MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 7173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013715	TAC	2	6	1431920	1431925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_013715	GCA	2	6	1434151	1434156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_013715	CTTA	2	8	1434167	1434174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_013715	GCTC	2	8	1435706	1435713	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_013715	CG	4	8	1435721	1435728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_013715	GGC	2	6	1435730	1435735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_013715	TCA	2	6	1435773	1435778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_013715	GCTAC	2	10	1435782	1435791	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4509	NC_013715	ATTC	2	8	1435903	1435910	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4510	NC_013715	GAG	2	6	1435932	1435937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_013715	GT	3	6	1435951	1435956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_013715	CCT	2	6	1435973	1435978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_013715	TC	3	6	1437897	1437902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4514	NC_013715	CTT	2	6	1437903	1437908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_013715	TTCC	2	8	1437928	1437935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_013715	GGT	2	6	1437972	1437977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_013715	CAC	2	6	1438053	1438058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_013715	GCG	2	6	1438149	1438154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_013715	TTAT	2	8	1438157	1438164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_013715	GTAT	2	8	1438167	1438174	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_013715	TGT	2	6	1438196	1438201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_013715	GTC	2	6	1438211	1438216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_013715	CTT	2	6	1438695	1438700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_013715	TC	3	6	1438798	1438803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_013715	ACC	2	6	1441495	1441500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_013715	C	7	7	1441499	1441505	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4527	NC_013715	TGA	2	6	1441526	1441531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_013715	ATT	2	6	1441539	1441544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_013715	GC	3	6	1441599	1441604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_013715	GCC	2	6	1441737	1441742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_013715	AGCT	2	8	1441755	1441762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4532	NC_013715	TTG	2	6	1442835	1442840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_013715	TTCC	2	8	1442865	1442872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_013715	TAT	2	6	1442875	1442880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_013715	TC	3	6	1442982	1442987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_013715	A	6	6	1443068	1443073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_013715	GGC	3	9	1444485	1444493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4541	NC_013715	T	6	6	1445595	1445600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_013715	CGG	2	6	1445610	1445615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_013715	CCAG	2	8	1445628	1445635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_013715	CTG	2	6	1445681	1445686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_013715	TGG	2	6	1445727	1445732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4547	NC_013715	CTAC	2	8	1445805	1445812	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_013715	CTAG	2	8	1446679	1446686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_013715	CAT	2	6	1446763	1446768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_013715	CG	3	6	1446795	1446800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4551	NC_013715	GAG	2	6	1446863	1446868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_013715	GCCCC	2	10	1449665	1449674	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4553	NC_013715	CGGG	2	8	1451414	1451421	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4554	NC_013715	GCC	2	6	1451426	1451431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4559	NC_013715	TTTGA	2	10	1453205	1453214	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_013715	A	6	6	1453281	1453286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_013715	AG	3	6	1453289	1453294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_013715	TG	3	6	1454169	1454174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_013715	GAGCA	2	10	1454653	1454662	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4566	NC_013715	AT	3	6	1454754	1454759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_013715	GC	3	6	1454790	1454795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4568	NC_013715	TCA	2	6	1454823	1454828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4571	NC_013715	AGA	2	6	1454908	1454913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4579	NC_013715	TG	3	6	1456391	1456396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_013715	GT	5	10	1456401	1456410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4585	NC_013715	AG	3	6	1460672	1460677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4588	NC_013715	GC	3	6	1461956	1461961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_013715	CA	3	6	1461991	1461996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4592	NC_013715	AT	3	6	1462057	1462062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_013715	ACT	2	6	1463437	1463442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4598	NC_013715	GAA	2	6	1464533	1464538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_013715	CA	3	6	1465741	1465746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_013715	AACG	2	8	1465761	1465768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4601	NC_013715	CCCA	2	8	1465779	1465786	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4602	NC_013715	AGG	2	6	1465791	1465796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4604	NC_013715	GAAA	2	8	1468055	1468062	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_013715	CAG	2	6	1468064	1468069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_013715	CA	3	6	1468149	1468154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_013715	CAT	2	6	1468198	1468203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4610	NC_013715	ACG	2	6	1468438	1468443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_013715	TAA	2	6	1468468	1468473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_013715	GCG	2	6	1470792	1470797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_013715	CCCG	2	8	1472357	1472364	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4614	NC_013715	GC	3	6	1472381	1472386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_013715	ATG	2	6	1472417	1472422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_013715	TCTT	2	8	1473963	1473970	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_013715	GTA	2	6	1474007	1474012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_013715	TTTA	2	8	1475921	1475928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_013715	TGAT	2	8	1478302	1478309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_013715	CAC	2	6	1478824	1478829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4621	NC_013715	GAAA	2	8	1478853	1478860	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_013715	AAG	2	6	1478864	1478869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_013715	AAT	2	6	1478909	1478914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_013715	CCA	3	9	1478982	1478990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_013715	AAC	2	6	1479011	1479016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_013715	ACAA	2	8	1479027	1479034	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4627	NC_013715	TCC	2	6	1483672	1483677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4628	NC_013715	GCA	2	6	1483790	1483795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_013715	GTC	2	6	1483888	1483893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_013715	CGG	2	6	1486647	1486652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_013715	TCC	2	6	1486673	1486678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4633	NC_013715	CGAAG	2	10	1486789	1486798	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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