MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 7173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013715	CA	3	6	1285484	1285489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_013715	TG	3	6	1285549	1285554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_013715	TCA	2	6	1285574	1285579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_013715	GT	3	6	1285590	1285595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_013715	GCG	2	6	1285601	1285606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_013715	GAG	2	6	1286397	1286402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_013715	TTTC	2	8	1286404	1286411	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_013715	CCA	2	6	1286424	1286429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_013715	TAA	2	6	1286592	1286597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_013715	CGC	2	6	1286628	1286633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_013715	ACC	2	6	1286691	1286696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_013715	AAT	2	6	1287664	1287669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_013715	CAC	2	6	1287672	1287677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_013715	AAG	2	6	1287697	1287702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_013715	CTT	2	6	1287728	1287733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_013715	CT	3	6	1291765	1291770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_013715	AAC	2	6	1291864	1291869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_013715	TA	3	6	1291927	1291932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_013715	GAAA	2	8	1292020	1292027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_013715	CAAC	2	8	1292048	1292055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_013715	AAC	2	6	1292178	1292183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_013715	GTC	2	6	1292223	1292228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_013715	GTTGG	2	10	1294701	1294710	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_013715	GC	3	6	1294721	1294726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_013715	CG	3	6	1294743	1294748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_013715	AT	3	6	1294778	1294783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_013715	GT	3	6	1294808	1294813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_013715	TC	3	6	1294815	1294820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_013715	CG	3	6	1294886	1294891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_013715	TGC	2	6	1294910	1294915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_013715	AGTTT	2	10	1295494	1295503	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_013715	CT	3	6	1300204	1300209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_013715	AAC	2	6	1300212	1300217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_013715	TCCA	2	8	1300305	1300312	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_013715	ACTGT	2	10	1300314	1300323	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4036	NC_013715	CT	3	6	1300350	1300355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_013715	GCGG	2	8	1300357	1300364	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_013715	CCTG	2	8	1300421	1300428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_013715	CCG	2	6	1300452	1300457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_013715	CAA	2	6	1300606	1300611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_013715	TTC	2	6	1300653	1300658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_013715	GAT	2	6	1300670	1300675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_013715	ATT	2	6	1300808	1300813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_013715	ACT	2	6	1300965	1300970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_013715	GCA	2	6	1301003	1301008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_013715	GC	3	6	1301012	1301017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_013715	GAA	2	6	1301136	1301141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_013715	GTC	2	6	1301217	1301222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_013715	GTG	2	6	1301230	1301235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_013715	CG	3	6	1301276	1301281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_013715	GTGTG	2	10	1301301	1301310	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_013715	TA	3	6	1301490	1301495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_013715	GCG	2	6	1301600	1301605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_013715	AAC	2	6	1301624	1301629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_013715	GCG	2	6	1301659	1301664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_013715	AAC	2	6	1301682	1301687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_013715	GCG	2	6	1303322	1303327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_013715	CGC	2	6	1303346	1303351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_013715	TGT	2	6	1303626	1303631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_013715	CCG	2	6	1303648	1303653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_013715	GTG	2	6	1303694	1303699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_013715	TTTC	2	8	1303746	1303753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_013715	TG	3	6	1304876	1304881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_013715	AG	3	6	1306078	1306083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_013715	GACC	2	8	1307378	1307385	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_013715	TC	3	6	1311325	1311330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_013715	CGC	2	6	1311365	1311370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_013715	GC	3	6	1311369	1311374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_013715	ATTT	2	8	1311448	1311455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_013715	CG	3	6	1311516	1311521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_013715	CG	3	6	1311529	1311534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4072	NC_013715	TCA	2	6	1311538	1311543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_013715	CA	3	6	1311542	1311547	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_013715	TCA	2	6	1311564	1311569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_013715	GCC	2	6	1311592	1311597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_013715	TTCCT	2	10	1311983	1311992	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4077	NC_013715	TTA	2	6	1311998	1312003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_013715	C	6	6	1314591	1314596	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4079	NC_013715	AGTG	2	8	1315276	1315283	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_013715	CGG	2	6	1315323	1315328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_013715	GCC	2	6	1315371	1315376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_013715	T	6	6	1315408	1315413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_013715	C	6	6	1315485	1315490	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4084	NC_013715	TGA	2	6	1315604	1315609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_013715	AGG	2	6	1316680	1316685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_013715	CCAG	2	8	1316837	1316844	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_013715	CCG	2	6	1318733	1318738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_013715	CGG	2	6	1318742	1318747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_013715	AGT	2	6	1319517	1319522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_013715	TGG	2	6	1319561	1319566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_013715	GAT	2	6	1320441	1320446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_013715	TCA	2	6	1320452	1320457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_013715	CGC	2	6	1320509	1320514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_013715	ATC	2	6	1320536	1320541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_013715	ACGT	2	8	1320550	1320557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_013715	AGC	2	6	1320572	1320577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_013715	GAAG	2	8	1320605	1320612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_013715	CTACC	2	10	1320632	1320641	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4099	NC_013715	T	6	6	1321867	1321872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_013715	CAT	2	6	1321874	1321879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_013715	T	6	6	1321888	1321893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_013715	AGA	2	6	1321978	1321983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_013715	TCTA	2	8	1321993	1322000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_013715	CTT	2	6	1322006	1322011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_013715	TGG	2	6	1322053	1322058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_013715	TCAC	2	8	1322067	1322074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_013715	CA	3	6	1322098	1322103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_013715	CGC	2	6	1322117	1322122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_013715	CAG	2	6	1323350	1323355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_013715	GCG	2	6	1323388	1323393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_013715	TC	3	6	1323402	1323407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_013715	CTT	2	6	1323415	1323420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_013715	T	6	6	1323474	1323479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_013715	GCC	2	6	1323568	1323573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_013715	TCC	2	6	1323582	1323587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_013715	GCC	2	6	1325760	1325765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_013715	TC	3	6	1325788	1325793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_013715	CTT	2	6	1325856	1325861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_013715	CACT	2	8	1325862	1325869	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_013715	ACTC	2	8	1325876	1325883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_013715	AGT	2	6	1331418	1331423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_013715	CTCA	2	8	1331628	1331635	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_013715	ACC	2	6	1331671	1331676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_013715	ACC	2	6	1331685	1331690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_013715	TTGCC	2	10	1333966	1333975	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4126	NC_013715	T	6	6	1334042	1334047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_013715	CTTT	2	8	1334051	1334058	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4128	NC_013715	T	6	6	1334056	1334061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_013715	AC	3	6	1334167	1334172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_013715	TGA	2	6	1334188	1334193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_013715	CAC	2	6	1334242	1334247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4132	NC_013715	CTG	2	6	1336127	1336132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_013715	TGA	2	6	1336182	1336187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_013715	CCT	2	6	1336225	1336230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4135	NC_013715	GC	3	6	1336362	1336367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4136	NC_013715	G	6	6	1336388	1336393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_013715	T	6	6	1337477	1337482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_013715	TGT	2	6	1337556	1337561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4141	NC_013715	TC	3	6	1339986	1339991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4144	NC_013715	T	6	6	1341821	1341826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4230	NC_013715	TGAGT	2	10	1366590	1366599	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4232	NC_013715	GCG	2	6	1366628	1366633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4234	NC_013715	TCCC	2	8	1366664	1366671	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4235	NC_013715	GCGT	2	8	1366678	1366685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4251	NC_013715	CAA	2	6	1367364	1367369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4252	NC_013715	GGC	2	6	1367370	1367375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4255	NC_013715	GCT	2	6	1367481	1367486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_013715	ATT	2	6	1367488	1367493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_013715	GTTC	2	8	1367510	1367517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4259	NC_013715	TCT	2	6	1367729	1367734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4263	NC_013715	AGGG	2	8	1367884	1367891	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4401	NC_013715	ACA	2	6	1384490	1384495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4485	NC_013715	TG	3	6	1422817	1422822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4497	NC_013715	TGTC	2	8	1428656	1428663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4498	NC_013715	ACC	2	6	1430763	1430768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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