MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 9524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012633	AT	3	6	600753	600758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_012633	ATG	2	6	601722	601727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_012633	TGA	2	6	601733	601738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_012633	T	7	7	601745	601751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_012633	TTGTA	2	10	602670	602679	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_012633	A	7	7	602775	602781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_012633	T	6	6	602785	602790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_012633	ATGA	2	8	602819	602826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_012633	CAT	2	6	602833	602838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_012633	TAA	2	6	602845	602850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_012633	ATA	2	6	602851	602856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_012633	T	6	6	603799	603804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_012633	TAA	2	6	603827	603832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_012633	A	6	6	603831	603836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_012633	TTG	2	6	603837	603842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_012633	TTA	2	6	603858	603863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_012633	TTAAT	2	10	603877	603886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_012633	AT	3	6	603896	603901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_012633	ACC	2	6	603921	603926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_012633	ACAAAA	2	12	603927	603938	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4021	NC_012633	TAA	2	6	604322	604327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_012633	TAA	2	6	604339	604344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_012633	TC	3	6	604360	604365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4024	NC_012633	TAA	2	6	604392	604397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_012633	A	6	6	604406	604411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_012633	ATT	2	6	604479	604484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_012633	AGA	2	6	604519	604524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_012633	AGA	2	6	604609	604614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_012633	TAT	2	6	604640	604645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_012633	TAT	2	6	604663	604668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_012633	ATG	2	6	604780	604785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_012633	GTG	2	6	604804	604809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012633	AAT	2	6	604824	604829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_012633	CAA	2	6	604905	604910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_012633	TCGC	2	8	604920	604927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_012633	ATT	2	6	606474	606479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_012633	T	6	6	606478	606483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_012633	ATA	2	6	606520	606525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_012633	ATA	2	6	606560	606565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_012633	A	6	6	606581	606586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_012633	AGC	2	6	606618	606623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_012633	A	6	6	606727	606732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_012633	TAA	2	6	606770	606775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_012633	AT	3	6	606787	606792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_012633	GATG	2	8	606807	606814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_012633	GAA	2	6	606822	606827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_012633	TAAT	2	8	606847	606854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_012633	AGG	2	6	606878	606883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_012633	TAG	2	6	607776	607781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_012633	ACA	2	6	607791	607796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_012633	TCAT	2	8	609778	609785	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_012633	AC	3	6	610373	610378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_012633	G	7	7	610383	610389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_012633	TAG	2	6	610446	610451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_012633	GAT	2	6	610469	610474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_012633	A	7	7	610479	610485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_012633	A	6	6	610512	610517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_012633	A	6	6	610540	610545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_012633	GAA	2	6	610553	610558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_012633	TCT	2	6	610625	610630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_012633	TAA	2	6	610663	610668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_012633	AG	4	8	610673	610680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_012633	AGTA	2	8	610700	610707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_012633	ATA	2	6	610720	610725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_012633	TAA	2	6	610779	610784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_012633	TAT	2	6	610789	610794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_012633	TCA	2	6	612162	612167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_012633	GAG	2	6	612172	612177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_012633	GTT	2	6	612180	612185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_012633	T	6	6	612227	612232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_012633	TAAT	2	8	613361	613368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_012633	TATAT	2	10	613396	613405	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_012633	TAA	2	6	613409	613414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_012633	AT	3	6	615802	615807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_012633	AGTAA	2	10	615826	615835	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_012633	TCAA	2	8	615850	615857	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4077	NC_012633	TAT	3	9	615902	615910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_012633	CT	3	6	615914	615919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_012633	TTG	2	6	615959	615964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_012633	ATT	2	6	616029	616034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_012633	T	6	6	616039	616044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_012633	GTG	2	6	616069	616074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_012633	TGC	2	6	616084	616089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_012633	TAC	2	6	616090	616095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_012633	GCA	2	6	616097	616102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_012633	GTA	2	6	616127	616132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_012633	AAATT	2	10	616228	616237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_012633	T	7	7	616260	616266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_012633	CGT	2	6	616274	616279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_012633	GTC	2	6	616355	616360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_012633	TAT	2	6	616411	616416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_012633	A	6	6	616420	616425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_012633	ATTA	2	8	616439	616446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_012633	TATTAA	2	12	616451	616462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_012633	CAT	2	6	616502	616507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_012633	ATT	2	6	616518	616523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_012633	CAA	2	6	616547	616552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_012633	AGG	2	6	616599	616604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_012633	TAA	2	6	616611	616616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_012633	ATTA	2	8	616694	616701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_012633	TGG	2	6	616719	616724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_012633	CTC	2	6	616793	616798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_012633	TAA	3	9	616809	616817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_012633	TAA	2	6	616899	616904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_012633	AGAT	2	8	616925	616932	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_012633	CAA	2	6	616947	616952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_012633	CTAA	2	8	616994	617001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4108	NC_012633	CT	3	6	617002	617007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_012633	TGC	2	6	617077	617082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_012633	TACT	2	8	617112	617119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4111	NC_012633	AAC	2	6	617137	617142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_012633	ATAA	2	8	617154	617161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_012633	TAC	2	6	617162	617167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_012633	GTA	3	9	617212	617220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_012633	ATA	2	6	617223	617228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_012633	ATG	2	6	617834	617839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_012633	TAG	2	6	617940	617945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_012633	ATA	2	6	617970	617975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_012633	GGT	2	6	618043	618048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_012633	ATT	2	6	618054	618059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_012633	CAGTT	2	10	618096	618105	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4122	NC_012633	GCA	2	6	618191	618196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_012633	AGTT	2	8	618723	618730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_012633	T	6	6	618729	618734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_012633	ATA	2	6	618735	618740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_012633	T	6	6	618812	618817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_012633	TA	3	6	618932	618937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_012633	AAAAT	2	10	619024	619033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_012633	TA	3	6	619077	619082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_012633	TTC	2	6	619087	619092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_012633	A	6	6	619126	619131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_012633	ACT	2	6	619204	619209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_012633	ATT	2	6	619226	619231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_012633	A	6	6	619253	619258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_012633	TAG	2	6	619267	619272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_012633	ATTT	2	8	619277	619284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_012633	TAA	2	6	619285	619290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_012633	TAA	2	6	619304	619309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_012633	TTA	2	6	619310	619315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_012633	TAAA	2	8	619639	619646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_012633	TAA	2	6	619655	619660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_012633	AATT	2	8	619684	619691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_012633	TA	3	6	619716	619721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_012633	ATT	2	6	619725	619730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_012633	CGT	2	6	620858	620863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4147	NC_012633	CT	3	6	621847	621852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4148	NC_012633	AAT	2	6	622948	622953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4152	NC_012633	TTTGT	2	10	623108	623117	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_012633	AAT	2	6	623127	623132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_012633	T	7	7	623137	623143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_012633	TA	3	6	623225	623230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_012633	A	6	6	623280	623285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4162	NC_012633	ATG	2	6	623494	623499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_012633	ATG	2	6	623515	623520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4168	NC_012633	TA	4	8	623857	623864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4175	NC_012633	AAT	2	6	624114	624119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4178	NC_012633	AT	3	6	624277	624282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4182	NC_012633	TA	3	6	624378	624383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4184	NC_012633	ATGGG	2	10	624492	624501	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4262	NC_012633	ATT	2	6	633780	633785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_012633	ATTAA	2	10	633816	633825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_012633	TAA	2	6	633833	633838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_012633	TCT	2	6	633858	633863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4266	NC_012633	TTTA	2	8	633890	633897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_012633	A	6	6	633917	633922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_012633	ATT	2	6	633945	633950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4269	NC_012633	CTC	2	6	634014	634019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4270	NC_012633	A	6	6	634078	634083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4271	NC_012633	GAT	2	6	634091	634096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4274	NC_012633	TAA	2	6	634267	634272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4402	NC_012633	A	6	6	661921	661926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4403	NC_012633	TAA	2	6	661968	661973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4404	NC_012633	ATA	2	6	662053	662058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4405	NC_012633	TAT	2	6	662130	662135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4406	NC_012633	GTA	2	6	662255	662260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4409	NC_012633	CTT	2	6	663318	663323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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