MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 12330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012850	AG	3	6	1097288	1097293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_012850	ACG	2	6	1097311	1097316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_012850	CG	3	6	1097315	1097320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_012850	T	6	6	1097335	1097340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_012850	CTG	2	6	1097344	1097349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_012850	CGATG	2	10	1097356	1097365	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3007	NC_012850	T	6	6	1097387	1097392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_012850	CATA	2	8	1097404	1097411	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_012850	CGATG	2	10	1097444	1097453	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3010	NC_012850	TCA	2	6	1097720	1097725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_012850	GAT	2	6	1097804	1097809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_012850	TCC	2	6	1098830	1098835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_012850	ATG	2	6	1098836	1098841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_012850	ACA	2	6	1098886	1098891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_012850	GCG	2	6	1098939	1098944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_012850	TTTG	2	8	1099091	1099098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_012850	T	6	6	1099126	1099131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_012850	CCG	2	6	1099177	1099182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_012850	CAAT	2	8	1099546	1099553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_012850	AGC	2	6	1099561	1099566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_012850	AAC	2	6	1099570	1099575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_012850	GAGAA	2	10	1099624	1099633	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_012850	TCC	2	6	1099647	1099652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_012850	TTC	2	6	1099664	1099669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_012850	GCAA	2	8	1100852	1100859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_012850	ATT	2	6	1100861	1100866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_012850	GCCG	2	8	1101928	1101935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_012850	CGC	2	6	1101939	1101944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_012850	GC	3	6	1102017	1102022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_012850	GAC	2	6	1102030	1102035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_012850	GGA	2	6	1103489	1103494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_012850	GAA	2	6	1104097	1104102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_012850	GAA	2	6	1104117	1104122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_012850	CGG	2	6	1104236	1104241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_012850	GGC	2	6	1104346	1104351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_012850	CCT	2	6	1104903	1104908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_012850	TGA	2	6	1106561	1106566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_012850	TCC	2	6	1106567	1106572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_012850	C	6	6	1106652	1106657	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3040	NC_012850	GCC	2	6	1107618	1107623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_012850	TCC	2	6	1107878	1107883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_012850	TGGA	2	8	1107893	1107900	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_012850	GCG	2	6	1107916	1107921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_012850	ATT	2	6	1107937	1107942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_012850	TCCCC	2	10	1108788	1108797	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3046	NC_012850	CCTT	2	8	1108856	1108863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_012850	T	6	6	1108862	1108867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_012850	GCC	2	6	1108875	1108880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_012850	TCCC	2	8	1108911	1108918	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3050	NC_012850	GCTCT	2	10	1109905	1109914	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3051	NC_012850	A	6	6	1109919	1109924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_012850	TCC	2	6	1111793	1111798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_012850	TCTT	2	8	1111804	1111811	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3054	NC_012850	TCCC	2	8	1111822	1111829	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3055	NC_012850	CGC	2	6	1111880	1111885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_012850	TCC	2	6	1111892	1111897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_012850	TCCC	2	8	1111941	1111948	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3058	NC_012850	TCC	2	6	1113926	1113931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_012850	AAT	2	6	1113971	1113976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_012850	GAA	2	6	1115008	1115013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_012850	CG	3	6	1115070	1115075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_012850	GGA	2	6	1115083	1115088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_012850	GCG	2	6	1116338	1116343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_012850	CGA	2	6	1117631	1117636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_012850	TCT	2	6	1117721	1117726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_012850	A	6	6	1117738	1117743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_012850	TCT	2	6	1117864	1117869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_012850	A	7	7	1117952	1117958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_012850	TC	3	6	1117959	1117964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_012850	CGAG	2	8	1117970	1117977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3071	NC_012850	A	6	6	1118098	1118103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_012850	TTG	2	6	1118141	1118146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_012850	CTT	2	6	1118347	1118352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_012850	GCT	2	6	1118378	1118383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_012850	GCTT	2	8	1120475	1120482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3076	NC_012850	ATTC	2	8	1122656	1122663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_012850	GC	3	6	1122700	1122705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3078	NC_012850	GAT	2	6	1122713	1122718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_012850	GAG	2	6	1122782	1122787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_012850	TC	3	6	1123707	1123712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_012850	A	6	6	1123758	1123763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_012850	TCG	2	6	1124293	1124298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_012850	GAT	2	6	1124316	1124321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_012850	CCAAT	2	10	1124917	1124926	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3085	NC_012850	TAAA	2	8	1124958	1124965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_012850	TTTCGA	2	12	1124980	1124991	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3087	NC_012850	ATT	2	6	1125011	1125016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_012850	AT	3	6	1125018	1125023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_012850	GAC	2	6	1125187	1125192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_012850	TCGCA	2	10	1125634	1125643	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3091	NC_012850	CGA	2	6	1125706	1125711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_012850	ATT	2	6	1125751	1125756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_012850	TG	3	6	1125762	1125767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_012850	GC	3	6	1125784	1125789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3095	NC_012850	TTTTAT	2	12	1125790	1125801	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_012850	TTA	2	6	1128056	1128061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_012850	AGTG	2	8	1128145	1128152	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_012850	GGT	3	9	1128173	1128181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_012850	CTG	2	6	1128191	1128196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_012850	TCT	2	6	1128203	1128208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_012850	AGA	2	6	1128227	1128232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_012850	GAA	2	6	1128455	1128460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_012850	CTC	2	6	1128462	1128467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_012850	AG	3	6	1128473	1128478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_012850	TGG	2	6	1128525	1128530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_012850	TGCAC	2	10	1128533	1128542	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3107	NC_012850	TCG	2	6	1129642	1129647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_012850	TGT	2	6	1129655	1129660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_012850	AG	3	6	1129690	1129695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_012850	AGAA	2	8	1129702	1129709	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_012850	GCC	2	6	1129714	1129719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_012850	GCG	2	6	1129720	1129725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_012850	A	6	6	1132203	1132208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_012850	TGA	2	6	1132251	1132256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_012850	GC	3	6	1132260	1132265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_012850	GC	3	6	1132274	1132279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_012850	CGG	2	6	1132291	1132296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_012850	AGC	2	6	1133163	1133168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_012850	T	6	6	1133180	1133185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_012850	AGC	2	6	1133197	1133202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_012850	CGT	2	6	1133221	1133226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_012850	TCC	2	6	1133230	1133235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_012850	TTGCA	2	10	1133777	1133786	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3124	NC_012850	GGAT	2	8	1133840	1133847	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_012850	CTT	2	6	1133864	1133869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_012850	T	6	6	1134650	1134655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_012850	TCC	2	6	1134670	1134675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_012850	CCT	2	6	1134705	1134710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_012850	AGG	2	6	1134735	1134740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_012850	CGGA	2	8	1135771	1135778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_012850	CCG	2	6	1137351	1137356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_012850	GGAAT	2	10	1137371	1137380	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_012850	GCGG	2	8	1137381	1137388	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3134	NC_012850	GAC	2	6	1139391	1139396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3137	NC_012850	GATT	2	8	1139475	1139482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_012850	CTG	2	6	1139499	1139504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3143	NC_012850	ACC	2	6	1139780	1139785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3247	NC_012850	TTCT	2	8	1205909	1205916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3248	NC_012850	GACG	2	8	1205947	1205954	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3251	NC_012850	TA	3	6	1208824	1208829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_012850	TAT	2	6	1208872	1208877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3263	NC_012850	CAG	2	6	1210137	1210142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3264	NC_012850	CTT	2	6	1210199	1210204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3295	NC_012850	CG	3	6	1227464	1227469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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