MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 12330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_012850	C	6	6	3185307	3185312	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8502	NC_012850	TGGC	2	8	3185351	3185358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8503	NC_012850	ACA	2	6	3185375	3185380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_012850	ACG	2	6	3185392	3185397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_012850	G	6	6	3185472	3185477	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_012850	GGCAC	2	10	3185480	3185489	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8507	NC_012850	TAC	2	6	3185506	3185511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_012850	TGC	3	9	3185524	3185532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_012850	CAC	2	6	3185536	3185541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8510	NC_012850	GCC	2	6	3186817	3186822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8511	NC_012850	CTC	2	6	3186825	3186830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8512	NC_012850	TTC	2	6	3186838	3186843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_012850	GCAGT	2	10	3186895	3186904	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8514	NC_012850	A	6	6	3186916	3186921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_012850	A	7	7	3186952	3186958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_012850	GGA	2	6	3186993	3186998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_012850	TGGGC	2	10	3187003	3187012	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8518	NC_012850	GGA	2	6	3187030	3187035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_012850	GCG	2	6	3188129	3188134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_012850	CGGATG	2	12	3188136	3188147	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8521	NC_012850	ACG	2	6	3188157	3188162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_012850	CGC	2	6	3188178	3188183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8523	NC_012850	GAA	2	6	3188266	3188271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_012850	CGTC	2	8	3188312	3188319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8525	NC_012850	CAAA	2	8	3188320	3188327	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8526	NC_012850	GAG	2	6	3189661	3189666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_012850	AC	3	6	3190485	3190490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8528	NC_012850	CCG	2	6	3190492	3190497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8529	NC_012850	CGG	2	6	3190508	3190513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8530	NC_012850	AGCC	2	8	3190600	3190607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8531	NC_012850	ACC	2	6	3190624	3190629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8532	NC_012850	GATTCC	2	12	3190693	3190704	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_012850	ATT	2	6	3190754	3190759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_012850	TCC	2	6	3190784	3190789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8535	NC_012850	A	7	7	3190827	3190833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_012850	GCC	2	6	3190859	3190864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8537	NC_012850	CCGA	2	8	3191357	3191364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8538	NC_012850	GCGTC	2	10	3191385	3191394	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8539	NC_012850	CGA	2	6	3191404	3191409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_012850	GCCC	2	8	3191452	3191459	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8541	NC_012850	ATTG	2	8	3191461	3191468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_012850	GCG	2	6	3191573	3191578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8543	NC_012850	AGC	2	6	3191589	3191594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8544	NC_012850	CTCTC	2	10	3191612	3191621	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8545	NC_012850	TGA	2	6	3191648	3191653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_012850	TTG	2	6	3191700	3191705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_012850	GATG	2	8	3191731	3191738	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_012850	ATC	2	6	3193164	3193169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_012850	GAC	2	6	3193272	3193277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_012850	GTT	2	6	3193279	3193284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_012850	CAC	2	6	3193332	3193337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8552	NC_012850	GAC	2	6	3193393	3193398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8553	NC_012850	CG	5	10	3193404	3193413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8554	NC_012850	TAA	2	6	3193477	3193482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_012850	AT	3	6	3193488	3193493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_012850	CGA	2	6	3193556	3193561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8557	NC_012850	TGT	2	6	3193595	3193600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_012850	AC	3	6	3193635	3193640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8559	NC_012850	CCT	2	6	3193650	3193655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8560	NC_012850	TCC	2	6	3193722	3193727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8561	NC_012850	GAT	2	6	3193790	3193795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_012850	CG	3	6	3193796	3193801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8563	NC_012850	TCCGG	2	10	3193818	3193827	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8564	NC_012850	GCT	2	6	3193832	3193837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8565	NC_012850	TAA	2	6	3193897	3193902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_012850	AAT	2	6	3193928	3193933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_012850	TAA	2	6	3193956	3193961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_012850	CGG	2	6	3195197	3195202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8569	NC_012850	GCA	2	6	3195298	3195303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_012850	AGT	2	6	3200047	3200052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_012850	ATC	2	6	3200057	3200062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_012850	CAA	2	6	3200112	3200117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_012850	CAG	2	6	3204310	3204315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8574	NC_012850	CG	3	6	3204351	3204356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8575	NC_012850	GAA	2	6	3204387	3204392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_012850	GCA	2	6	3204462	3204467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8577	NC_012850	GCC	2	6	3204480	3204485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8578	NC_012850	CCT	2	6	3204486	3204491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8579	NC_012850	GAT	2	6	3204517	3204522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_012850	CTG	2	6	3204623	3204628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8581	NC_012850	AAC	2	6	3204657	3204662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8582	NC_012850	GTC	2	6	3204707	3204712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8583	NC_012850	TGC	2	6	3204713	3204718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8584	NC_012850	CG	3	6	3204722	3204727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8585	NC_012850	ATC	2	6	3204807	3204812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8586	NC_012850	CCT	2	6	3204828	3204833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8587	NC_012850	CGA	2	6	3204940	3204945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8588	NC_012850	GTTG	2	8	3204964	3204971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_012850	GATC	2	8	3205021	3205028	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8590	NC_012850	GCG	2	6	3205046	3205051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8591	NC_012850	AGG	2	6	3205059	3205064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_012850	GAC	2	6	3205068	3205073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8593	NC_012850	TAC	2	6	3205090	3205095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8595	NC_012850	A	6	6	3205150	3205155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_012850	AAT	2	6	3205166	3205171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_012850	TACG	2	8	3205205	3205212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8598	NC_012850	GGA	2	6	3205234	3205239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_012850	ACC	2	6	3205247	3205252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8600	NC_012850	CGG	2	6	3205254	3205259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8601	NC_012850	CAT	2	6	3205385	3205390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8602	NC_012850	T	6	6	3205419	3205424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_012850	CAT	2	6	3205533	3205538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8604	NC_012850	ATA	2	6	3205562	3205567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_012850	TAAT	2	8	3205638	3205645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_012850	AGA	2	6	3205750	3205755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8608	NC_012850	CAA	2	6	3205842	3205847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8609	NC_012850	GAT	2	6	3205854	3205859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_012850	AT	3	6	3205911	3205916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_012850	ATAA	2	8	3205919	3205926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_012850	CGAT	2	8	3205957	3205964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8613	NC_012850	AAC	2	6	3206092	3206097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_012850	TGCT	2	8	3206216	3206223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8615	NC_012850	AGT	2	6	3206254	3206259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_012850	GTCG	2	8	3206490	3206497	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8617	NC_012850	AGA	2	6	3206516	3206521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_012850	CGC	2	6	3206539	3206544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8619	NC_012850	CTCG	2	8	3206584	3206591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8620	NC_012850	GATG	2	8	3206605	3206612	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_012850	GAC	2	6	3206766	3206771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8622	NC_012850	GC	3	6	3206781	3206786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8623	NC_012850	GTG	2	6	3206845	3206850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_012850	GAA	2	6	3207156	3207161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_012850	A	6	6	3207194	3207199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_012850	AT	3	6	3209130	3209135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_012850	ATCC	2	8	3211242	3211249	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8628	NC_012850	T	6	6	3211767	3211772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_012850	CAG	2	6	3211773	3211778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8630	NC_012850	CA	4	8	3211779	3211786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8631	NC_012850	AAC	2	6	3211792	3211797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8632	NC_012850	TCC	2	6	3212542	3212547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8633	NC_012850	GAA	2	6	3212575	3212580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8634	NC_012850	TTGA	2	8	3212593	3212600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8893	NC_012850	CAT	2	6	3300252	3300257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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