MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 12323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_014664	CCGAG	2	10	3899017	3899026	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12002	NC_014664	GACAG	2	10	3899039	3899048	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12003	NC_014664	A	7	7	3899081	3899087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_014664	ATC	2	6	3899114	3899119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_014664	TGA	2	6	3899163	3899168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_014664	CGC	2	6	3899177	3899182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12007	NC_014664	CG	3	6	3899201	3899206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12008	NC_014664	CGC	2	6	3899210	3899215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12009	NC_014664	GCG	2	6	3899235	3899240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12010	NC_014664	TTG	2	6	3899242	3899247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12011	NC_014664	TCC	3	9	3901810	3901818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12012	NC_014664	GCCC	2	8	3901852	3901859	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12013	NC_014664	CGTG	2	8	3901868	3901875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12014	NC_014664	ACGT	2	8	3901947	3901954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12015	NC_014664	ATC	2	6	3901957	3901962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12016	NC_014664	ATT	2	6	3902047	3902052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_014664	CGCC	2	8	3902096	3902103	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12018	NC_014664	GA	3	6	3903473	3903478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_014664	GC	3	6	3907359	3907364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12020	NC_014664	GTC	2	6	3907459	3907464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12021	NC_014664	CTGC	2	8	3907875	3907882	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12022	NC_014664	CTGC	2	8	3907886	3907893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12023	NC_014664	T	6	6	3907905	3907910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12041	NC_014664	GGC	3	9	3909793	3909801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12043	NC_014664	TAA	2	6	3912417	3912422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12046	NC_014664	AT	3	6	3912547	3912552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_014664	AAGC	2	8	3912619	3912626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12048	NC_014664	GC	3	6	3912638	3912643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12049	NC_014664	GCCGC	2	10	3912651	3912660	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12050	NC_014664	GC	3	6	3913703	3913708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12051	NC_014664	GC	3	6	3913721	3913726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12054	NC_014664	CG	4	8	3918892	3918899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12055	NC_014664	GC	3	6	3918921	3918926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12056	NC_014664	CTT	2	6	3920104	3920109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12063	NC_014664	CA	3	6	3921192	3921197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12073	NC_014664	ATT	2	6	3923506	3923511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12099	NC_014664	TGGGG	2	10	3926531	3926540	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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12122	NC_014664	CT	3	6	3940863	3940868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12252	NC_014664	GGCTC	2	10	3981353	3981362	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12253	NC_014664	A	6	6	3981402	3981407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12254	NC_014664	GC	4	8	3981422	3981429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12255	NC_014664	CG	3	6	3982469	3982474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.