MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 9524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_012633	AAATT	2	10	1142609	1142618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_012633	A	6	6	1143354	1143359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_012633	AATT	2	8	1143389	1143396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_012633	TA	3	6	1143428	1143433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_012633	TCT	2	6	1143452	1143457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_012633	TA	3	6	1143535	1143540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_012633	T	6	6	1143576	1143581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_012633	A	8	8	1143610	1143617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_012633	AAT	2	6	1143625	1143630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_012633	AT	3	6	1143681	1143686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_012633	T	7	7	1143686	1143692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_012633	T	6	6	1143701	1143706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_012633	ATA	2	6	1143738	1143743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_012633	TA	3	6	1143748	1143753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_012633	TA	3	6	1144274	1144279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_012633	AGC	2	6	1144339	1144344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_012633	TCA	2	6	1144364	1144369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8518	NC_012633	CAA	2	6	1144436	1144441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_012633	ATA	2	6	1144444	1144449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_012633	TTA	2	6	1145484	1145489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_012633	AAT	2	6	1145520	1145525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_012633	A	7	7	1145530	1145536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_012633	GTT	2	6	1148002	1148007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_012633	AGC	2	6	1148034	1148039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_012633	ATA	2	6	1148066	1148071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_012633	TACG	2	8	1148087	1148094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8527	NC_012633	AGC	2	6	1150817	1150822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8528	NC_012633	CTC	2	6	1150879	1150884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8529	NC_012633	A	6	6	1150895	1150900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_012633	CAAA	2	8	1150948	1150955	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8531	NC_012633	AAT	2	6	1151297	1151302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_012633	TAC	2	6	1151313	1151318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_012633	T	6	6	1152776	1152781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_012633	A	6	6	1152790	1152795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_012633	GAA	2	6	1152813	1152818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_012633	T	6	6	1152863	1152868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_012633	TA	3	6	1152876	1152881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_012633	A	6	6	1152898	1152903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_012633	ACG	2	6	1152913	1152918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_012633	ATTT	2	8	1153918	1153925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_012633	TTG	2	6	1153958	1153963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_012633	CA	3	6	1154030	1154035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8543	NC_012633	ACA	2	6	1154039	1154044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8544	NC_012633	AGC	2	6	1155656	1155661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8545	NC_012633	TA	3	6	1155737	1155742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_012633	TA	3	6	1156338	1156343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_012633	CAA	2	6	1156357	1156362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8548	NC_012633	GGAGC	2	10	1156385	1156394	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8549	NC_012633	CAC	2	6	1156413	1156418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8550	NC_012633	GAC	2	6	1156430	1156435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_012633	GAG	2	6	1157889	1157894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_012633	GCA	2	6	1157910	1157915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8553	NC_012633	TA	3	6	1158495	1158500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_012633	TA	3	6	1158522	1158527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_012633	ATT	2	6	1158531	1158536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_012633	TAA	2	6	1158546	1158551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_012633	CTG	2	6	1158574	1158579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_012633	TAC	2	6	1158664	1158669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8559	NC_012633	CAA	2	6	1158681	1158686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8560	NC_012633	AATAT	2	10	1158699	1158708	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_012633	ATT	2	6	1158735	1158740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_012633	CTA	2	6	1158750	1158755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8563	NC_012633	A	6	6	1158757	1158762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_012633	GAATT	2	10	1158819	1158828	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_012633	AAAG	2	8	1158877	1158884	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_012633	TAAC	2	8	1158888	1158895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8567	NC_012633	TAT	2	6	1158910	1158915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_012633	TA	3	6	1158953	1158958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_012633	A	9	9	1158961	1158969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_012633	ATA	2	6	1158977	1158982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_012633	TATG	2	8	1158987	1158994	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8573	NC_012633	TTA	2	6	1159032	1159037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_012633	CTA	2	6	1159073	1159078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8575	NC_012633	TA	3	6	1159084	1159089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_012633	GCA	2	6	1159099	1159104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8578	NC_012633	AAT	2	6	1159168	1159173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_012633	TTC	2	6	1159185	1159190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8580	NC_012633	ACT	2	6	1159228	1159233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8581	NC_012633	TTA	2	6	1159258	1159263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8584	NC_012633	AATC	2	8	1159346	1159353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8585	NC_012633	TAAT	2	8	1159397	1159404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8588	NC_012633	AT	3	6	1159614	1159619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_012633	TGA	2	6	1159620	1159625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8594	NC_012633	GTTG	2	8	1159807	1159814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_012633	ATTT	2	8	1159837	1159844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8598	NC_012633	TTA	2	6	1160038	1160043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_012633	CAA	2	6	1160071	1160076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_012633	GAA	2	6	1160162	1160167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_012633	TTCC	2	8	1160233	1160240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8602	NC_012633	TCC	2	6	1160247	1160252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8603	NC_012633	TAA	2	6	1160324	1160329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_012633	TTC	2	6	1160353	1160358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8605	NC_012633	CTT	2	6	1160414	1160419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_012633	TCA	2	6	1160443	1160448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8609	NC_012633	A	6	6	1160558	1160563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_012633	T	7	7	1160625	1160631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_012633	GGT	2	6	1160652	1160657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_012633	TTG	2	6	1160659	1160664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_012633	TA	5	10	1164433	1164442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_012633	GAG	2	6	1164490	1164495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_012633	TAT	2	6	1164601	1164606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_012633	TAT	2	6	1164751	1164756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_012633	TCGC	2	8	1164785	1164792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8618	NC_012633	GAC	2	6	1164796	1164801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_012633	ATTC	2	8	1164854	1164861	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8621	NC_012633	T	7	7	1164999	1165005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_012633	TTC	2	6	1165007	1165012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8623	NC_012633	GAA	2	6	1165021	1165026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_012633	TAA	2	6	1165115	1165120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_012633	TGA	2	6	1165149	1165154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_012633	TAC	2	6	1165178	1165183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8627	NC_012633	AGT	2	6	1165198	1165203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8628	NC_012633	A	6	6	1165214	1165219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_012633	CTT	2	6	1165278	1165283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8630	NC_012633	T	7	7	1165282	1165288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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