MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 7173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013715	GCGCC	2	10	1600596	1600605	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5002	NC_013715	CAC	2	6	1600657	1600662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_013715	CAA	2	6	1600685	1600690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_013715	ATCT	2	8	1601524	1601531	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5005	NC_013715	AACC	2	8	1601590	1601597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_013715	ACA	2	6	1601617	1601622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_013715	CAA	2	6	1601645	1601650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_013715	AG	3	6	1605542	1605547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_013715	CAG	2	6	1605559	1605564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_013715	CAA	2	6	1605608	1605613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_013715	CGC	2	6	1606298	1606303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_013715	AGC	2	6	1606310	1606315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_013715	GAA	2	6	1606335	1606340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_013715	AGG	2	6	1606344	1606349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_013715	CCT	2	6	1606357	1606362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_013715	GT	3	6	1607737	1607742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_013715	ATG	2	6	1607745	1607750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_013715	CTA	2	6	1607764	1607769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_013715	GAA	2	6	1607787	1607792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_013715	TATG	2	8	1609140	1609147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_013715	GTAG	2	8	1609172	1609179	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_013715	TAA	2	6	1610181	1610186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_013715	A	6	6	1610420	1610425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_013715	CCG	2	6	1610449	1610454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_013715	CA	3	6	1610464	1610469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_013715	CTAAA	2	10	1612799	1612808	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5027	NC_013715	CGC	2	6	1612838	1612843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_013715	ACG	2	6	1613929	1613934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_013715	CAC	2	6	1614446	1614451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_013715	AG	3	6	1614470	1614475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_013715	GAC	2	6	1614865	1614870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_013715	GCG	2	6	1615680	1615685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_013715	AT	3	6	1616363	1616368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_013715	GAGCG	2	10	1616433	1616442	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5035	NC_013715	GA	3	6	1618048	1618053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_013715	CA	3	6	1618098	1618103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_013715	TC	3	6	1618813	1618818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_013715	GTG	2	6	1618901	1618906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_013715	CT	3	6	1618996	1619001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_013715	AG	4	8	1619065	1619072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_013715	AT	3	6	1619086	1619091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_013715	CTCCC	2	10	1619109	1619118	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5043	NC_013715	GA	3	6	1619183	1619188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013715	TA	3	6	1619197	1619202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_013715	TTC	2	6	1619244	1619249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_013715	GAA	2	6	1619257	1619262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_013715	A	6	6	1619261	1619266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_013715	TTTG	2	8	1619276	1619283	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_013715	TGA	2	6	1619337	1619342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_013715	CAG	2	6	1619353	1619358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_013715	GCTG	2	8	1619405	1619412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5052	NC_013715	TCC	2	6	1619484	1619489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_013715	A	6	6	1619527	1619532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_013715	AGA	2	6	1620341	1620346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_013715	TA	3	6	1620403	1620408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_013715	GCG	2	6	1620492	1620497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_013715	CCCG	2	8	1620513	1620520	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5058	NC_013715	GCG	2	6	1625116	1625121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_013715	CGC	2	6	1625154	1625159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_013715	GCA	2	6	1625198	1625203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_013715	GT	3	6	1630260	1630265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_013715	CGTG	2	8	1630326	1630333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_013715	GTA	2	6	1633647	1633652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_013715	TGT	2	6	1633665	1633670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_013715	TTC	2	6	1633693	1633698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_013715	ACT	2	6	1633759	1633764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_013715	T	6	6	1633795	1633800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_013715	AT	3	6	1633915	1633920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_013715	ATT	2	6	1633948	1633953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_013715	GCCCC	2	10	1633999	1634008	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5071	NC_013715	TAA	2	6	1634313	1634318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_013715	CACC	2	8	1634341	1634348	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5073	NC_013715	GCC	2	6	1634392	1634397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_013715	CG	3	6	1634848	1634853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_013715	TCT	3	9	1634917	1634925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5077	NC_013715	T	6	6	1635014	1635019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_013715	GAC	2	6	1635039	1635044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_013715	GCACA	4	20	1635066	1635085	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5080	NC_013715	TC	3	6	1635692	1635697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_013715	GCG	2	6	1635704	1635709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_013715	CCG	2	6	1635712	1635717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_013715	CA	3	6	1635735	1635740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_013715	CGC	2	6	1635744	1635749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_013715	AGC	2	6	1635766	1635771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_013715	GA	3	6	1636474	1636479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_013715	TGA	2	6	1639951	1639956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_013715	GTGG	2	8	1642034	1642041	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_013715	TA	4	8	1642172	1642179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_013715	CTA	2	6	1643220	1643225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_013715	AAAT	2	8	1643310	1643317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_013715	TC	3	6	1644016	1644021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5093	NC_013715	CAG	2	6	1647006	1647011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_013715	GCA	2	6	1647057	1647062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_013715	CTT	2	6	1647078	1647083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_013715	ATAC	2	8	1647128	1647135	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_013715	TCCC	2	8	1647147	1647154	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5098	NC_013715	GAA	2	6	1648545	1648550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_013715	TGG	2	6	1648615	1648620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_013715	CGG	2	6	1648678	1648683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_013715	TCA	2	6	1648717	1648722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_013715	CTT	2	6	1650965	1650970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_013715	TCT	2	6	1650971	1650976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_013715	GT	3	6	1651055	1651060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_013715	GTG	2	6	1651077	1651082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_013715	GT	3	6	1651115	1651120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_013715	TTCT	2	8	1651138	1651145	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_013715	GGC	2	6	1651155	1651160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_013715	TCT	2	6	1651162	1651167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_013715	CTAG	2	8	1651196	1651203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5111	NC_013715	CA	3	6	1651306	1651311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_013715	CAC	2	6	1651331	1651336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_013715	ACGG	2	8	1651666	1651673	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_013715	GCC	2	6	1651676	1651681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_013715	GTG	2	6	1651684	1651689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_013715	CGT	2	6	1651710	1651715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_013715	TTC	2	6	1651737	1651742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_013715	TCA	2	6	1651804	1651809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_013715	CCG	2	6	1653344	1653349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_013715	CG	3	6	1653461	1653466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_013715	CCCA	2	8	1653482	1653489	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5122	NC_013715	GGGA	2	8	1653501	1653508	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_013715	CGG	2	6	1653519	1653524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_013715	CCG	2	6	1653543	1653548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_013715	AC	3	6	1653918	1653923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_013715	GAA	2	6	1655619	1655624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_013715	CGG	2	6	1655666	1655671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_013715	CCG	2	6	1655689	1655694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_013715	GCT	2	6	1655736	1655741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_013715	GGC	2	6	1656806	1656811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_013715	GCG	2	6	1656896	1656901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5133	NC_013715	GGCA	2	8	1656977	1656984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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