MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 5275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013222	AAACC	2	10	3338502	3338511	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5002	NC_013222	TACG	2	8	3338527	3338534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_013222	TA	3	6	3338612	3338617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_013222	T	6	6	3338655	3338660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_013222	T	7	7	3340043	3340049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_013222	GC	3	6	3340365	3340370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_013222	CAG	2	6	3345115	3345120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_013222	CCCGG	2	10	3345142	3345151	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5009	NC_013222	GCC	2	6	3345160	3345165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_013222	CGC	2	6	3345168	3345173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_013222	TTTA	2	8	3346190	3346197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_013222	A	6	6	3346213	3346218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_013222	GGC	2	6	3348131	3348136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_013222	TCC	2	6	3349607	3349612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_013222	TTTA	2	8	3349627	3349634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_013222	TAAT	2	8	3349659	3349666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_013222	CGG	2	6	3352874	3352879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_013222	TA	3	6	3352904	3352909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_013222	TA	3	6	3352937	3352942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_013222	AGG	2	6	3353029	3353034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_013222	AAT	2	6	3353611	3353616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_013222	TGC	2	6	3353656	3353661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_013222	CAA	2	6	3353697	3353702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_013222	GGA	2	6	3354391	3354396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_013222	TGCC	2	8	3354408	3354415	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_013222	CGG	2	6	3355651	3355656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_013222	A	6	6	3357630	3357635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_013222	A	7	7	3359132	3359138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_013222	T	8	8	3359168	3359175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_013222	T	6	6	3361530	3361535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_013222	GCTACA	2	12	3362178	3362189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_013222	GCC	2	6	3362237	3362242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_013222	GCCG	2	8	3362257	3362264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_013222	TG	3	6	3363870	3363875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_013222	ATAAAG	2	12	3363882	3363893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_013222	AATAA	2	10	3363908	3363917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_013222	GGCA	2	8	3363923	3363930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_013222	GCACCT	2	12	3364021	3364032	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_013222	CGGG	2	8	3364042	3364049	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_013222	TAT	2	6	3364115	3364120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_013222	TTTG	2	8	3364122	3364129	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_013222	ACG	2	6	3364173	3364178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_013222	CAG	2	6	3369431	3369436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_013222	CAA	2	6	3369512	3369517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_013222	CTG	2	6	3374324	3374329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_013222	CGGG	3	12	3374362	3374373	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_013222	AAC	2	6	3375199	3375204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_013222	T	6	6	3376015	3376020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_013222	ATTT	2	8	3376134	3376141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_013222	GCC	2	6	3376328	3376333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_013222	TGAAAA	2	12	3376373	3376384	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_013222	T	6	6	3376406	3376411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_013222	TGA	2	6	3376415	3376420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_013222	GGC	2	6	3376782	3376787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_013222	TGAT	2	8	3376847	3376854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_013222	AAT	2	6	3376859	3376864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_013222	TA	3	6	3376875	3376880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_013222	CGG	3	9	3376959	3376967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_013222	GAAA	2	8	3377015	3377022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_013222	A	7	7	3382322	3382328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_013222	GCA	2	6	3382336	3382341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_013222	TAC	2	6	3388566	3388571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_013222	AAAG	2	8	3388575	3388582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_013222	ATT	2	6	3388591	3388596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_013222	T	7	7	3388602	3388608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_013222	CGG	2	6	3388631	3388636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_013222	T	7	7	3391509	3391515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_013222	A	7	7	3391560	3391566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_013222	T	7	7	3393278	3393284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_013222	TTA	2	6	3393442	3393447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_013222	GCA	2	6	3395482	3395487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_013222	TCT	2	6	3396685	3396690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_013222	CAG	2	6	3396726	3396731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_013222	A	6	6	3396776	3396781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_013222	GAAA	2	8	3396848	3396855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_013222	GAC	2	6	3396891	3396896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_013222	GCTG	2	8	3399778	3399785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5078	NC_013222	CCG	2	6	3399787	3399792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_013222	CTG	2	6	3399894	3399899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_013222	GC	3	6	3399926	3399931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_013222	TAT	3	9	3404689	3404697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_013222	A	6	6	3404726	3404731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_013222	ATT	2	6	3406814	3406819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_013222	AATC	2	8	3406843	3406850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5085	NC_013222	ACA	2	6	3406870	3406875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_013222	TGTT	2	8	3407184	3407191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_013222	CGG	2	6	3407195	3407200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_013222	CACAA	2	10	3407279	3407288	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5089	NC_013222	T	7	7	3409641	3409647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_013222	A	6	6	3409661	3409666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_013222	TA	3	6	3409736	3409741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_013222	GGA	2	6	3410623	3410628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_013222	TAAA	2	8	3410644	3410651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_013222	CAG	2	6	3410699	3410704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_013222	T	6	6	3410721	3410726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_013222	TGA	2	6	3410730	3410735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_013222	CGGC	2	8	3411565	3411572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5098	NC_013222	A	6	6	3411608	3411613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_013222	AGG	2	6	3411640	3411645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_013222	CAT	2	6	3411646	3411651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_013222	ATG	2	6	3412108	3412113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_013222	GGA	2	6	3412243	3412248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_013222	CAGC	2	8	3413257	3413264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_013222	TTC	2	6	3413289	3413294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_013222	ATT	2	6	3413333	3413338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_013222	A	6	6	3413346	3413351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_013222	TCC	2	6	3413362	3413367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_013222	ATTA	2	8	3413475	3413482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_013222	C	7	7	3413673	3413679	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5110	NC_013222	G	6	6	3413698	3413703	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_013222	A	7	7	3413725	3413731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_013222	GGA	2	6	3418017	3418022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_013222	AAT	2	6	3418326	3418331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_013222	CAA	2	6	3419059	3419064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_013222	CGCC	2	8	3419093	3419100	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5116	NC_013222	GAA	2	6	3421424	3421429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_013222	GC	3	6	3421430	3421435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5118	NC_013222	C	6	6	3424162	3424167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5119	NC_013222	CGT	2	6	3424195	3424200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_013222	GATG	2	8	3424203	3424210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_013222	TC	3	6	3424295	3424300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_013222	ATT	2	6	3424865	3424870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_013222	AAC	2	6	3424871	3424876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_013222	CCG	2	6	3426260	3426265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_013222	GCC	2	6	3427629	3427634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_013222	GCCG	2	8	3427638	3427645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_013222	CTT	2	6	3430792	3430797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_013222	GC	3	6	3431366	3431371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_013222	CCCG	2	8	3431892	3431899	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5130	NC_013222	GTTC	2	8	3431934	3431941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5131	NC_013222	GTT	2	6	3434064	3434069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_013222	C	6	6	3437445	3437450	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5133	NC_013222	GA	3	6	3437479	3437484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_013222	TCC	2	6	3438538	3438543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5135	NC_013222	GTT	2	6	3447628	3447633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_013222	TAT	2	6	3447637	3447642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_013222	AT	3	6	3447652	3447657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_013222	ATT	2	6	3447662	3447667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5142	NC_013222	CAG	2	6	3449354	3449359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5164	NC_013222	TGGA	2	8	3462153	3462160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_013222	GCCA	2	8	3462183	3462190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5175	NC_013222	T	7	7	3468863	3468869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5176	NC_013222	TCAT	3	12	3468922	3468933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5179	NC_013222	GTT	2	6	3470202	3470207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5182	NC_013222	A	6	6	3474323	3474328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5187	NC_013222	GCCGG	2	10	3477216	3477225	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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5189	NC_013222	AATGC	2	10	3478045	3478054	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5197	NC_013222	GCCAA	2	10	3486203	3486212	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5242	NC_013222	ACAAA	2	10	3516445	3516454	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5245	NC_013222	GC	3	6	3516679	3516684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5249	NC_013222	A	7	7	3519549	3519555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_013222	ACT	2	6	3520073	3520078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5252	NC_013222	ATT	2	6	3521020	3521025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_013222	AGC	2	6	3525200	3525205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5255	NC_013222	TAT	2	6	3528395	3528400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_013222	GCAT	2	8	3528401	3528408	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5257	NC_013222	T	7	7	3528411	3528417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_013222	CA	3	6	3528492	3528497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5259	NC_013222	TCC	2	6	3530051	3530056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5260	NC_013222	CCT	2	6	3530058	3530063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5261	NC_013222	GTG	2	6	3530080	3530085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_013222	CCT	2	6	3530120	3530125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5263	NC_013222	TGG	2	6	3530141	3530146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_013222	GTG	2	6	3530149	3530154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_013222	CTG	2	6	3530161	3530166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5266	NC_013222	ATC	2	6	3530191	3530196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5267	NC_013222	CTG	2	6	3530236	3530241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5268	NC_013222	ATC	2	6	3530242	3530247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5269	NC_013222	ATC	2	6	3530257	3530262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5270	NC_013222	TTA	2	6	3530279	3530284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_013222	TGG	2	6	3530308	3530313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_013222	T	6	6	3530321	3530326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5273	NC_013222	CCT	2	6	3530328	3530333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5274	NC_013222	TCC	2	6	3530342	3530347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5275	NC_013222	GAAGA	2	10	3530374	3530383	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.