MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 5442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013501	TGC	2	6	2173085	2173090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_013501	CCGG	2	8	2173285	2173292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_013501	ACGGC	2	10	2175380	2175389	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3504	NC_013501	AAC	2	6	2175422	2175427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_013501	CAG	2	6	2175486	2175491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_013501	CCG	2	6	2178120	2178125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_013501	TGT	2	6	2178133	2178138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_013501	CGA	2	6	2180668	2180673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_013501	CGT	2	6	2180737	2180742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_013501	GCG	2	6	2180754	2180759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_013501	GTG	2	6	2180764	2180769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_013501	T	6	6	2182223	2182228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_013501	GTT	2	6	2185052	2185057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_013501	CAAA	2	8	2186923	2186930	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3515	NC_013501	CCG	2	6	2188090	2188095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_013501	GCG	2	6	2188114	2188119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_013501	ACC	2	6	2188124	2188129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_013501	TCA	2	6	2188136	2188141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_013501	CTG	2	6	2190468	2190473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_013501	T	6	6	2190492	2190497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013501	GGC	2	6	2190530	2190535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_013501	CGG	2	6	2192852	2192857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_013501	CCG	2	6	2192872	2192877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_013501	AGCCCA	2	12	2192987	2192998	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_013501	AGGG	2	8	2193055	2193062	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_013501	GCCT	2	8	2193107	2193114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_013501	TAT	2	6	2193224	2193229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013501	CAT	2	6	2193249	2193254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_013501	CGG	2	6	2193259	2193264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_013501	CTCCG	2	10	2196640	2196649	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3531	NC_013501	CA	3	6	2196672	2196677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_013501	CAGA	2	8	2196683	2196690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3533	NC_013501	AAT	2	6	2197291	2197296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_013501	AGG	2	6	2198313	2198318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_013501	CGGC	2	8	2199735	2199742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_013501	ACCG	2	8	2200719	2200726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_013501	CAG	2	6	2202556	2202561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_013501	GC	3	6	2202599	2202604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_013501	TTC	2	6	2202609	2202614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_013501	GCG	2	6	2203106	2203111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_013501	CGTC	2	8	2203114	2203121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_013501	CAG	2	6	2203146	2203151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_013501	AC	3	6	2203152	2203157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_013501	GAT	2	6	2203175	2203180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_013501	GTT	2	6	2203201	2203206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_013501	CTC	2	6	2203223	2203228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3547	NC_013501	ACGG	2	8	2203258	2203265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_013501	GGCT	2	8	2203339	2203346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_013501	TGC	2	6	2203398	2203403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_013501	GTT	2	6	2203415	2203420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013501	CTT	2	6	2203430	2203435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_013501	GAGC	2	8	2203457	2203464	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3553	NC_013501	GT	3	6	2203484	2203489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_013501	GAC	2	6	2204167	2204172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_013501	ACT	2	6	2206372	2206377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_013501	ACA	2	6	2206382	2206387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_013501	ACA	2	6	2206411	2206416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_013501	AC	3	6	2206421	2206426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_013501	ACGT	2	8	2206468	2206475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_013501	GCCA	2	8	2206494	2206501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_013501	CAG	2	6	2206638	2206643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_013501	CA	3	6	2206667	2206672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_013501	A	6	6	2208578	2208583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013501	T	6	6	2212828	2212833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_013501	GTTG	2	8	2215149	2215156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_013501	TCCC	2	8	2217075	2217082	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3567	NC_013501	TGA	2	6	2217089	2217094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_013501	T	6	6	2218929	2218934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_013501	ACGAA	2	10	2218950	2218959	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3570	NC_013501	T	7	7	2219041	2219047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_013501	TAA	2	6	2222092	2222097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_013501	A	7	7	2222560	2222566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_013501	TTTG	2	8	2225018	2225025	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_013501	ATC	2	6	2225049	2225054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_013501	CGAA	2	8	2228162	2228169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3576	NC_013501	GCCG	2	8	2228224	2228231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_013501	A	6	6	2229350	2229355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_013501	GACC	2	8	2229377	2229384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_013501	CTG	2	6	2229388	2229393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_013501	CAAC	2	8	2229394	2229401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_013501	CAGG	2	8	2231552	2231559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3582	NC_013501	CCT	2	6	2235920	2235925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_013501	CAA	2	6	2235937	2235942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_013501	A	6	6	2235941	2235946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_013501	AAAGG	2	10	2235989	2235998	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_013501	CCT	2	6	2236190	2236195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_013501	AC	3	6	2236264	2236269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_013501	CAA	2	6	2236951	2236956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_013501	TTC	2	6	2236974	2236979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_013501	CGAG	2	8	2236996	2237003	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3591	NC_013501	CAG	2	6	2237019	2237024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_013501	GGT	2	6	2237027	2237032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_013501	CGG	2	6	2241884	2241889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_013501	GC	3	6	2241934	2241939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_013501	CTTCG	2	10	2242032	2242041	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3596	NC_013501	TGT	2	6	2242078	2242083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_013501	A	6	6	2242093	2242098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_013501	GT	3	6	2242141	2242146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_013501	GC	3	6	2242151	2242156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_013501	GTTT	2	8	2243794	2243801	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_013501	A	6	6	2243834	2243839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_013501	ACGA	2	8	2243845	2243852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3603	NC_013501	T	6	6	2244183	2244188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_013501	TGG	2	6	2244194	2244199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_013501	GAA	2	6	2244313	2244318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_013501	AAAC	2	8	2244325	2244332	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_013501	CCA	2	6	2244883	2244888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_013501	CCAT	2	8	2245983	2245990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_013501	CGA	2	6	2246010	2246015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_013501	CGG	2	6	2247185	2247190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_013501	GCAG	2	8	2247194	2247201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_013501	GAA	2	6	2249491	2249496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_013501	GAAA	2	8	2249840	2249847	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_013501	GTCC	2	8	2249872	2249879	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_013501	AGA	2	6	2250912	2250917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_013501	CTT	2	6	2250939	2250944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_013501	T	6	6	2250943	2250948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_013501	ACG	2	6	2250969	2250974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_013501	ACC	2	6	2250999	2251004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_013501	GC	3	6	2251035	2251040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_013501	ACG	2	6	2251059	2251064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_013501	GCCT	2	8	2251082	2251089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_013501	CAA	2	6	2251103	2251108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_013501	A	6	6	2251107	2251112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_013501	GGCG	2	8	2251129	2251136	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3626	NC_013501	CAC	2	6	2251302	2251307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_013501	GTG	2	6	2251311	2251316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_013501	TGG	2	6	2251384	2251389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_013501	TCGCT	2	10	2254361	2254370	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3630	NC_013501	GTA	2	6	2254401	2254406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_013501	AGC	2	6	2254426	2254431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_013501	GCCGG	2	10	2255428	2255437	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3633	NC_013501	CGG	2	6	2255446	2255451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3636	NC_013501	CAAC	2	8	2258177	2258184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3750	NC_013501	TCG	2	6	2326766	2326771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3755	NC_013501	ATT	2	6	2330264	2330269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3756	NC_013501	ATG	2	6	2330379	2330384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3758	NC_013501	CGT	2	6	2330393	2330398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3759	NC_013501	TG	4	8	2330418	2330425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3760	NC_013501	ATG	2	6	2330469	2330474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3761	NC_013501	GAT	3	9	2330477	2330485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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