MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 12330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012850	A	9	9	2286734	2286742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_012850	GGA	2	6	2286819	2286824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_012850	CAT	2	6	2286870	2286875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_012850	CGGG	2	8	2290273	2290280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6005	NC_012850	TGC	2	6	2290378	2290383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_012850	GGA	2	6	2290401	2290406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_012850	GGA	2	6	2293743	2293748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_012850	CGG	2	6	2295230	2295235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_012850	AGA	2	6	2295264	2295269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_012850	CGC	2	6	2295280	2295285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_012850	CGA	2	6	2296647	2296652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_012850	CCGCC	2	10	2296674	2296683	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6013	NC_012850	AGA	2	6	2296734	2296739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_012850	CTT	2	6	2299031	2299036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_012850	GCC	2	6	2299040	2299045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_012850	CGG	2	6	2299085	2299090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_012850	GCC	2	6	2299106	2299111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_012850	AAG	2	6	2299128	2299133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_012850	A	7	7	2299234	2299240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_012850	CGC	2	6	2299251	2299256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_012850	AG	3	6	2299325	2299330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_012850	CGA	2	6	2300129	2300134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_012850	TTTG	2	8	2300168	2300175	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_012850	GCA	2	6	2301866	2301871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_012850	TGC	2	6	2301884	2301889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_012850	AAAT	2	8	2301907	2301914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_012850	TAA	2	6	2301981	2301986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_012850	GC	3	6	2301987	2301992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6029	NC_012850	AAG	3	9	2302003	2302011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_012850	ATG	2	6	2302301	2302306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_012850	CAT	2	6	2302336	2302341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_012850	TCC	2	6	2303085	2303090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_012850	TCT	2	6	2303096	2303101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_012850	TAGT	2	8	2304091	2304098	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_012850	CGC	2	6	2304134	2304139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_012850	GC	3	6	2305645	2305650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_012850	AAGCC	2	10	2305706	2305715	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6038	NC_012850	CCT	2	6	2306992	2306997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_012850	ATGA	2	8	2307824	2307831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_012850	AAC	2	6	2307848	2307853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_012850	GC	3	6	2307893	2307898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_012850	CATG	2	8	2307956	2307963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_012850	CGCCT	2	10	2307976	2307985	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6044	NC_012850	GCA	2	6	2307999	2308004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_012850	TC	3	6	2308855	2308860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_012850	GCG	2	6	2309750	2309755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_012850	TTCG	2	8	2309773	2309780	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6048	NC_012850	CT	3	6	2311026	2311031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_012850	GCG	2	6	2311036	2311041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_012850	GCC	3	9	2311068	2311076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_012850	GGA	2	6	2311090	2311095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_012850	GGGCG	2	10	2311103	2311112	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6053	NC_012850	AAG	2	6	2311115	2311120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_012850	CTGT	2	8	2311126	2311133	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6055	NC_012850	GCA	2	6	2311173	2311178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_012850	GCC	2	6	2311316	2311321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_012850	T	7	7	2312477	2312483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_012850	CG	3	6	2312484	2312489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_012850	TGC	2	6	2312495	2312500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_012850	CGG	2	6	2312934	2312939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_012850	CCG	2	6	2312995	2313000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_012850	CCGG	2	8	2314680	2314687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_012850	CG	3	6	2314688	2314693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_012850	GCCG	2	8	2314717	2314724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_012850	GAAT	2	8	2315814	2315821	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_012850	CT	3	6	2315847	2315852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_012850	TTTTC	2	10	2315887	2315896	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6068	NC_012850	AGCC	2	8	2315914	2315921	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_012850	CAGA	2	8	2315931	2315938	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6070	NC_012850	GAGGC	2	10	2316013	2316022	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6071	NC_012850	GGCT	2	8	2317288	2317295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_012850	GATC	2	8	2317353	2317360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_012850	TCA	2	6	2317375	2317380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_012850	ACA	2	6	2317463	2317468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_012850	TCC	2	6	2317518	2317523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_012850	CCG	2	6	2317613	2317618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_012850	TCA	2	6	2317710	2317715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_012850	T	7	7	2317779	2317785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_012850	T	6	6	2317800	2317805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_012850	AC	3	6	2317871	2317876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6081	NC_012850	ACA	2	6	2318459	2318464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_012850	ATT	2	6	2318475	2318480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_012850	CCT	2	6	2319726	2319731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_012850	A	6	6	2319733	2319738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_012850	TCT	2	6	2319765	2319770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_012850	CTTCCT	2	12	2321752	2321763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_012850	T	6	6	2322923	2322928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_012850	CTT	2	6	2322942	2322947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_012850	CT	3	6	2322960	2322965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_012850	GCGG	2	8	2322970	2322977	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6091	NC_012850	AAC	2	6	2322986	2322991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_012850	AT	3	6	2323835	2323840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_012850	CGA	2	6	2324785	2324790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_012850	AAC	2	6	2324816	2324821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_012850	CAA	2	6	2324893	2324898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_012850	CG	3	6	2324937	2324942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6097	NC_012850	TGG	2	6	2324954	2324959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_012850	GCC	2	6	2325479	2325484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_012850	TTG	2	6	2325515	2325520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_012850	GC	3	6	2325544	2325549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6101	NC_012850	GCA	2	6	2327213	2327218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_012850	GAAA	2	8	2327237	2327244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_012850	GAA	2	6	2327249	2327254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_012850	TGAT	2	8	2327296	2327303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_012850	ATC	2	6	2327376	2327381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_012850	TGGC	2	8	2327464	2327471	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6107	NC_012850	TCG	2	6	2327513	2327518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_012850	TCC	2	6	2327525	2327530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6109	NC_012850	TCA	2	6	2327531	2327536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_012850	CAG	2	6	2327556	2327561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_012850	CAG	2	6	2327638	2327643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_012850	CCGA	2	8	2327695	2327702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_012850	GGAA	2	8	2327730	2327737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_012850	GTC	2	6	2327848	2327853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_012850	ACC	2	6	2327897	2327902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_012850	CCT	2	6	2327934	2327939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_012850	TGC	2	6	2327951	2327956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_012850	GATG	2	8	2327971	2327978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_012850	TGC	2	6	2328003	2328008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_012850	TA	3	6	2329816	2329821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_012850	GCT	2	6	2329871	2329876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_012850	CTG	2	6	2329913	2329918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_012850	CTG	2	6	2329921	2329926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_012850	GAG	2	6	2329959	2329964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_012850	GGC	2	6	2329988	2329993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_012850	TGC	2	6	2330123	2330128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_012850	CTTT	2	8	2330228	2330235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6128	NC_012850	T	6	6	2330233	2330238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_012850	TTCT	2	8	2330253	2330260	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6130	NC_012850	TCC	2	6	2331919	2331924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6131	NC_012850	CGG	2	6	2331928	2331933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_012850	GTAC	2	8	2331943	2331950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6133	NC_012850	GTC	2	6	2333067	2333072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_012850	GCC	2	6	2333124	2333129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6135	NC_012850	CCTCAA	2	12	2333213	2333224	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6137	NC_012850	GC	3	6	2333357	2333362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6138	NC_012850	GC	3	6	2333381	2333386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6142	NC_012850	AG	3	6	2337977	2337982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6143	NC_012850	CGCCC	2	10	2338003	2338012	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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6146	NC_012850	CTG	2	6	2341038	2341043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6147	NC_012850	AG	3	6	2341052	2341057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6148	NC_012850	CGC	3	9	2341059	2341067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6149	NC_012850	GC	3	6	2341066	2341071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6150	NC_012850	TCC	2	6	2342387	2342392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6165	NC_012850	GGT	2	6	2346735	2346740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6253	NC_012850	AG	3	6	2382446	2382451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6255	NC_012850	GCCG	2	8	2382807	2382814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6256	NC_012850	ATG	2	6	2383113	2383118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6258	NC_012850	CCGG	2	8	2383670	2383677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6259	NC_012850	A	6	6	2383689	2383694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_012850	CG	3	6	2383697	2383702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6261	NC_012850	TCG	2	6	2385802	2385807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6262	NC_012850	CCG	2	6	2385821	2385826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6263	NC_012850	AATT	2	8	2385848	2385855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6264	NC_012850	ACG	2	6	2385869	2385874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6265	NC_012850	GAT	2	6	2385881	2385886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6270	NC_012850	TTC	2	6	2387784	2387789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6274	NC_012850	TTG	2	6	2387875	2387880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6276	NC_012850	CTG	2	6	2387970	2387975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6292	NC_012850	ACCG	2	8	2393769	2393776	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6302	NC_012850	TCC	2	6	2397111	2397116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6340	NC_012850	GTCA	2	8	2416655	2416662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6342	NC_012850	CCTGC	2	10	2416686	2416695	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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6352	NC_012850	TGT	2	6	2425319	2425324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6353	NC_012850	GCG	2	6	2425328	2425333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6354	NC_012850	GA	3	6	2425337	2425342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6355	NC_012850	TCG	2	6	2425347	2425352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6375	NC_012850	TCGCA	2	10	2428568	2428577	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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6384	NC_012850	GCG	2	6	2436155	2436160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6389	NC_012850	CGGA	2	8	2443006	2443013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6392	NC_012850	CCGC	2	8	2443774	2443781	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6393	NC_012850	GAA	2	6	2446180	2446185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6398	NC_012850	ATCG	2	8	2446449	2446456	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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