MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 9524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012633	A	6	6	1059759	1059764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_012633	T	6	6	1059765	1059770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_012633	AAT	2	6	1059784	1059789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_012633	A	6	6	1059803	1059808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_012633	TA	3	6	1059889	1059894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_012633	A	6	6	1059896	1059901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_012633	GTAA	2	8	1059923	1059930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_012633	ACC	2	6	1059985	1059990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_012633	ATTAA	2	10	1060004	1060013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_012633	ATT	2	6	1060046	1060051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_012633	GTC	2	6	1060063	1060068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_012633	TAAA	2	8	1060108	1060115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_012633	A	7	7	1060163	1060169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_012633	AG	3	6	1060191	1060196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_012633	GAT	2	6	1060197	1060202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_012633	CTT	2	6	1060228	1060233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_012633	ATTT	2	8	1060292	1060299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_012633	ACA	2	6	1060343	1060348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_012633	ATTA	2	8	1060394	1060401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_012633	ATT	2	6	1060425	1060430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_012633	TTA	2	6	1060456	1060461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_012633	AT	3	6	1060507	1060512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_012633	GCA	2	6	1060522	1060527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_012633	TAA	2	6	1060539	1060544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_012633	TA	3	6	1060549	1060554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_012633	T	10	10	1060608	1060617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_012633	T	6	6	1062233	1062238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_012633	AATC	2	8	1062305	1062312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8029	NC_012633	TC	3	6	1062311	1062316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8030	NC_012633	TAT	2	6	1062335	1062340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_012633	CTTTA	2	10	1062374	1062383	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8032	NC_012633	AAG	2	6	1062386	1062391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_012633	AAC	2	6	1062471	1062476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_012633	AG	3	6	1062487	1062492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_012633	TTA	2	6	1062508	1062513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_012633	T	6	6	1062541	1062546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_012633	TAT	2	6	1062551	1062556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_012633	CCT	2	6	1062557	1062562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8039	NC_012633	TAC	2	6	1062569	1062574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_012633	A	6	6	1062581	1062586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_012633	GAT	2	6	1062592	1062597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_012633	A	6	6	1062621	1062626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_012633	TATT	2	8	1062630	1062637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_012633	AAT	2	6	1062645	1062650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_012633	ATT	2	6	1063050	1063055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_012633	A	6	6	1063060	1063065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_012633	TTTTTG	2	12	1063139	1063150	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_012633	TTC	2	6	1063158	1063163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_012633	TAC	2	6	1063172	1063177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_012633	AT	3	6	1063195	1063200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_012633	ATTC	2	8	1063202	1063209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8052	NC_012633	T	6	6	1063220	1063225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_012633	AAT	2	6	1063277	1063282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_012633	TA	3	6	1063346	1063351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_012633	ATT	2	6	1063415	1063420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_012633	TGA	2	6	1063427	1063432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_012633	TGGTA	2	10	1063444	1063453	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_012633	AGT	2	6	1063461	1063466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_012633	TAG	2	6	1063550	1063555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8061	NC_012633	GAT	2	6	1063617	1063622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_012633	ATA	3	9	1063647	1063655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_012633	AC	3	6	1063680	1063685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8064	NC_012633	T	7	7	1064606	1064612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_012633	AATA	2	8	1065137	1065144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_012633	ATT	2	6	1065377	1065382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_012633	ACC	2	6	1065430	1065435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8068	NC_012633	GT	3	6	1065689	1065694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8070	NC_012633	ATT	2	6	1065736	1065741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_012633	ATA	2	6	1065759	1065764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_012633	CA	3	6	1065780	1065785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8073	NC_012633	T	7	7	1067961	1067967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_012633	TGT	2	6	1067973	1067978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8077	NC_012633	GAG	2	6	1068799	1068804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_012633	ATT	2	6	1069904	1069909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_012633	AAT	2	6	1069914	1069919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_012633	AACG	2	8	1069981	1069988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8081	NC_012633	TCA	2	6	1070103	1070108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_012633	GTTT	2	8	1070130	1070137	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_012633	TA	4	8	1070165	1070172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_012633	T	6	6	1070189	1070194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_012633	ATT	2	6	1070211	1070216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8087	NC_012633	T	6	6	1070255	1070260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_012633	AATA	2	8	1070266	1070273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_012633	GGC	2	6	1070285	1070290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8091	NC_012633	AT	3	6	1070351	1070356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_012633	ATA	2	6	1070478	1070483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8098	NC_012633	ATT	2	6	1070896	1070901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8100	NC_012633	T	7	7	1070922	1070928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_012633	AT	3	6	1071022	1071027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_012633	AAAAT	2	10	1071088	1071097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_012633	CTT	2	6	1071104	1071109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_012633	AT	3	6	1071128	1071133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_012633	TAA	2	6	1071161	1071166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8108	NC_012633	TTTC	2	8	1071278	1071285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8109	NC_012633	CAA	2	6	1071344	1071349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_012633	AT	3	6	1071410	1071415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_012633	T	6	6	1071430	1071435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_012633	ATA	2	6	1071445	1071450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_012633	T	6	6	1071666	1071671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_012633	GTC	2	6	1071679	1071684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8116	NC_012633	TA	3	6	1071709	1071714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_012633	GAC	2	6	1071720	1071725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8119	NC_012633	TCT	2	6	1071830	1071835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_012633	CTTC	2	8	1071852	1071859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_012633	CT	3	6	1071923	1071928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8122	NC_012633	CAT	2	6	1071934	1071939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_012633	TTA	2	6	1071946	1071951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_012633	T	6	6	1071971	1071976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_012633	CAT	2	6	1071982	1071987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_012633	TTTA	2	8	1072013	1072020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_012633	AT	3	6	1072069	1072074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_012633	ACA	2	6	1072098	1072103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_012633	CTC	2	6	1072112	1072117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8130	NC_012633	TTA	2	6	1072137	1072142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_012633	ATCTGT	2	12	1072226	1072237	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8132	NC_012633	TTTA	2	8	1072274	1072281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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