MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 12330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012850	T	7	7	2981607	2981613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_012850	CACT	2	8	2981628	2981635	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8003	NC_012850	CGAT	2	8	2981682	2981689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8004	NC_012850	AT	3	6	2981688	2981693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_012850	ACG	2	6	2981722	2981727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_012850	TCC	2	6	2983190	2983195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8007	NC_012850	CCG	2	6	2984360	2984365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8008	NC_012850	GCC	2	6	2984405	2984410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_012850	ATC	2	6	2986235	2986240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_012850	GAAA	2	8	2986295	2986302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_012850	CTA	2	6	2986308	2986313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_012850	AAATCG	2	12	2987231	2987242	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8013	NC_012850	GCG	2	6	2987310	2987315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_012850	CGGGA	2	10	2987322	2987331	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8015	NC_012850	TCT	2	6	2988148	2988153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_012850	ATC	2	6	2988189	2988194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_012850	CGC	2	6	2988221	2988226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_012850	CTTG	2	8	2988301	2988308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8019	NC_012850	TAGA	2	8	2988328	2988335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_012850	AGC	2	6	2989525	2989530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_012850	GAG	2	6	2989548	2989553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_012850	CCG	2	6	2991466	2991471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_012850	GAG	2	6	2991538	2991543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_012850	CGC	2	6	2992254	2992259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_012850	CAA	2	6	2992260	2992265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_012850	A	6	6	2992264	2992269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_012850	CCG	2	6	2992273	2992278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8028	NC_012850	ATG	2	6	2993622	2993627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_012850	CGC	2	6	2993650	2993655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8030	NC_012850	CCA	2	6	2993657	2993662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8031	NC_012850	TCG	2	6	2993776	2993781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_012850	CAA	2	6	2993809	2993814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_012850	CGC	2	6	2993826	2993831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_012850	GC	3	6	2993845	2993850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8035	NC_012850	CAT	2	6	2993865	2993870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_012850	ACG	2	6	2997088	2997093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_012850	GAC	2	6	2998814	2998819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_012850	CCG	2	6	2999685	2999690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8039	NC_012850	GCCA	2	8	2999697	2999704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8040	NC_012850	CA	3	6	2999734	2999739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_012850	A	8	8	2999744	2999751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_012850	A	6	6	2999915	2999920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_012850	TTGC	2	8	2999924	2999931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8044	NC_012850	GCA	2	6	2999947	2999952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_012850	GC	3	6	3000003	3000008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8046	NC_012850	GGCG	2	8	3000047	3000054	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8047	NC_012850	CCTG	2	8	3000060	3000067	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8048	NC_012850	TGCC	2	8	3000113	3000120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8049	NC_012850	AGG	2	6	3000134	3000139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_012850	ATG	2	6	3000148	3000153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_012850	AG	3	6	3000175	3000180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_012850	GCA	2	6	3000449	3000454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_012850	GCG	2	6	3001044	3001049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_012850	ATCGA	2	10	3001102	3001111	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8055	NC_012850	CGAT	2	8	3001180	3001187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8056	NC_012850	TGG	2	6	3001212	3001217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_012850	CT	3	6	3003240	3003245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8058	NC_012850	TC	3	6	3003276	3003281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8059	NC_012850	GGT	2	6	3003284	3003289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_012850	GCT	2	6	3003296	3003301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_012850	CGAA	2	8	3003310	3003317	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8062	NC_012850	CTC	2	6	3003332	3003337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8063	NC_012850	AG	3	6	3003558	3003563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_012850	GGC	2	6	3003585	3003590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_012850	CT	3	6	3003723	3003728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8066	NC_012850	CTG	2	6	3003774	3003779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_012850	TTG	2	6	3003919	3003924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_012850	TGC	2	6	3003948	3003953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_012850	GC	3	6	3004004	3004009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8070	NC_012850	C	6	6	3004054	3004059	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8071	NC_012850	ATCG	2	8	3004068	3004075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8072	NC_012850	TGT	2	6	3004085	3004090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_012850	CGAGC	2	10	3004093	3004102	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8074	NC_012850	GAA	2	6	3004111	3004116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_012850	TGG	2	6	3004144	3004149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_012850	ACCC	2	8	3004167	3004174	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8077	NC_012850	TCGA	2	8	3004306	3004313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8078	NC_012850	CGC	2	6	3004334	3004339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_012850	TAT	2	6	3004359	3004364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_012850	GCT	2	6	3004511	3004516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_012850	CGA	2	6	3004597	3004602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_012850	AGG	2	6	3004616	3004621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_012850	GCC	2	6	3004655	3004660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8084	NC_012850	TTC	2	6	3004682	3004687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_012850	GC	3	6	3004728	3004733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8086	NC_012850	CCG	2	6	3004783	3004788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8087	NC_012850	CTTT	2	8	3004789	3004796	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8088	NC_012850	GCACC	2	10	3004848	3004857	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8089	NC_012850	ATAGAA	2	12	3004899	3004910	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_012850	ATC	2	6	3005962	3005967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_012850	GCC	2	6	3007559	3007564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8092	NC_012850	CTTT	2	8	3010189	3010196	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8093	NC_012850	CG	4	8	3010199	3010206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8094	NC_012850	ACA	2	6	3010395	3010400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_012850	GGA	2	6	3010428	3010433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_012850	TCGCCA	2	12	3010498	3010509	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8097	NC_012850	CCGA	2	8	3010536	3010543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8098	NC_012850	GCC	2	6	3010579	3010584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8099	NC_012850	CGC	2	6	3010658	3010663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8100	NC_012850	CGATG	2	10	3010682	3010691	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8101	NC_012850	GAAG	2	8	3010713	3010720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_012850	CGG	2	6	3010727	3010732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_012850	CGC	2	6	3010737	3010742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8104	NC_012850	AGT	2	6	3010821	3010826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_012850	CG	3	6	3010864	3010869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8106	NC_012850	AGC	2	6	3011020	3011025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_012850	CCG	2	6	3011029	3011034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8108	NC_012850	CGC	2	6	3011039	3011044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8109	NC_012850	CGA	2	6	3011069	3011074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_012850	CTG	2	6	3011085	3011090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_012850	GCG	2	6	3011103	3011108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_012850	GCC	2	6	3011120	3011125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8113	NC_012850	CAAT	2	8	3011137	3011144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8114	NC_012850	TG	3	6	3011145	3011150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_012850	TCC	2	6	3011178	3011183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8116	NC_012850	GGA	2	6	3011249	3011254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_012850	GGC	2	6	3011314	3011319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_012850	CG	3	6	3012008	3012013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8119	NC_012850	GC	3	6	3012034	3012039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8120	NC_012850	ACT	2	6	3012053	3012058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_012850	GAA	2	6	3012085	3012090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_012850	CGA	2	6	3012119	3012124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_012850	TTG	2	6	3012146	3012151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_012850	AGC	2	6	3012233	3012238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_012850	GCA	2	6	3014616	3014621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_012850	CTT	2	6	3014623	3014628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_012850	CAAG	2	8	3014666	3014673	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8128	NC_012850	AC	3	6	3014674	3014679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8129	NC_012850	ACC	2	6	3014693	3014698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8130	NC_012850	GAT	2	6	3014704	3014709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_012850	ATC	2	6	3014771	3014776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8132	NC_012850	ATTCA	2	10	3014864	3014873	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8133	NC_012850	T	6	6	3014905	3014910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8134	NC_012850	T	7	7	3014942	3014948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8135	NC_012850	GCG	2	6	3014958	3014963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8136	NC_012850	CGC	2	6	3014980	3014985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8137	NC_012850	CGA	2	6	3015339	3015344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8138	NC_012850	GC	3	6	3017481	3017486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8139	NC_012850	ATGCG	2	10	3017492	3017501	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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8141	NC_012850	GAC	2	6	3019519	3019524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8142	NC_012850	GATTGC	2	12	3019556	3019567	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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8144	NC_012850	CCG	2	6	3021590	3021595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8146	NC_012850	T	6	6	3023241	3023246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8149	NC_012850	AAC	2	6	3025529	3025534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8150	NC_012850	TCG	2	6	3025641	3025646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8153	NC_012850	CG	3	6	3026452	3026457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8154	NC_012850	GGCC	2	8	3026469	3026476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8161	NC_012850	TGA	2	6	3031471	3031476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8163	NC_012850	CAG	2	6	3031618	3031623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8164	NC_012850	GCT	2	6	3032746	3032751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8258	NC_012850	AGC	2	6	3078925	3078930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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