MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 12330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_012850	GCC	2	6	4190990	4190995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11002	NC_012850	TTA	2	6	4192554	4192559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_012850	A	6	6	4193908	4193913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_012850	AAC	2	6	4196405	4196410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_012850	GAA	2	6	4196796	4196801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_012850	GC	3	6	4198102	4198107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11007	NC_012850	TTTG	2	8	4198144	4198151	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_012850	CCG	2	6	4201552	4201557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11009	NC_012850	GAC	2	6	4201603	4201608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_012850	CAT	2	6	4202819	4202824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_012850	AAC	2	6	4208824	4208829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_012850	CGC	2	6	4208915	4208920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11013	NC_012850	G	6	6	4211071	4211076	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_012850	ACG	2	6	4211155	4211160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_012850	T	6	6	4211800	4211805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_012850	CCG	2	6	4211810	4211815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11017	NC_012850	CA	3	6	4215540	4215545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11018	NC_012850	TA	3	6	4215554	4215559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_012850	A	6	6	4215595	4215600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_012850	CG	3	6	4215667	4215672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11021	NC_012850	GGA	2	6	4215693	4215698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_012850	CTG	2	6	4216746	4216751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_012850	CG	3	6	4216825	4216830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11024	NC_012850	CGG	2	6	4216883	4216888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_012850	AGAA	2	8	4216892	4216899	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_012850	GCA	2	6	4216905	4216910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_012850	GCG	2	6	4216916	4216921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_012850	CAAAAA	2	12	4217889	4217900	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11029	NC_012850	CGG	2	6	4217903	4217908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_012850	T	6	6	4217951	4217956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_012850	GCCG	2	8	4217970	4217977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11032	NC_012850	CAC	2	6	4217985	4217990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11033	NC_012850	GA	3	6	4218045	4218050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_012850	CAT	2	6	4218061	4218066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_012850	CCA	2	6	4218110	4218115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11036	NC_012850	TTAT	2	8	4218118	4218125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_012850	GCAT	2	8	4220045	4220052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11038	NC_012850	GAC	2	6	4220774	4220779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_012850	AC	3	6	4220778	4220783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11040	NC_012850	GA	3	6	4225558	4225563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_012850	AGG	2	6	4225574	4225579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_012850	TC	4	8	4225583	4225590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11043	NC_012850	CCG	2	6	4225677	4225682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11044	NC_012850	CGGT	2	8	4225895	4225902	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11045	NC_012850	ATG	2	6	4225935	4225940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_012850	GAC	2	6	4225964	4225969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_012850	CCGCG	2	10	4226005	4226014	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11048	NC_012850	CG	3	6	4226021	4226026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11049	NC_012850	TGC	2	6	4227510	4227515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_012850	GCG	2	6	4227548	4227553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_012850	GCCCC	2	10	4228558	4228567	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11052	NC_012850	TCA	2	6	4228596	4228601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_012850	T	6	6	4228632	4228637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_012850	CTC	2	6	4228677	4228682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_012850	CGA	2	6	4228727	4228732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_012850	A	7	7	4228784	4228790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_012850	T	6	6	4228809	4228814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_012850	CGG	3	9	4229436	4229444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_012850	GTCA	2	8	4229455	4229462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11060	NC_012850	GTA	2	6	4229478	4229483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_012850	CTT	2	6	4229529	4229534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_012850	AAT	2	6	4229683	4229688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_012850	GAA	2	6	4230140	4230145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_012850	GGA	2	6	4230207	4230212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_012850	CGC	2	6	4230316	4230321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11066	NC_012850	CTC	2	6	4234032	4234037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11067	NC_012850	ACA	2	6	4234050	4234055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_012850	CGA	2	6	4234176	4234181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_012850	CT	3	6	4234269	4234274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11070	NC_012850	CGT	2	6	4234292	4234297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_012850	CCG	2	6	4234488	4234493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11072	NC_012850	GC	3	6	4234558	4234563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11073	NC_012850	TCCA	2	8	4234763	4234770	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11074	NC_012850	ATGAA	2	10	4234779	4234788	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_012850	AC	3	6	4234793	4234798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11076	NC_012850	GTCG	2	8	4235293	4235300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11077	NC_012850	GCC	2	6	4235348	4235353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11078	NC_012850	ATG	2	6	4235384	4235389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_012850	CAT	2	6	4235418	4235423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_012850	GAT	2	6	4235448	4235453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11082	NC_012850	CAGG	2	8	4235501	4235508	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11083	NC_012850	GCC	2	6	4235509	4235514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11084	NC_012850	CAG	2	6	4235606	4235611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_012850	GAT	2	6	4235613	4235618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_012850	CCG	2	6	4235675	4235680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11087	NC_012850	TCAA	2	8	4236601	4236608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11088	NC_012850	CTC	2	6	4237816	4237821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11089	NC_012850	GCC	2	6	4237888	4237893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11090	NC_012850	CTT	2	6	4237978	4237983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_012850	GGA	2	6	4238004	4238009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_012850	CAT	2	6	4239037	4239042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_012850	ATATT	2	10	4239089	4239098	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_012850	CGG	2	6	4239395	4239400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_012850	GC	3	6	4239433	4239438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11096	NC_012850	T	6	6	4239480	4239485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_012850	GAT	2	6	4239494	4239499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_012850	GAC	2	6	4241004	4241009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_012850	CGA	2	6	4241725	4241730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_012850	CT	4	8	4241751	4241758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11101	NC_012850	GCG	2	6	4241840	4241845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_012850	TGC	2	6	4241851	4241856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_012850	GAG	2	6	4245252	4245257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_012850	GCT	2	6	4245317	4245322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_012850	TTG	2	6	4245347	4245352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_012850	GGC	2	6	4245356	4245361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_012850	CCCG	2	8	4246582	4246589	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11108	NC_012850	ATG	2	6	4246605	4246610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_012850	CCA	3	9	4247499	4247507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11110	NC_012850	TGC	2	6	4248532	4248537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_012850	AAC	2	6	4248600	4248605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_012850	GGAT	2	8	4248612	4248619	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_012850	GAA	2	6	4249408	4249413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_012850	CTC	2	6	4249429	4249434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11115	NC_012850	CGG	2	6	4249458	4249463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_012850	TCCC	2	8	4249538	4249545	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11117	NC_012850	ATG	2	6	4251060	4251065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_012850	GAC	2	6	4251089	4251094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_012850	ATC	2	6	4251155	4251160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_012850	TGG	2	6	4251820	4251825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_012850	GCCG	2	8	4251939	4251946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11122	NC_012850	TGC	2	6	4255473	4255478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_012850	CTT	2	6	4255500	4255505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_012850	A	6	6	4255616	4255621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_012850	GGC	2	6	4256447	4256452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_012850	TGC	2	6	4256507	4256512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_012850	TAA	2	6	4256523	4256528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_012850	TTG	2	6	4256543	4256548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_012850	GGC	2	6	4256562	4256567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11130	NC_012850	TCG	2	6	4256588	4256593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11131	NC_012850	ATA	2	6	4256603	4256608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11132	NC_012850	ATC	2	6	4256620	4256625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11133	NC_012850	ATCG	2	8	4256628	4256635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11134	NC_012850	GCATC	2	10	4256681	4256690	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11135	NC_012850	GCA	2	6	4258615	4258620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11137	NC_012850	GGCC	2	8	4259066	4259073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11138	NC_012850	GC	3	6	4259152	4259157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11139	NC_012850	GA	3	6	4259216	4259221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11140	NC_012850	TC	3	6	4259245	4259250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11141	NC_012850	ATC	2	6	4259279	4259284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11143	NC_012850	TGAT	2	8	4259411	4259418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11144	NC_012850	CCG	2	6	4259423	4259428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11154	NC_012850	GC	3	6	4270170	4270175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11155	NC_012850	AGA	2	6	4270198	4270203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11250	NC_012850	CCTG	2	8	4311661	4311668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11255	NC_012850	AT	3	6	4311858	4311863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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