	6	6	2146545	2146550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6472	NC_014834	TCG	2	6	2147610	2147615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6483	NC_014834	AGCC	2	8	2151413	2151420	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6489	NC_014834	CGA	2	6	2151714	2151719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6497	NC_014834	CG	3	6	2152903	2152908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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