MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL01

Total Repeats: 2310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014824	GAAT	2	8	342260	342267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_014824	TAT	2	6	342279	342284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_014824	A	6	6	343716	343721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_014824	T	7	7	343738	343744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_014824	GAT	2	6	345726	345731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_014824	AAG	2	6	347873	347878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_014824	TAT	2	6	349554	349559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_014824	T	7	7	349562	349568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_014824	AGG	2	6	349585	349590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_014824	GTA	2	6	350598	350603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_014824	AT	4	8	350628	350635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_014824	A	6	6	350642	350647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_014824	GGA	2	6	353378	353383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_014824	AATA	2	8	353384	353391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_014824	ATT	2	6	355134	355139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_014824	TAT	2	6	355161	355166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_014824	TA	3	6	356228	356233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_014824	AGG	2	6	356246	356251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_014824	AT	4	8	357266	357273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_014824	TA	3	6	357290	357295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_014824	A	6	6	357319	357324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_014824	TTA	2	6	357328	357333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_014824	GTC	2	6	357341	357346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_014824	TCTT	2	8	357363	357370	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2025	NC_014824	ATA	2	6	357399	357404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_014824	GTA	2	6	357425	357430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_014824	GA	3	6	357493	357498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2030	NC_014824	A	6	6	365960	365965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_014824	AAC	2	6	365973	365978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_014824	AAT	2	6	365994	365999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_014824	GAATT	2	10	366237	366246	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_014824	AAT	2	6	366310	366315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_014824	TCG	2	6	366331	366336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2036	NC_014824	TA	3	6	366343	366348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_014824	ATAC	2	8	366353	366360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2038	NC_014824	TA	5	10	366380	366389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_014824	ACA	2	6	367071	367076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2040	NC_014824	CTA	2	6	367110	367115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2041	NC_014824	TA	3	6	367118	367123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_014824	GATA	2	8	367125	367132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_014824	CTC	2	6	367204	367209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2044	NC_014824	CCAA	2	8	367291	367298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2045	NC_014824	CCCA	2	8	367317	367324	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2046	NC_014824	AAT	2	6	367532	367537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_014824	TTAA	2	8	367577	367584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_014824	TCG	2	6	367597	367602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2050	NC_014824	TTTA	2	8	367650	367657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_014824	TCT	2	6	367692	367697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2052	NC_014824	T	7	7	367706	367712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_014824	TTAAA	2	10	367729	367738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_014824	TCA	2	6	367774	367779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_014824	CAT	2	6	367796	367801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2057	NC_014824	A	7	7	367854	367860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_014824	GTT	2	6	367925	367930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_014824	TAT	2	6	367944	367949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2061	NC_014824	GGTT	2	8	367994	368001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2064	NC_014824	T	7	7	368070	368076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_014824	AGG	2	6	373232	373237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_014824	TGC	2	6	373238	373243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2068	NC_014824	TA	4	8	373324	373331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_014824	T	6	6	373333	373338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2070	NC_014824	TAA	2	6	373345	373350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2072	NC_014824	TTTA	2	8	373373	373380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_014824	TA	3	6	373393	373398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_014824	AGG	2	6	373417	373422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2084	NC_014824	AC	3	6	375962	375967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2087	NC_014824	AACAG	2	10	376035	376044	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2095	NC_014824	TGAT	2	8	376925	376932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2103	NC_014824	A	7	7	377633	377639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_014824	A	6	6	377670	377675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_014824	GGA	2	6	377677	377682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2107	NC_014824	T	7	7	377944	377950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2110	NC_014824	A	8	8	379230	379237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_014824	AT	3	6	379269	379274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2114	NC_014824	AT	3	6	379359	379364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2117	NC_014824	AAAAT	2	10	379857	379866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_014824	AAGA	2	8	379882	379889	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_014824	AGG	2	6	379893	379898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_014824	ATG	2	6	380241	380246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_014824	AT	3	6	380250	380255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_014824	ATT	2	6	380518	380523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_014824	TGA	2	6	380629	380634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_014824	ATA	2	6	380637	380642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_014824	A	6	6	380752	380757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_014824	TA	3	6	380761	380766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2127	NC_014824	ATT	2	6	380775	380780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2138	NC_014824	TTG	2	6	382075	382080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2272	NC_014824	T	7	7	412375	412381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2273	NC_014824	ATTAT	2	10	412385	412394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2274	NC_014824	AGA	2	6	412404	412409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2275	NC_014824	ACT	2	6	412417	412422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2277	NC_014824	A	6	6	412453	412458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2278	NC_014824	TTCG	2	8	414091	414098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2279	NC_014824	CTC	2	6	414107	414112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2280	NC_014824	AGC	2	6	414149	414154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2281	NC_014824	T	6	6	414204	414209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2282	NC_014824	TTG	2	6	414273	414278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2283	NC_014824	ACA	2	6	414284	414289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2284	NC_014824	AT	3	6	415609	415614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2285	NC_014824	TCTT	2	8	415618	415625	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2286	NC_014824	A	7	7	415676	415682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2287	NC_014824	TA	3	6	415689	415694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2288	NC_014824	A	9	9	415716	415724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2289	NC_014824	T	6	6	415734	415739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2290	NC_014824	T	6	6	415741	415746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2291	NC_014824	TAA	2	6	415763	415768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2292	NC_014824	TA	5	10	415770	415779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2293	NC_014824	TAA	2	6	415783	415788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2295	NC_014824	AGA	2	6	417827	417832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2296	NC_014824	TA	3	6	417899	417904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2297	NC_014824	TG	3	6	417909	417914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2298	NC_014824	TAA	2	6	418009	418014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2299	NC_014824	T	6	6	418856	418861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2300	NC_014824	AC	3	6	418877	418882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2301	NC_014824	TAT	2	6	419798	419803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2302	NC_014824	AAGC	2	8	420358	420365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2307	NC_014824	AC	3	6	420555	420560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2308	NC_014824	A	6	6	420608	420613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2309	NC_014824	A	7	7	420661	420667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2310	NC_014824	A	6	6	420679	420684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.