MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 chromosome

Total Repeats: 13210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014833	A	6	6	3655573	3655578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_014833	TAT	2	6	3655604	3655609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_014833	AGC	2	6	3655622	3655627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_014833	TAT	2	6	3655629	3655634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_014833	GT	3	6	3655647	3655652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_014833	CAT	2	6	3658436	3658441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_014833	AGAC	2	8	3658493	3658500	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13008	NC_014833	AAGA	2	8	3658541	3658548	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_014833	TAG	2	6	3659179	3659184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_014833	GTTTT	2	10	3659225	3659234	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_014833	AG	3	6	3659259	3659264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_014833	GT	3	6	3659311	3659316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_014833	GGT	2	6	3659364	3659369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_014833	TTA	2	6	3659388	3659393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_014833	CCT	2	6	3659662	3659667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13016	NC_014833	TAAA	2	8	3661185	3661192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_014833	ATA	2	6	3661200	3661205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_014833	T	6	6	3661247	3661252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_014833	AT	3	6	3661264	3661269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_014833	AAAC	2	8	3661280	3661287	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13021	NC_014833	AC	3	6	3661772	3661777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13022	NC_014833	T	6	6	3662616	3662621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_014833	TTA	2	6	3662632	3662637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_014833	AT	3	6	3662639	3662644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_014833	ATT	2	6	3662689	3662694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_014833	TAA	2	6	3662747	3662752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_014833	T	7	7	3662980	3662986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13030	NC_014833	ATA	2	6	3663037	3663042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13032	NC_014833	T	6	6	3664228	3664233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_014833	GT	3	6	3664256	3664261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_014833	AC	3	6	3664268	3664273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_014833	ATTA	2	8	3664712	3664719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_014833	AC	3	6	3664728	3664733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13037	NC_014833	GAATG	2	10	3667567	3667576	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_014833	TAT	2	6	3667677	3667682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13041	NC_014833	T	6	6	3669467	3669472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_014833	GT	3	6	3669535	3669540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_014833	AC	3	6	3669547	3669552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13044	NC_014833	TCC	2	6	3670537	3670542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13047	NC_014833	TA	3	6	3670613	3670618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_014833	AT	3	6	3670633	3670638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_014833	AT	5	10	3670641	3670650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_014833	AACA	2	8	3670664	3670671	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13051	NC_014833	ATT	2	6	3670690	3670695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_014833	T	6	6	3670694	3670699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_014833	A	6	6	3670717	3670722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13055	NC_014833	GATG	2	8	3670847	3670854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_014833	TAT	2	6	3670874	3670879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_014833	AT	3	6	3670892	3670897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_014833	AGT	2	6	3670928	3670933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_014833	CTTTT	2	10	3670944	3670953	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13060	NC_014833	AG	4	8	3671005	3671012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_014833	CGA	2	6	3671023	3671028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13063	NC_014833	TTTGCA	2	12	3671070	3671081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13064	NC_014833	GCCT	2	8	3671083	3671090	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13065	NC_014833	TGA	2	6	3671274	3671279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_014833	A	7	7	3671329	3671335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_014833	ATA	2	6	3671362	3671367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_014833	TTG	2	6	3671399	3671404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13072	NC_014833	A	7	7	3671687	3671693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13076	NC_014833	GCTA	2	8	3672150	3672157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13077	NC_014833	ATCTT	2	10	3672235	3672244	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13078	NC_014833	GGC	2	6	3672248	3672253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13081	NC_014833	TCCA	2	8	3672712	3672719	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13085	NC_014833	TTG	2	6	3673021	3673026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13088	NC_014833	TCT	2	6	3673349	3673354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13094	NC_014833	GA	3	6	3674104	3674109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_014833	GCC	2	6	3674268	3674273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13099	NC_014833	GGA	2	6	3674500	3674505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_014833	C	6	6	3674510	3674515	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13101	NC_014833	TCGC	2	8	3674702	3674709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13102	NC_014833	ACT	2	6	3674711	3674716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_014833	TTCAG	2	10	3674761	3674770	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13104	NC_014833	C	6	6	3674777	3674782	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13105	NC_014833	TTA	2	6	3674943	3674948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13109	NC_014833	TG	3	6	3675229	3675234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_014833	TGG	2	6	3675252	3675257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_014833	GAG	2	6	3675262	3675267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13113	NC_014833	CCA	2	6	3675397	3675402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13114	NC_014833	T	7	7	3675418	3675424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_014833	T	6	6	3675429	3675434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_014833	AGG	2	6	3675456	3675461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_014833	TCA	2	6	3675513	3675518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_014833	TCC	2	6	3675537	3675542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13119	NC_014833	GT	3	6	3675597	3675602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_014833	GTA	2	6	3675759	3675764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_014833	GT	3	6	3675766	3675771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13127	NC_014833	CTATG	2	10	3675978	3675987	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13128	NC_014833	TTC	2	6	3676013	3676018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13129	NC_014833	C	6	6	3676152	3676157	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.