MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 2108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012858	GGT	2	6	613513	613518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_012858	GC	3	6	613536	613541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2003	NC_012858	GCG	2	6	613557	613562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_012858	CTA	2	6	613636	613641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_012858	GGA	2	6	613738	613743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_012858	GGC	2	6	613756	613761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_012858	CGC	2	6	613840	613845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2008	NC_012858	GGCCG	2	10	613865	613874	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2009	NC_012858	CG	3	6	613893	613898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2010	NC_012858	CGG	2	6	613941	613946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_012858	CTCA	2	8	613947	613954	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2012	NC_012858	CCGGGC	2	12	614122	614133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2013	NC_012858	CGC	2	6	614231	614236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2014	NC_012858	TCC	2	6	614295	614300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2015	NC_012858	CTT	3	9	614337	614345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_012858	T	6	6	614392	614397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_012858	GC	3	6	614415	614420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2018	NC_012858	GCA	2	6	616462	616467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_012858	CGG	2	6	618664	618669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_012858	ATG	2	6	618681	618686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_012858	TTG	2	6	619024	619029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_012858	CAA	2	6	619529	619534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_012858	TTGC	2	8	619564	619571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2024	NC_012858	T	6	6	619604	619609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_012858	A	6	6	619625	619630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_012858	TC	3	6	620519	620524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2027	NC_012858	TCC	2	6	621398	621403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2028	NC_012858	GTTT	2	8	621478	621485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_012858	ATC	2	6	621502	621507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_012858	GAA	2	6	621511	621516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_012858	GGA	2	6	621531	621536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_012858	TCC	2	6	621661	621666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2033	NC_012858	AG	3	6	621676	621681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_012858	GGC	2	6	621713	621718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2035	NC_012858	TGG	2	6	621765	621770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_012858	ACG	2	6	621771	621776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_012858	CGA	2	6	622609	622614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NC_012858	CGGC	2	8	622617	622624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2039	NC_012858	CTA	2	6	624038	624043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2040	NC_012858	GGC	2	6	624088	624093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2041	NC_012858	GCTT	2	8	624097	624104	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2042	NC_012858	CAG	2	6	624158	624163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_012858	CGG	2	6	626795	626800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_012858	GTT	2	6	627554	627559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_012858	TC	3	6	627590	627595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2046	NC_012858	GAT	2	6	629452	629457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_012858	TAA	2	6	629474	629479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_012858	ATG	2	6	629511	629516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_012858	CAT	2	6	629545	629550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2050	NC_012858	ATC	2	6	629656	629661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_012858	GCG	2	6	630303	630308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2052	NC_012858	CCTT	2	8	630399	630406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2053	NC_012858	A	6	6	630482	630487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_012858	GAC	2	6	630568	630573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_012858	GGC	2	6	631041	631046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_012858	AAT	2	6	631051	631056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_012858	CCCT	2	8	631063	631070	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2058	NC_012858	CAAG	2	8	631071	631078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2059	NC_012858	CAGT	2	8	631104	631111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2060	NC_012858	AGG	2	6	631150	631155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_012858	GAG	2	6	633132	633137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_012858	AATG	2	8	638501	638508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_012858	TCA	2	6	641080	641085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_012858	CG	3	6	641146	641151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2065	NC_012858	CGA	2	6	641581	641586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2066	NC_012858	GGT	2	6	641647	641652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_012858	AAT	2	6	641653	641658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_012858	CAAG	2	8	642000	642007	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2069	NC_012858	TCG	2	6	642011	642016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2070	NC_012858	AGC	2	6	642029	642034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2071	NC_012858	GGC	2	6	642039	642044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2072	NC_012858	CAG	2	6	642058	642063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2073	NC_012858	GCTT	2	8	642080	642087	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2074	NC_012858	ATC	2	6	642092	642097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2075	NC_012858	CG	3	6	642135	642140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2076	NC_012858	ATC	2	6	642220	642225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2077	NC_012858	GTG	2	6	642229	642234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2078	NC_012858	GGC	2	6	642252	642257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2079	NC_012858	GGC	2	6	642312	642317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2080	NC_012858	CACG	2	8	642332	642339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2081	NC_012858	TAAA	2	8	642378	642385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2082	NC_012858	ATG	2	6	642402	642407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2083	NC_012858	CG	3	6	642473	642478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2084	NC_012858	GAT	2	6	642484	642489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2085	NC_012858	AGC	2	6	642516	642521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2086	NC_012858	TCCG	2	8	645228	645235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2087	NC_012858	CTC	2	6	652987	652992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2088	NC_012858	GTTT	2	8	653001	653008	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_012858	CGG	2	6	653109	653114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2090	NC_012858	TTG	2	6	653122	653127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2091	NC_012858	AAACG	2	10	653180	653189	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2092	NC_012858	CGG	2	6	653216	653221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2093	NC_012858	T	7	7	653244	653250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_012858	GAA	2	6	653289	653294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_012858	AGA	2	6	653359	653364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2096	NC_012858	CCGC	2	8	653389	653396	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2097	NC_012858	GTT	2	6	653415	653420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_012858	TGA	2	6	653421	653426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_012858	TGG	2	6	653449	653454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_012858	CGCC	2	8	653459	653466	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2101	NC_012858	GA	4	8	653477	653484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_012858	GAT	2	6	654790	654795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_012858	ATC	2	6	654817	654822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2104	NC_012858	TA	3	6	654834	654839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_012858	ATG	2	6	654848	654853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_012858	ATG	2	6	659952	659957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_012858	AAGA	2	8	660003	660010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_012858	TAG	2	6	660028	660033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.