MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 9524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_012633	AT	3	6	1207189	1207194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_012633	T	7	7	1207222	1207228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_012633	TCT	2	6	1207256	1207261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_012633	GTT	2	6	1207265	1207270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_012633	T	6	6	1207290	1207295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_012633	T	6	6	1207321	1207326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_012633	TTAT	2	8	1207357	1207364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_012633	TTC	2	6	1207372	1207377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_012633	TAA	2	6	1207384	1207389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_012633	T	6	6	1207398	1207403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_012633	TCT	2	6	1207434	1207439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_012633	ATT	2	6	1207446	1207451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_012633	GATTA	2	10	1207496	1207505	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_012633	T	6	6	1210492	1210497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_012633	A	6	6	1210498	1210503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_012633	GTA	2	6	1210507	1210512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_012633	TTTTA	2	10	1210523	1210532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_012633	GTAG	2	8	1210557	1210564	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_012633	ATT	2	6	1211884	1211889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_012633	TAT	2	6	1212255	1212260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_012633	AAT	2	6	1212275	1212280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_012633	TAA	2	6	1212290	1212295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_012633	ATT	3	9	1212545	1212553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_012633	GCTT	2	8	1212573	1212580	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9025	NC_012633	T	6	6	1212579	1212584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_012633	AT	3	6	1212588	1212593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_012633	AGT	2	6	1212601	1212606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_012633	TGTT	2	8	1212636	1212643	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_012633	TAG	2	6	1212646	1212651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_012633	GTTT	2	8	1212669	1212676	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_012633	TTA	2	6	1212684	1212689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_012633	CTT	2	6	1212722	1212727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_012633	T	6	6	1212735	1212740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_012633	CTT	2	6	1212746	1212751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_012633	T	6	6	1212828	1212833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_012633	AT	3	6	1212851	1212856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_012633	T	6	6	1212873	1212878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_012633	T	6	6	1212897	1212902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_012633	TTCC	2	8	1212915	1212922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9040	NC_012633	TAA	2	6	1212938	1212943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_012633	TTA	2	6	1212976	1212981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_012633	TGA	2	6	1213017	1213022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_012633	TAA	2	6	1213040	1213045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_012633	TCT	2	6	1213051	1213056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_012633	ATT	2	6	1213065	1213070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_012633	ATT	2	6	1213133	1213138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_012633	TAAT	2	8	1213172	1213179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9049	NC_012633	TGC	2	6	1213318	1213323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_012633	ATA	2	6	1213463	1213468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_012633	ATT	2	6	1213494	1213499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_012633	T	7	7	1213498	1213504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_012633	ATA	2	6	1213512	1213517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_012633	A	6	6	1213530	1213535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_012633	GTT	2	6	1213865	1213870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_012633	TATT	2	8	1213916	1213923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_012633	A	6	6	1213974	1213979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_012633	TTA	2	6	1213984	1213989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_012633	AAT	2	6	1213995	1214000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_012633	T	6	6	1215876	1215881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_012633	TGTTC	2	10	1215924	1215933	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9062	NC_012633	AGAA	2	8	1215962	1215969	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_012633	TAAT	2	8	1215999	1216006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_012633	TAA	2	6	1217325	1217330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_012633	A	6	6	1217329	1217334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_012633	TG	3	6	1217353	1217358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_012633	TTG	2	6	1217362	1217367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_012633	GTA	2	6	1217404	1217409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9071	NC_012633	T	7	7	1217452	1217458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_012633	ATT	2	6	1217460	1217465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_012633	T	7	7	1217464	1217470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_012633	CAA	2	6	1217519	1217524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9075	NC_012633	GTT	2	6	1217533	1217538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_012633	ATCT	2	8	1217553	1217560	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9077	NC_012633	ATTT	2	8	1217592	1217599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9078	NC_012633	ATC	2	6	1217618	1217623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9080	NC_012633	A	6	6	1217679	1217684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_012633	TA	3	6	1217715	1217720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_012633	A	6	6	1217725	1217730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_012633	T	6	6	1217762	1217767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_012633	TA	3	6	1217773	1217778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_012633	GAA	2	6	1217796	1217801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9088	NC_012633	ATT	2	6	1217845	1217850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9091	NC_012633	A	6	6	1217980	1217985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_012633	T	7	7	1218030	1218036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_012633	ATT	2	6	1218052	1218057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_012633	CTAG	2	8	1218110	1218117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9095	NC_012633	GAA	2	6	1218132	1218137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_012633	A	6	6	1218144	1218149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_012633	AAGC	2	8	1218154	1218161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9098	NC_012633	AAGA	2	8	1218197	1218204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_012633	ATT	2	6	1218210	1218215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9102	NC_012633	ATA	2	6	1218285	1218290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_012633	A	6	6	1218290	1218295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_012633	TGTTA	2	10	1218314	1218323	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_012633	ATA	2	6	1218324	1218329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_012633	TAATGA	2	12	1218343	1218354	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_012633	TAT	2	6	1218359	1218364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_012633	A	6	6	1218368	1218373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_012633	TGA	2	6	1218474	1218479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_012633	ACAA	2	8	1218495	1218502	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9111	NC_012633	A	7	7	1218545	1218551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_012633	TTA	2	6	1218584	1218589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_012633	CGAAC	2	10	1218603	1218612	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9114	NC_012633	A	6	6	1218624	1218629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_012633	TAA	2	6	1218657	1218662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_012633	AT	3	6	1218680	1218685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_012633	ATT	2	6	1218691	1218696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_012633	AAG	2	6	1218715	1218720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_012633	TAGT	2	8	1218775	1218782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_012633	GAC	2	6	1218796	1218801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9121	NC_012633	CCTAAT	2	12	1218848	1218859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9122	NC_012633	TA	3	6	1218918	1218923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_012633	ATT	2	6	1218936	1218941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_012633	TCATTG	2	12	1220290	1220301	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9125	NC_012633	TAG	2	6	1220378	1220383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_012633	TCGC	2	8	1221465	1221472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9127	NC_012633	AGTA	2	8	1222821	1222828	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_012633	TTA	2	6	1222866	1222871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_012633	TAA	2	6	1222970	1222975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_012633	ATA	2	6	1223014	1223019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9131	NC_012633	TA	5	10	1223021	1223030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9132	NC_012633	CTT	2	6	1223050	1223055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9134	NC_012633	CTT	2	6	1223091	1223096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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