MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 12330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012850	GAC	2	6	4433430	4433435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_012850	AGAGG	2	10	4433473	4433482	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_012850	CGG	2	6	4433512	4433517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_012850	GGT	2	6	4433730	4433735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_012850	ACC	2	6	4433783	4433788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11506	NC_012850	TCCGGG	2	12	4433823	4433834	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_012850	TGG	2	6	4433843	4433848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_012850	GC	3	6	4433890	4433895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11509	NC_012850	TGG	2	6	4433898	4433903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_012850	GTC	2	6	4433925	4433930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_012850	GGT	2	6	4434006	4434011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_012850	TGA	2	6	4434067	4434072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_012850	GTT	2	6	4434097	4434102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_012850	CGT	2	6	4434201	4434206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_012850	TGG	2	6	4434294	4434299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_012850	TGT	2	6	4434303	4434308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_012850	GAC	2	6	4434416	4434421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_012850	GTC	2	6	4434538	4434543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_012850	AAGGCG	2	12	4434549	4434560	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11520	NC_012850	TGG	2	6	4434685	4434690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_012850	TCT	2	6	4434825	4434830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_012850	AGC	2	6	4434938	4434943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_012850	AGA	2	6	4435060	4435065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_012850	CTC	2	6	4435113	4435118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11525	NC_012850	CAAA	2	8	4435171	4435178	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11526	NC_012850	GCC	2	6	4435181	4435186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11527	NC_012850	GGC	2	6	4435192	4435197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_012850	TTTG	2	8	4435200	4435207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_012850	AAG	2	6	4435247	4435252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_012850	TCCT	2	8	4435306	4435313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11531	NC_012850	CTT	2	6	4435333	4435338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_012850	CTC	2	6	4435379	4435384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11533	NC_012850	GCCC	2	8	4435429	4435436	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11534	NC_012850	AAT	2	6	4435504	4435509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_012850	TCGGAT	2	12	4435584	4435595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11536	NC_012850	GAG	2	6	4438991	4438996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_012850	CTT	2	6	4439016	4439021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_012850	C	6	6	4440771	4440776	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11539	NC_012850	GAT	2	6	4440845	4440850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_012850	ATCC	2	8	4441553	4441560	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11541	NC_012850	ACATT	2	10	4441580	4441589	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11542	NC_012850	AAC	2	6	4441592	4441597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_012850	CCG	2	6	4447394	4447399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11544	NC_012850	CGT	2	6	4447405	4447410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_012850	GTC	2	6	4447414	4447419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_012850	A	6	6	4448461	4448466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_012850	AGC	2	6	4448471	4448476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_012850	CGCT	2	8	4448516	4448523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11549	NC_012850	TCG	2	6	4448574	4448579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_012850	TTG	2	6	4448584	4448589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_012850	ACGT	2	8	4448611	4448618	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11552	NC_012850	CTTT	2	8	4448680	4448687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11553	NC_012850	GAC	2	6	4448762	4448767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_012850	A	6	6	4448784	4448789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_012850	GTC	2	6	4448861	4448866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_012850	GCG	2	6	4448890	4448895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_012850	AGC	2	6	4448902	4448907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_012850	GAG	2	6	4448943	4448948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_012850	ACCC	2	8	4448980	4448987	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11560	NC_012850	TA	3	6	4449070	4449075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_012850	GTATC	2	10	4449103	4449112	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11562	NC_012850	TCCT	2	8	4449150	4449157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11563	NC_012850	A	6	6	4449192	4449197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_012850	CTTT	2	8	4450081	4450088	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11565	NC_012850	GCCGT	2	10	4450456	4450465	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11566	NC_012850	GCG	2	6	4450524	4450529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_012850	GTT	2	6	4450540	4450545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_012850	GAA	2	6	4450590	4450595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_012850	ATT	2	6	4450606	4450611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_012850	AGT	2	6	4450666	4450671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_012850	GAA	2	6	4450685	4450690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_012850	TTA	2	6	4450702	4450707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_012850	AGG	2	6	4450718	4450723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_012850	ATAA	2	8	4450764	4450771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_012850	CGG	2	6	4454681	4454686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_012850	GGA	2	6	4454707	4454712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_012850	CCG	2	6	4456247	4456252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11578	NC_012850	TCC	2	6	4457582	4457587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11579	NC_012850	TCC	2	6	4457610	4457615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11580	NC_012850	A	8	8	4457653	4457660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_012850	TAT	2	6	4457661	4457666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_012850	AAG	2	6	4457670	4457675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_012850	GAT	2	6	4458746	4458751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_012850	GAGGCC	2	12	4458753	4458764	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11585	NC_012850	ATG	2	6	4458803	4458808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_012850	TCC	2	6	4463039	4463044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11587	NC_012850	TGA	2	6	4463053	4463058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_012850	TCC	2	6	4463911	4463916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11589	NC_012850	CG	3	6	4463931	4463936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11590	NC_012850	TGC	2	6	4463976	4463981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_012850	GCA	2	6	4464026	4464031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_012850	CAG	2	6	4466367	4466372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_012850	GCG	2	6	4466379	4466384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_012850	TCC	2	6	4466406	4466411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11595	NC_012850	AGA	2	6	4466443	4466448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_012850	TGC	2	6	4466676	4466681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_012850	CGC	2	6	4467479	4467484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11598	NC_012850	TTAT	2	8	4467511	4467518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_012850	GGA	3	9	4467563	4467571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_012850	AAG	2	6	4471818	4471823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_012850	AG	3	6	4471822	4471827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_012850	CCG	2	6	4472922	4472927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11603	NC_012850	TCC	2	6	4472940	4472945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11604	NC_012850	CAT	2	6	4472953	4472958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_012850	CT	3	6	4476321	4476326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11606	NC_012850	GAG	2	6	4476366	4476371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_012850	CTGCC	2	10	4476395	4476404	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11608	NC_012850	CTG	2	6	4476472	4476477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_012850	GTT	2	6	4476486	4476491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_012850	GATA	2	8	4476560	4476567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_012850	AGC	2	6	4476607	4476612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_012850	G	6	6	4477890	4477895	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_012850	CTA	2	6	4477951	4477956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_012850	CTC	2	6	4477975	4477980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11615	NC_012850	AGA	2	6	4477987	4477992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_012850	TCC	2	6	4480889	4480894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11617	NC_012850	CGG	2	6	4481001	4481006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_012850	AGG	2	6	4481052	4481057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_012850	GAT	2	6	4481309	4481314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_012850	TCC	2	6	4482806	4482811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11621	NC_012850	TCCG	2	8	4482889	4482896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11622	NC_012850	TA	3	6	4484305	4484310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_012850	T	6	6	4484348	4484353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_012850	G	6	6	4484387	4484392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_012850	GCG	2	6	4485285	4485290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11626	NC_012850	GCT	2	6	4485329	4485334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11628	NC_012850	CGAA	2	8	4485416	4485423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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