MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 11442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011369	AG	3	6	1345669	1345674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_011369	GGT	2	6	1346909	1346914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_011369	G	6	6	1347040	1347045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_011369	CGG	2	6	1347104	1347109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_011369	CGAAC	2	10	1347695	1347704	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3506	NC_011369	CTG	2	6	1348126	1348131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_011369	TTC	2	6	1348200	1348205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_011369	GCA	2	6	1348229	1348234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_011369	ACT	2	6	1348278	1348283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_011369	CCGT	2	8	1348317	1348324	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_011369	GCG	2	6	1352527	1352532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_011369	CCG	2	6	1352543	1352548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_011369	CCGTAT	2	12	1352553	1352564	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_011369	CGC	2	6	1352584	1352589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_011369	GAGG	2	8	1352615	1352622	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_011369	GCC	2	6	1352639	1352644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_011369	CGA	2	6	1356907	1356912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_011369	CCA	2	6	1356913	1356918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_011369	GTTTTT	2	12	1356965	1356976	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_011369	AGGT	2	8	1356984	1356991	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_011369	TGC	2	6	1357006	1357011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_011369	TGC	2	6	1357022	1357027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_011369	GCG	2	6	1357048	1357053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_011369	CTG	2	6	1357396	1357401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_011369	CGC	2	6	1357413	1357418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_011369	GCC	2	6	1357477	1357482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_011369	GAC	2	6	1357563	1357568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_011369	AGT	2	6	1357582	1357587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_011369	ATG	2	6	1357682	1357687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_011369	GCAC	2	8	1357690	1357697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_011369	AAT	2	6	1358235	1358240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_011369	TCC	2	6	1358257	1358262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_011369	TGA	2	6	1358266	1358271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_011369	CCA	2	6	1362158	1362163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_011369	AAGGA	2	10	1362169	1362178	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_011369	TGAG	2	8	1362627	1362634	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_011369	GC	3	6	1366481	1366486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_011369	GAA	2	6	1367144	1367149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_011369	AGC	2	6	1367441	1367446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_011369	ACC	2	6	1367508	1367513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_011369	CGAT	2	8	1367520	1367527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3542	NC_011369	TGC	2	6	1367556	1367561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_011369	CGGC	2	8	1367575	1367582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_011369	AAG	2	6	1367635	1367640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_011369	ACG	2	6	1368895	1368900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_011369	ACAG	2	8	1369664	1369671	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_011369	CCGG	2	8	1370597	1370604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_011369	GCCG	2	8	1370615	1370622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_011369	GAAAA	2	10	1370698	1370707	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_011369	GGA	2	6	1371517	1371522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_011369	TGA	2	6	1372012	1372017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_011369	TGGC	2	8	1372081	1372088	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3553	NC_011369	GC	3	6	1372087	1372092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_011369	AAT	2	6	1372168	1372173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_011369	GGCC	2	8	1372191	1372198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_011369	CAG	2	6	1374264	1374269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_011369	CGG	2	6	1374920	1374925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_011369	GGT	2	6	1375379	1375384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_011369	TGG	2	6	1375411	1375416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_011369	AACG	2	8	1375418	1375425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_011369	GCG	2	6	1376449	1376454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_011369	CCGC	2	8	1376479	1376486	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3563	NC_011369	AGGC	2	8	1376512	1376519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_011369	CAG	2	6	1376546	1376551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_011369	AAACA	2	10	1377065	1377074	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3566	NC_011369	TGTT	2	8	1377102	1377109	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_011369	CGG	2	6	1377141	1377146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_011369	CCGC	2	8	1379299	1379306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3569	NC_011369	GT	3	6	1379336	1379341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_011369	T	6	6	1379459	1379464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_011369	CCG	2	6	1379587	1379592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_011369	CAG	2	6	1379615	1379620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_011369	GCC	2	6	1379644	1379649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_011369	TGA	2	6	1379660	1379665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_011369	CG	3	6	1381531	1381536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_011369	TGC	2	6	1381933	1381938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_011369	ATG	2	6	1381945	1381950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_011369	GAC	2	6	1381974	1381979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_011369	ATC	2	6	1382040	1382045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_011369	TTC	2	6	1382491	1382496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_011369	CTTTC	2	10	1382511	1382520	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3582	NC_011369	GAT	2	6	1382542	1382547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_011369	ATG	2	6	1382603	1382608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_011369	CAT	2	6	1382637	1382642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_011369	AGTGT	2	10	1385817	1385826	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_011369	GCCGTC	2	12	1385839	1385850	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_011369	GCG	2	6	1386886	1386891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_011369	TTA	2	6	1387860	1387865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_011369	ATG	2	6	1387874	1387879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_011369	ATG	2	6	1388837	1388842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_011369	CAT	2	6	1388865	1388870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_011369	TCC	2	6	1390596	1390601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_011369	ATCG	2	8	1392264	1392271	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3594	NC_011369	ACC	2	6	1392316	1392321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_011369	CTC	2	6	1392333	1392338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_011369	CGA	2	6	1393294	1393299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_011369	A	6	6	1393326	1393331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_011369	CGG	2	6	1393483	1393488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_011369	T	6	6	1393523	1393528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_011369	GAG	2	6	1398674	1398679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_011369	TTC	2	6	1398735	1398740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_011369	CGA	2	6	1400060	1400065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_011369	AGT	2	6	1406382	1406387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_011369	AAG	2	6	1411009	1411014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_011369	GAG	2	6	1411056	1411061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_011369	CG	3	6	1411077	1411082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_011369	CGG	2	6	1411144	1411149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_011369	CCG	2	6	1411200	1411205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_011369	GGCG	2	8	1411220	1411227	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3610	NC_011369	ACG	2	6	1414089	1414094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_011369	ACTG	2	8	1414193	1414200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_011369	ATC	2	6	1415112	1415117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_011369	ATCA	2	8	1419299	1419306	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3614	NC_011369	CGC	2	6	1419335	1419340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_011369	TGGT	2	8	1419345	1419352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_011369	AGG	2	6	1419387	1419392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_011369	GTCC	2	8	1419814	1419821	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_011369	ATC	2	6	1419838	1419843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_011369	GC	3	6	1419863	1419868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_011369	CGT	2	6	1419877	1419882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_011369	CGG	2	6	1420749	1420754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_011369	CGC	2	6	1420760	1420765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_011369	GAG	2	6	1420772	1420777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_011369	GCCGC	2	10	1421535	1421544	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3625	NC_011369	CGT	2	6	1422021	1422026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_011369	GTC	2	6	1423113	1423118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_011369	TCC	2	6	1424964	1424969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_011369	GAC	2	6	1424978	1424983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3630	NC_011369	TTTTC	2	10	1425015	1425024	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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