MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 6825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014643	AAT	2	6	2134667	2134672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_014643	GACA	2	8	2134690	2134697	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6003	NC_014643	ATG	2	6	2135859	2135864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_014643	TGT	2	6	2135884	2135889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_014643	A	6	6	2135996	2136001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_014643	CCA	2	6	2136051	2136056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_014643	C	11	11	2136166	2136176	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6008	NC_014643	CTT	2	6	2136234	2136239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_014643	TCT	2	6	2136255	2136260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_014643	A	6	6	2136276	2136281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_014643	ATA	2	6	2136328	2136333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_014643	AGA	2	6	2136349	2136354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_014643	CAA	2	6	2136388	2136393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_014643	GCG	2	6	2136406	2136411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_014643	AC	3	6	2137415	2137420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_014643	TAG	2	6	2137483	2137488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_014643	CA	3	6	2137775	2137780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_014643	CA	3	6	2137836	2137841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_014643	GTA	2	6	2138653	2138658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_014643	AC	3	6	2138659	2138664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6021	NC_014643	ACC	2	6	2138697	2138702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_014643	AAC	2	6	2138718	2138723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_014643	C	6	6	2138728	2138733	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6024	NC_014643	A	6	6	2138740	2138745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_014643	CTA	2	6	2141276	2141281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_014643	AAT	2	6	2141293	2141298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_014643	AGGAA	2	10	2142781	2142790	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_014643	CA	3	6	2142812	2142817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6029	NC_014643	TGT	2	6	2142894	2142899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_014643	GAA	2	6	2142903	2142908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_014643	A	6	6	2143342	2143347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_014643	T	6	6	2143462	2143467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_014643	CA	3	6	2143506	2143511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_014643	CAT	2	6	2146572	2146577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_014643	GAT	2	6	2146585	2146590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_014643	ATC	2	6	2146719	2146724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_014643	AGC	2	6	2146727	2146732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_014643	ATA	2	6	2146803	2146808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_014643	GCTCG	2	10	2146841	2146850	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6040	NC_014643	AAAGA	2	10	2146851	2146860	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_014643	CT	4	8	2146886	2146893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_014643	GTT	2	6	2146927	2146932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_014643	TCCT	2	8	2146961	2146968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_014643	GT	3	6	2147006	2147011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_014643	TA	3	6	2147050	2147055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_014643	TAAG	2	8	2147067	2147074	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_014643	TGC	2	6	2147112	2147117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_014643	AGA	2	6	2147159	2147164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_014643	GATAT	2	10	2147167	2147176	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_014643	CAG	2	6	2147182	2147187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_014643	ATAC	2	8	2147205	2147212	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6052	NC_014643	AACC	2	8	2147250	2147257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_014643	AG	3	6	2150194	2150199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_014643	TG	4	8	2150910	2150917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_014643	ACGG	2	8	2150933	2150940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6056	NC_014643	CTG	2	6	2151569	2151574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_014643	GT	3	6	2151657	2151662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_014643	AGA	2	6	2152941	2152946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_014643	GAG	2	6	2152978	2152983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_014643	GCT	2	6	2152990	2152995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_014643	TAT	2	6	2153103	2153108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_014643	TG	3	6	2153133	2153138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_014643	AAT	2	6	2153172	2153177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_014643	ATT	2	6	2153209	2153214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_014643	GAG	2	6	2153226	2153231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_014643	A	6	6	2153233	2153238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_014643	TTA	2	6	2153754	2153759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_014643	AAAG	2	8	2153768	2153775	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_014643	GCG	2	6	2154827	2154832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_014643	GGA	2	6	2154940	2154945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_014643	CTC	2	6	2155331	2155336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_014643	CTT	2	6	2155341	2155346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_014643	GTC	2	6	2156973	2156978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_014643	GT	3	6	2156987	2156992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_014643	AGT	2	6	2157042	2157047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_014643	ATA	2	6	2157083	2157088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_014643	TG	3	6	2157112	2157117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_014643	A	8	8	2157186	2157193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_014643	ATA	2	6	2158576	2158581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_014643	ACA	2	6	2158614	2158619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_014643	TG	3	6	2158651	2158656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_014643	ATG	2	6	2158657	2158662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_014643	T	8	8	2158671	2158678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_014643	TG	4	8	2160184	2160191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_014643	TTG	2	6	2160235	2160240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_014643	GGT	2	6	2160268	2160273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_014643	TCCTT	2	10	2161752	2161761	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6088	NC_014643	GAT	2	6	2161764	2161769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_014643	CGG	2	6	2161774	2161779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_014643	GAG	2	6	2161792	2161797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_014643	GT	3	6	2162766	2162771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_014643	TGG	2	6	2164343	2164348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_014643	GACGG	2	10	2164370	2164379	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6094	NC_014643	GAA	2	6	2164397	2164402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_014643	TCC	2	6	2170139	2170144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_014643	GGA	2	6	2170159	2170164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_014643	ACT	2	6	2171130	2171135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_014643	CCA	2	6	2171148	2171153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_014643	GGT	2	6	2171158	2171163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_014643	GTTGT	2	10	2171171	2171180	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_014643	ATT	2	6	2171793	2171798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_014643	GTT	2	6	2171806	2171811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_014643	CAT	2	6	2173954	2173959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_014643	AT	3	6	2173966	2173971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_014643	AAC	2	6	2173981	2173986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_014643	GCT	2	6	2173993	2173998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_014643	GCA	2	6	2174021	2174026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_014643	TTCC	2	8	2175643	2175650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_014643	GT	3	6	2177304	2177309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_014643	CAG	2	6	2180976	2180981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_014643	GAA	2	6	2181032	2181037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_014643	AAT	2	6	2181066	2181071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_014643	GCG	2	6	2181072	2181077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_014643	CGA	2	6	2181097	2181102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_014643	TCA	2	6	2181166	2181171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_014643	TG	3	6	2182292	2182297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_014643	TTCTA	2	10	2182319	2182328	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6118	NC_014643	TAG	2	6	2182397	2182402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_014643	CTAC	2	8	2183754	2183761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_014643	CGT	2	6	2184705	2184710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_014643	TAA	2	6	2184725	2184730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_014643	CAG	2	6	2184732	2184737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_014643	AGC	2	6	2184744	2184749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_014643	CAGG	2	8	2184777	2184784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6125	NC_014643	AGA	2	6	2186741	2186746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_014643	CTC	2	6	2186764	2186769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_014643	CAT	2	6	2186775	2186780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_014643	CTG	2	6	2186808	2186813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_014643	G	6	6	2186824	2186829	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_014643	C	6	6	2186861	2186866	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6131	NC_014643	TAC	2	6	2186888	2186893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_014643	CT	3	6	2188331	2188336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6133	NC_014643	TGA	2	6	2189488	2189493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_014643	TTG	2	6	2192542	2192547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_014643	TGT	2	6	2193418	2193423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_014643	TCT	2	6	2194566	2194571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6137	NC_014643	TTG	2	6	2194626	2194631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6138	NC_014643	GAG	2	6	2194638	2194643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6139	NC_014643	GGT	2	6	2195780	2195785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6140	NC_014643	TAA	2	6	2195786	2195791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6141	NC_014643	TTG	2	6	2195817	2195822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6142	NC_014643	AG	3	6	2195823	2195828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6143	NC_014643	ACT	2	6	2195837	2195842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6145	NC_014643	AATA	2	8	2196907	2196914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6146	NC_014643	GAC	2	6	2197640	2197645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6148	NC_014643	CCT	2	6	2199066	2199071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6151	NC_014643	GA	3	6	2201150	2201155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6152	NC_014643	ATC	2	6	2201521	2201526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6153	NC_014643	GCG	2	6	2201533	2201538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6154	NC_014643	CAG	2	6	2201562	2201567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6155	NC_014643	TGA	2	6	2201572	2201577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6159	NC_014643	AT	3	6	2202325	2202330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6160	NC_014643	GT	3	6	2203399	2203404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6171	NC_014643	CTAT	2	8	2214717	2214724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6174	NC_014643	TCTAC	2	10	2218554	2218563	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6180	NC_014643	TA	3	6	2221651	2221656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6181	NC_014643	CGTAA	2	10	2221718	2221727	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6185	NC_014643	TTC	2	6	2227872	2227877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6198	NC_014643	TGT	2	6	2235438	2235443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6201	NC_014643	CGA	2	6	2235551	2235556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6247	NC_014643	TCT	2	6	2259849	2259854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6249	NC_014643	CAT	2	6	2260544	2260549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6252	NC_014643	TA	3	6	2261320	2261325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6253	NC_014643	CG	3	6	2262246	2262251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6254	NC_014643	GTTT	2	8	2262321	2262328	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_014643	TGT	2	6	2262332	2262337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_014643	TTC	2	6	2264434	2264439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6257	NC_014643	GCA	2	6	2264445	2264450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6258	NC_014643	CTA	2	6	2264482	2264487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6259	NC_014643	TG	3	6	2264517	2264522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_014643	AG	3	6	2264533	2264538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_014643	ACG	2	6	2264547	2264552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6262	NC_014643	CAA	2	6	2266539	2266544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6264	NC_014643	GGA	2	6	2266678	2266683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6382	NC_014643	TA	3	6	2307602	2307607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6383	NC_014643	ATT	2	6	2308208	2308213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6385	NC_014643	GTG	2	6	2308226	2308231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6390	NC_014643	TCA	2	6	2308423	2308428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6392	NC_014643	GACG	2	8	2310253	2310260	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6393	NC_014643	CTT	2	6	2310346	2310351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6396	NC_014643	CATGC	2	10	2311599	2311608	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6397	NC_014643	ATA	2	6	2311673	2311678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6398	NC_014643	CCG	2	6	2311738	2311743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6401	NC_014643	GCC	2	6	2312244	2312249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6402	NC_014643	GACA	2	8	2312260	2312267	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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