MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 6825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014643	T	9	9	1383752	1383760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_014643	GTT	2	6	1383761	1383766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_014643	TGTTT	2	10	1383767	1383776	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_014643	TCA	2	6	1383795	1383800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_014643	GTT	2	6	1383810	1383815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_014643	CTGG	2	8	1383870	1383877	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4007	NC_014643	TGCTGG	2	12	1383878	1383889	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4008	NC_014643	GGTGTT	2	12	1383900	1383911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_014643	TGT	2	6	1383921	1383926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_014643	TA	3	6	1383935	1383940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_014643	TCT	2	6	1383954	1383959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_014643	TG	3	6	1383974	1383979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_014643	TTC	2	6	1383989	1383994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_014643	TG	3	6	1384006	1384011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_014643	GTT	2	6	1384015	1384020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_014643	TGG	2	6	1384151	1384156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_014643	G	6	6	1384187	1384192	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_014643	ATA	2	6	1384236	1384241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_014643	TAG	2	6	1384252	1384257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_014643	GCGA	2	8	1384260	1384267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_014643	GT	3	6	1384291	1384296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_014643	CAT	2	6	1384315	1384320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_014643	GTT	2	6	1384334	1384339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_014643	GTG	2	6	1384340	1384345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_014643	ATG	2	6	1384372	1384377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4027	NC_014643	ACC	2	6	1384504	1384509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_014643	TGA	2	6	1384530	1384535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_014643	GGGAG	2	10	1384580	1384589	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_014643	TG	3	6	1384639	1384644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_014643	GTG	2	6	1384647	1384652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4033	NC_014643	GGA	2	6	1384822	1384827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_014643	G	6	6	1384852	1384857	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_014643	AGG	2	6	1385151	1385156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4039	NC_014643	TG	3	6	1385338	1385343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_014643	GAT	2	6	1385398	1385403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_014643	GT	3	6	1385587	1385592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_014643	AGCCA	2	10	1385644	1385653	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4043	NC_014643	GGT	2	6	1385657	1385662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_014643	GTT	2	6	1385692	1385697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4046	NC_014643	TTGT	2	8	1385737	1385744	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_014643	TGC	2	6	1385764	1385769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_014643	GA	3	6	1385852	1385857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_014643	G	6	6	1385905	1385910	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_014643	GACT	2	8	1386026	1386033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4051	NC_014643	TG	3	6	1386073	1386078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_014643	CGG	2	6	1386109	1386114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4059	NC_014643	GC	3	6	1386827	1386832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_014643	GACG	2	8	1386876	1386883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4061	NC_014643	GGGA	2	8	1386937	1386944	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_014643	GT	3	6	1387010	1387015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_014643	GAT	2	6	1387029	1387034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4069	NC_014643	TGG	2	6	1387290	1387295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_014643	AATA	2	8	1387321	1387328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_014643	TGGG	2	8	1387348	1387355	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_014643	GGT	2	6	1387402	1387407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4083	NC_014643	TGGG	2	8	1387958	1387965	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4086	NC_014643	CATA	2	8	1388595	1388602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_014643	CG	3	6	1388721	1388726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_014643	CAA	2	6	1388829	1388834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_014643	AGA	2	6	1390112	1390117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4092	NC_014643	AGC	2	6	1390298	1390303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4096	NC_014643	CGCA	2	8	1393628	1393635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4097	NC_014643	AGAC	2	8	1393661	1393668	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_014643	ATT	2	6	1393671	1393676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_014643	TACC	2	8	1393718	1393725	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_014643	GAA	2	6	1394770	1394775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_014643	A	6	6	1394807	1394812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_014643	GTG	2	6	1394893	1394898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_014643	CGG	2	6	1394942	1394947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_014643	TCAA	2	8	1395071	1395078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_014643	AGC	2	6	1395855	1395860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4108	NC_014643	GTTT	2	8	1396291	1396298	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_014643	TCTG	2	8	1396301	1396308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_014643	TTC	2	6	1396397	1396402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_014643	TAG	2	6	1396515	1396520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_014643	AT	3	6	1396543	1396548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_014643	TCC	2	6	1396660	1396665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_014643	GTG	2	6	1396693	1396698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_014643	ACCTTC	2	12	1396740	1396751	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_014643	CGC	2	6	1396791	1396796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_014643	CTG	2	6	1396826	1396831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_014643	AATCAG	2	12	1396855	1396866	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4119	NC_014643	CCCGGA	2	12	1396867	1396878	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_014643	AAC	2	6	1396903	1396908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_014643	ACA	2	6	1397266	1397271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_014643	TAT	2	6	1397301	1397306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_014643	TA	4	8	1397316	1397323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_014643	CGGT	2	8	1397394	1397401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_014643	CTA	2	6	1397417	1397422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_014643	TTG	3	9	1397452	1397460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_014643	GGA	2	6	1397522	1397527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_014643	CCT	2	6	1397735	1397740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_014643	ACG	2	6	1397765	1397770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_014643	TTC	2	6	1397801	1397806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_014643	GGT	2	6	1397838	1397843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_014643	CAT	2	6	1397854	1397859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_014643	AGAA	2	8	1397871	1397878	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_014643	GCC	2	6	1398859	1398864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4135	NC_014643	TCCG	2	8	1398897	1398904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4136	NC_014643	GCG	2	6	1399346	1399351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_014643	CTGC	2	8	1399366	1399373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4138	NC_014643	ACCCC	2	10	1399400	1399409	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4139	NC_014643	A	6	6	1399448	1399453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_014643	TCA	2	6	1399606	1399611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4142	NC_014643	TAGA	2	8	1400278	1400285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_014643	ACT	2	6	1400326	1400331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4146	NC_014643	GGC	2	6	1400442	1400447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4155	NC_014643	GC	3	6	1401674	1401679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4156	NC_014643	ATG	2	6	1401713	1401718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4159	NC_014643	GGGT	2	8	1401873	1401880	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4164	NC_014643	GC	3	6	1402503	1402508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4165	NC_014643	GCG	2	6	1402513	1402518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4176	NC_014643	GA	3	6	1405276	1405281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4177	NC_014643	CGCA	2	8	1406806	1406813	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4190	NC_014643	AGAA	2	8	1410308	1410315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4232	NC_014643	AT	4	8	1423351	1423358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_014643	TA	3	6	1423376	1423381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_014643	TAAA	2	8	1423401	1423408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4245	NC_014643	A	6	6	1427512	1427517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4247	NC_014643	A	6	6	1427566	1427571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4251	NC_014643	AATA	2	8	1429687	1429694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_014643	TCT	2	6	1431619	1431624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4254	NC_014643	GGC	2	6	1432682	1432687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4257	NC_014643	CCT	2	6	1436667	1436672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4259	NC_014643	GAG	2	6	1436718	1436723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_014643	TCT	2	6	1436760	1436765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4261	NC_014643	TCTAG	2	10	1438164	1438173	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4262	NC_014643	GC	3	6	1438179	1438184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4263	NC_014643	T	6	6	1438214	1438219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_014643	GCC	2	6	1438220	1438225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4266	NC_014643	CTGC	2	8	1439542	1439549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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