MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 5442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013501	GCA	2	6	2805471	2805476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_013501	GC	3	6	2805481	2805486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_013501	TGC	2	6	2805490	2805495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_013501	GGA	2	6	2805500	2805505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_013501	GAC	2	6	2805551	2805556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_013501	CGG	2	6	2805572	2805577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_013501	CAG	2	6	2806774	2806779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_013501	AC	3	6	2806782	2806787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_013501	A	7	7	2809434	2809440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_013501	ATG	2	6	2809514	2809519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_013501	GC	3	6	2809521	2809526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_013501	ACC	2	6	2809565	2809570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_013501	GCC	2	6	2809601	2809606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_013501	CCGC	2	8	2809697	2809704	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4515	NC_013501	CCA	2	6	2809740	2809745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_013501	CAC	2	6	2809806	2809811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_013501	CAG	2	6	2809812	2809817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_013501	TCC	2	6	2809827	2809832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_013501	CAC	2	6	2809849	2809854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_013501	GAC	2	6	2809890	2809895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_013501	CGC	2	6	2810661	2810666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_013501	A	6	6	2813871	2813876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_013501	AGA	2	6	2816089	2816094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_013501	CCG	2	6	2816099	2816104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_013501	GAG	2	6	2817128	2817133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_013501	CGG	2	6	2817766	2817771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_013501	CCG	2	6	2817777	2817782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_013501	CGGC	2	8	2817871	2817878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_013501	CA	3	6	2818905	2818910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_013501	AGC	2	6	2818985	2818990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_013501	A	7	7	2819018	2819024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_013501	CG	3	6	2819044	2819049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_013501	GCA	2	6	2819065	2819070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_013501	GCC	2	6	2821249	2821254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_013501	T	6	6	2821255	2821260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_013501	CTCCG	2	10	2821322	2821331	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4537	NC_013501	CGCC	2	8	2821364	2821371	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4538	NC_013501	T	7	7	2821388	2821394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_013501	CA	3	6	2821395	2821400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_013501	CCA	2	6	2825161	2825166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_013501	CTT	2	6	2827292	2827297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_013501	TGCGC	2	10	2828794	2828803	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4543	NC_013501	GT	3	6	2828815	2828820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_013501	GTA	2	6	2828823	2828828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_013501	CTTCG	2	10	2828872	2828881	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4546	NC_013501	GC	3	6	2828900	2828905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_013501	GTT	2	6	2828957	2828962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_013501	GTG	2	6	2829030	2829035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_013501	CTGAAA	2	12	2829040	2829051	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4550	NC_013501	T	9	9	2829473	2829481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_013501	A	6	6	2829486	2829491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_013501	AAC	2	6	2832001	2832006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_013501	A	6	6	2832038	2832043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_013501	A	6	6	2832049	2832054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_013501	T	8	8	2832064	2832071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_013501	GAC	2	6	2832141	2832146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_013501	GACAC	2	10	2832177	2832186	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4558	NC_013501	GTTC	2	8	2832226	2832233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_013501	CGC	2	6	2832251	2832256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_013501	ATG	2	6	2832308	2832313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_013501	AGC	2	6	2836681	2836686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_013501	CTG	2	6	2836707	2836712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_013501	AGC	2	6	2836725	2836730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_013501	CCGGC	2	10	2836733	2836742	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4565	NC_013501	GCT	2	6	2836764	2836769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_013501	CCT	2	6	2839471	2839476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4567	NC_013501	GAT	2	6	2839493	2839498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_013501	TA	3	6	2842600	2842605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_013501	CAA	2	6	2842668	2842673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_013501	ACC	2	6	2842674	2842679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_013501	ACG	2	6	2842692	2842697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_013501	CAG	2	6	2849777	2849782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_013501	GC	3	6	2849855	2849860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_013501	CGT	2	6	2849872	2849877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_013501	CG	3	6	2849940	2849945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_013501	GCCC	2	8	2850150	2850157	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4577	NC_013501	AGGT	2	8	2850165	2850172	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_013501	CAG	2	6	2850173	2850178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_013501	GC	3	6	2850207	2850212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4580	NC_013501	AGCG	2	8	2850239	2850246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4581	NC_013501	CCA	2	6	2850262	2850267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_013501	TGA	2	6	2850280	2850285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_013501	AGT	2	6	2850301	2850306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_013501	CAC	2	6	2850311	2850316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_013501	ACC	2	6	2850405	2850410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4586	NC_013501	GTA	2	6	2850464	2850469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_013501	GCG	2	6	2850488	2850493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_013501	TGG	2	6	2850523	2850528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_013501	GCC	2	6	2850594	2850599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_013501	CGAT	2	8	2850633	2850640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4591	NC_013501	GCC	2	6	2850645	2850650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_013501	GCC	2	6	2850701	2850706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_013501	CGC	2	6	2850730	2850735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4594	NC_013501	CCA	2	6	2850796	2850801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_013501	AGC	2	6	2850852	2850857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_013501	CGC	2	6	2850926	2850931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_013501	GCC	3	9	2850942	2850950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_013501	ACG	2	6	2850954	2850959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_013501	CGT	2	6	2850985	2850990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_013501	GTT	2	6	2851082	2851087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_013501	ACCAGC	2	12	2851118	2851129	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_013501	TGCC	2	8	2851133	2851140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_013501	GTA	2	6	2851154	2851159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_013501	GCA	2	6	2851210	2851215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_013501	CTT	2	6	2851255	2851260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_013501	GTC	2	6	2851277	2851282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_013501	GCC	2	6	2851335	2851340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_013501	GCC	2	6	2851380	2851385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_013501	TGA	2	6	2851420	2851425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_013501	CAC	2	6	2851430	2851435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_013501	CGA	2	6	2851477	2851482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_013501	ATC	2	6	2851575	2851580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_013501	GGCC	2	8	2851672	2851679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_013501	GA	3	6	2851686	2851691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_013501	GCC	2	6	2851697	2851702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4616	NC_013501	AGC	2	6	2851758	2851763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_013501	CAC	3	9	2851787	2851795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4618	NC_013501	GGGC	2	8	2851813	2851820	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4619	NC_013501	TGCG	2	8	2851869	2851876	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_013501	GGT	2	6	2851958	2851963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_013501	ACG	2	6	2851989	2851994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_013501	CGC	2	6	2852009	2852014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_013501	AGCC	2	8	2852082	2852089	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_013501	CAG	2	6	2852090	2852095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_013501	AGC	2	6	2852106	2852111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_013501	A	7	7	2852202	2852208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_013501	CAAA	2	8	2852751	2852758	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4628	NC_013501	AAAG	2	8	2852763	2852770	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_013501	AAC	2	6	2856128	2856133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_013501	GCC	2	6	2856149	2856154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4631	NC_013501	GGT	2	6	2856211	2856216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4795	NC_013501	CCAG	2	8	2919267	2919274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4885	NC_013501	AAGC	2	8	2969435	2969442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4886	NC_013501	GGAA	2	8	2969495	2969502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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