MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum str. PSI07 chromosome

Total Repeats: 9460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_014311	GCT	2	6	3352626	3352631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_014311	CGC	2	6	3352727	3352732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9003	NC_014311	AC	3	6	3352759	3352764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9004	NC_014311	T	6	6	3357403	3357408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_014311	GGCG	2	8	3357649	3357656	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9006	NC_014311	TTC	2	6	3357664	3357669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_014311	GGT	2	6	3357674	3357679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_014311	TTG	2	6	3357718	3357723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_014311	GA	3	6	3357770	3357775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_014311	GGC	2	6	3357804	3357809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_014311	ACG	2	6	3357879	3357884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_014311	CCCA	2	8	3357885	3357892	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9013	NC_014311	GTC	2	6	3357906	3357911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_014311	CGGC	3	12	3357976	3357987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9015	NC_014311	GCT	3	9	3358024	3358032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9016	NC_014311	AGA	2	6	3358101	3358106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_014311	TGC	2	6	3358158	3358163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_014311	CAA	2	6	3358321	3358326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_014311	TTC	2	6	3358327	3358332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_014311	AC	3	6	3358429	3358434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9021	NC_014311	CTT	2	6	3358474	3358479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_014311	GATG	2	8	3358549	3358556	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_014311	CGAA	2	8	3358924	3358931	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9024	NC_014311	TTC	2	6	3360232	3360237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_014311	TGCTGA	2	12	3360266	3360277	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9026	NC_014311	GTT	2	6	3360290	3360295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_014311	GGTG	2	8	3360358	3360365	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_014311	CCGG	2	8	3360389	3360396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9029	NC_014311	GCT	3	9	3360412	3360420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_014311	ATG	2	6	3360911	3360916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_014311	CGG	2	6	3361033	3361038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9032	NC_014311	TGG	2	6	3361110	3361115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_014311	ACG	2	6	3361125	3361130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_014311	ATT	2	6	3362119	3362124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_014311	AAT	2	6	3362134	3362139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_014311	CAC	2	6	3362159	3362164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9037	NC_014311	GCC	2	6	3362165	3362170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9038	NC_014311	CGG	3	9	3362786	3362794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_014311	ACG	2	6	3363397	3363402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_014311	CCA	2	6	3363412	3363417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9041	NC_014311	CCG	3	9	3364077	3364085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9042	NC_014311	CG	3	6	3364084	3364089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9043	NC_014311	CGG	2	6	3364509	3364514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_014311	GGA	2	6	3364575	3364580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_014311	CGCGC	2	10	3365343	3365352	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9046	NC_014311	TGC	2	6	3365423	3365428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_014311	CCA	3	9	3365499	3365507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9048	NC_014311	CTGC	2	8	3365551	3365558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9049	NC_014311	GCCA	2	8	3365559	3365566	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9050	NC_014311	GCCA	2	8	3365587	3365594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9051	NC_014311	CAC	2	6	3365595	3365600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9052	NC_014311	ACA	2	6	3365605	3365610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9053	NC_014311	CCGC	2	8	3366567	3366574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9054	NC_014311	T	7	7	3366596	3366602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_014311	GCG	2	6	3366612	3366617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9056	NC_014311	GCCGC	2	10	3366625	3366634	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9057	NC_014311	CCGG	2	8	3367681	3367688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9058	NC_014311	GGCG	2	8	3367691	3367698	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9059	NC_014311	GC	3	6	3367714	3367719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9060	NC_014311	GAT	2	6	3367801	3367806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_014311	GCC	2	6	3367811	3367816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9062	NC_014311	GCAT	2	8	3368356	3368363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9063	NC_014311	CAG	2	6	3368379	3368384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_014311	GC	3	6	3368395	3368400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9065	NC_014311	GAT	2	6	3368437	3368442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_014311	CAATC	2	10	3368460	3368469	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9067	NC_014311	CCA	2	6	3368519	3368524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9068	NC_014311	GTTCT	2	10	3368548	3368557	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9069	NC_014311	CCG	2	6	3368564	3368569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9070	NC_014311	CGC	2	6	3369618	3369623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9071	NC_014311	CGC	2	6	3369685	3369690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9072	NC_014311	GCC	2	6	3369708	3369713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9073	NC_014311	GC	3	6	3370252	3370257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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9077	NC_014311	CG	3	6	3370344	3370349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9078	NC_014311	A	6	6	3371171	3371176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9092	NC_014311	GCCG	2	8	3375796	3375803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9093	NC_014311	GCACC	2	10	3377042	3377051	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9094	NC_014311	GAA	2	6	3377060	3377065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9101	NC_014311	GCCT	2	8	3377506	3377513	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9102	NC_014311	GGC	2	6	3377536	3377541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9103	NC_014311	GCGA	2	8	3377607	3377614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9104	NC_014311	GGC	2	6	3377615	3377620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9105	NC_014311	CGGC	2	8	3377634	3377641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9106	NC_014311	GC	3	6	3377654	3377659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9107	NC_014311	GATC	2	8	3377671	3377678	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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9112	NC_014311	CG	4	8	3380673	3380680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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9115	NC_014311	CGC	2	6	3380745	3380750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9119	NC_014311	TGGT	2	8	3382635	3382642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_014311	CGCA	2	8	3382682	3382689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9121	NC_014311	CG	3	6	3384287	3384292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9122	NC_014311	CAA	2	6	3384305	3384310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9124	NC_014311	GC	4	8	3384849	3384856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9125	NC_014311	GGC	3	9	3384866	3384874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_014311	GC	3	6	3384873	3384878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9127	NC_014311	GAA	2	6	3384976	3384981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9130	NC_014311	CGCGC	2	10	3385070	3385079	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9131	NC_014311	GGC	2	6	3385101	3385106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9394	NC_014311	TACA	2	8	3504458	3504465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9395	NC_014311	GC	3	6	3504487	3504492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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9397	NC_014311	GCCC	2	8	3504527	3504534	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9398	NC_014311	CCG	2	6	3504543	3504548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9399	NC_014311	GGAT	2	8	3504587	3504594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9400	NC_014311	CCGTG	2	10	3504611	3504620	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9401	NC_014311	CAG	2	6	3504625	3504630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9402	NC_014311	TTG	2	6	3504642	3504647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9403	NC_014311	TCG	2	6	3504653	3504658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9407	NC_014311	CG	3	6	3510732	3510737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9408	NC_014311	CCA	2	6	3510761	3510766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9409	NC_014311	T	10	10	3510774	3510783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9411	NC_014311	A	6	6	3510816	3510821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9412	NC_014311	GCA	2	6	3510823	3510828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9414	NC_014311	TCG	2	6	3510837	3510842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9415	NC_014311	CGG	3	9	3510907	3510915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9417	NC_014311	GGCT	2	8	3510982	3510989	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9418	NC_014311	GGA	2	6	3511003	3511008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9420	NC_014311	CGGC	2	8	3511060	3511067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9421	NC_014311	GTA	2	6	3511073	3511078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9423	NC_014311	GGC	2	6	3511136	3511141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9425	NC_014311	TTG	2	6	3511464	3511469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9427	NC_014311	GGC	2	6	3511497	3511502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9428	NC_014311	CCG	2	6	3511524	3511529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9429	NC_014311	GGCT	2	8	3511724	3511731	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9430	NC_014311	CG	3	6	3511744	3511749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9431	NC_014311	CCG	2	6	3511777	3511782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9432	NC_014311	AAC	2	6	3511860	3511865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9433	NC_014311	GCCAC	2	10	3512057	3512066	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9434	NC_014311	GCTTG	2	10	3512998	3513007	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9435	NC_014311	CTA	2	6	3513304	3513309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9436	NC_014311	CGAAGA	2	12	3513367	3513378	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9437	NC_014311	GCA	2	6	3513383	3513388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9438	NC_014311	TAGGC	2	10	3514135	3514144	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9439	NC_014311	TCA	2	6	3514148	3514153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9440	NC_014311	GA	3	6	3515475	3515480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9441	NC_014311	TCAGA	2	10	3515581	3515590	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9442	NC_014311	A	6	6	3515594	3515599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9443	NC_014311	TTC	2	6	3515600	3515605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9446	NC_014311	GGA	2	6	3517518	3517523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9448	NC_014311	TCCG	2	8	3517575	3517582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9449	NC_014311	A	6	6	3517618	3517623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9450	NC_014311	CG	3	6	3517656	3517661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9451	NC_014311	GCAAA	2	10	3520008	3520017	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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9454	NC_014311	CGC	3	9	3520307	3520315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9456	NC_014311	CCG	2	6	3520379	3520384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9457	NC_014311	GCTG	2	8	3520388	3520395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9458	NC_014311	GC	3	6	3520457	3520462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9459	NC_014311	TCC	2	6	3520468	3520473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9460	NC_014311	GCCG	2	8	3520586	3520593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.