MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 7173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013715	TGAG	2	8	1807744	1807751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_013715	CGG	2	6	1808138	1808143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_013715	GCC	2	6	1808161	1808166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NC_013715	TTC	2	6	1808212	1808217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_013715	CGC	2	6	1808232	1808237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_013715	GCC	2	6	1808263	1808268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5507	NC_013715	GAA	2	6	1808278	1808283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_013715	GGTC	2	8	1808292	1808299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5509	NC_013715	CGG	2	6	1808370	1808375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_013715	GCAG	2	8	1808389	1808396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5511	NC_013715	GA	3	6	1808417	1808422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_013715	TAC	2	6	1808463	1808468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_013715	GC	4	8	1808486	1808493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_013715	TTCC	2	8	1808538	1808545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_013715	CGT	2	6	1808581	1808586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_013715	GT	3	6	1808600	1808605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_013715	TA	3	6	1808661	1808666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_013715	ATGT	2	8	1808721	1808728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_013715	CGCA	2	8	1808774	1808781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_013715	AGCC	2	8	1808806	1808813	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_013715	GCC	2	6	1808840	1808845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_013715	CGG	2	6	1808887	1808892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_013715	GAAAA	2	10	1808949	1808958	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_013715	TTAG	2	8	1809059	1809066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_013715	TCA	2	6	1809079	1809084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_013715	T	6	6	1809090	1809095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_013715	TACTT	2	10	1809116	1809125	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5528	NC_013715	CCCTC	2	10	1809152	1809161	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5529	NC_013715	CG	3	6	1810055	1810060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_013715	CAA	2	6	1810101	1810106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_013715	TGC	2	6	1810184	1810189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_013715	GAG	2	6	1810201	1810206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_013715	TGC	2	6	1810870	1810875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_013715	GTT	2	6	1810959	1810964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_013715	TCA	2	6	1811016	1811021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_013715	TTC	2	6	1811075	1811080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_013715	TGG	2	6	1812440	1812445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_013715	GCC	2	6	1814170	1814175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_013715	TCGG	2	8	1814190	1814197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5540	NC_013715	GGC	2	6	1814199	1814204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_013715	TGG	2	6	1814215	1814220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_013715	GGCT	2	8	1815161	1815168	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_013715	AGT	2	6	1815198	1815203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_013715	GC	3	6	1815219	1815224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_013715	TGCG	2	8	1815257	1815264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_013715	TC	3	6	1815311	1815316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_013715	GC	3	6	1815364	1815369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5548	NC_013715	AAC	2	6	1816322	1816327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_013715	CGGGG	2	10	1816378	1816387	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5550	NC_013715	AAG	2	6	1819916	1819921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_013715	GAGCA	2	10	1820567	1820576	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5552	NC_013715	GAA	2	6	1820595	1820600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_013715	CGC	2	6	1820607	1820612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_013715	TAC	2	6	1821200	1821205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_013715	CTA	2	6	1821212	1821217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_013715	GC	4	8	1822175	1822182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_013715	CCCGGA	2	12	1822256	1822267	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_013715	GGCCCC	2	12	1822285	1822296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_013715	GAA	2	6	1822335	1822340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_013715	GGT	2	6	1823329	1823334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_013715	GAT	2	6	1823362	1823367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_013715	CAG	2	6	1823503	1823508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_013715	GCGT	2	8	1823557	1823564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5564	NC_013715	TCC	2	6	1823618	1823623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_013715	CTGC	2	8	1824333	1824340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_013715	TCG	2	6	1824392	1824397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_013715	TAA	2	6	1824400	1824405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_013715	CCG	2	6	1825795	1825800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_013715	CGGC	2	8	1825813	1825820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_013715	GCG	2	6	1827256	1827261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_013715	CCG	2	6	1827276	1827281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_013715	CGC	2	6	1828437	1828442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5574	NC_013715	AG	3	6	1829787	1829792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_013715	C	6	6	1829867	1829872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5576	NC_013715	A	7	7	1829873	1829879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5581	NC_013715	GCA	2	6	1830150	1830155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_013715	TGG	2	6	1830174	1830179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_013715	AGCTA	2	10	1830182	1830191	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5584	NC_013715	GGT	2	6	1831746	1831751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_013715	AGC	2	6	1831837	1831842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5587	NC_013715	TTTTA	2	10	1831872	1831881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_013715	TGG	2	6	1831973	1831978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_013715	TTA	2	6	1832033	1832038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_013715	CCCCA	2	10	1832058	1832067	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5591	NC_013715	CTC	2	6	1833804	1833809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_013715	ACC	2	6	1833829	1833834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5594	NC_013715	TAT	2	6	1834914	1834919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5596	NC_013715	TTG	2	6	1836355	1836360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_013715	TGT	2	6	1836377	1836382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5599	NC_013715	GCC	2	6	1836428	1836433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_013715	AGG	2	6	1836474	1836479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_013715	AGT	2	6	1837575	1837580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_013715	GTGA	2	8	1837656	1837663	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_013715	AGG	2	6	1837820	1837825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_013715	CCT	2	6	1837855	1837860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5606	NC_013715	AC	3	6	1839275	1839280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_013715	T	6	6	1839294	1839299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_013715	CG	3	6	1839333	1839338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_013715	GCC	2	6	1839449	1839454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5610	NC_013715	CAAA	2	8	1839466	1839473	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_013715	AGA	2	6	1839531	1839536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_013715	TA	3	6	1844469	1844474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_013715	CCG	2	6	1845788	1845793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5614	NC_013715	TACC	2	8	1845799	1845806	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_013715	CAT	2	6	1845905	1845910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_013715	GCC	2	6	1845943	1845948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5617	NC_013715	TTCT	2	8	1848562	1848569	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5618	NC_013715	CCT	2	6	1849564	1849569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5619	NC_013715	TG	3	6	1849633	1849638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_013715	T	7	7	1849717	1849723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_013715	TAACC	2	10	1849801	1849810	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5622	NC_013715	AT	3	6	1849871	1849876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_013715	CT	3	6	1851076	1851081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5624	NC_013715	AG	3	6	1852765	1852770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_013715	TC	3	6	1852797	1852802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5626	NC_013715	TATG	2	8	1852805	1852812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_013715	GCCA	2	8	1852825	1852832	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5628	NC_013715	TGA	2	6	1856422	1856427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_013715	GCG	2	6	1857409	1857414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5630	NC_013715	ACGG	2	8	1857426	1857433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5631	NC_013715	TG	3	6	1857436	1857441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5760	NC_013715	CCCG	2	8	1892663	1892670	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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