MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 11442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_011369	GCT	2	6	3019472	3019477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_011369	AAC	2	6	3019487	3019492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_011369	CTG	2	6	3019506	3019511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_011369	GAA	2	6	3020207	3020212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_011369	TGA	2	6	3020226	3020231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_011369	TAT	2	6	3020277	3020282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_011369	AAT	2	6	3020365	3020370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_011369	ACCAG	2	10	3020430	3020439	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8009	NC_011369	TGC	2	6	3020509	3020514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_011369	TGG	2	6	3020543	3020548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_011369	CTG	2	6	3020611	3020616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_011369	TCG	2	6	3021676	3021681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_011369	CCGC	2	8	3021748	3021755	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8014	NC_011369	ATC	2	6	3021804	3021809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_011369	AG	3	6	3021814	3021819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_011369	CCG	2	6	3021830	3021835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_011369	CGA	2	6	3021893	3021898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_011369	GCCG	2	8	3021923	3021930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8019	NC_011369	GAA	2	6	3021935	3021940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_011369	A	7	7	3021965	3021971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_011369	TCA	2	6	3022002	3022007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_011369	CCG	2	6	3022196	3022201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_011369	A	6	6	3022210	3022215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_011369	GA	3	6	3022225	3022230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_011369	AAC	2	6	3023319	3023324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_011369	AGC	2	6	3025030	3025035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_011369	TGC	2	6	3025047	3025052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_011369	ATT	2	6	3026965	3026970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_011369	ACC	2	6	3026974	3026979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8030	NC_011369	ACA	2	6	3028586	3028591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_011369	CAA	2	6	3028597	3028602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_011369	CCGA	2	8	3030486	3030493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_011369	GCT	2	6	3030501	3030506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_011369	ACA	2	6	3030515	3030520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_011369	ATT	2	6	3034431	3034436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_011369	CAT	2	6	3034489	3034494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_011369	TAA	2	6	3034498	3034503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_011369	CAAC	2	8	3034525	3034532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8039	NC_011369	GAA	2	6	3034538	3034543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_011369	CTG	2	6	3034554	3034559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_011369	CG	3	6	3035579	3035584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8042	NC_011369	GCGG	2	8	3035630	3035637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8043	NC_011369	GGA	2	6	3036357	3036362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_011369	CTT	2	6	3036426	3036431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_011369	GCA	2	6	3036442	3036447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_011369	CGC	2	6	3036481	3036486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8047	NC_011369	CTTC	2	8	3037823	3037830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8048	NC_011369	CT	3	6	3039616	3039621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8049	NC_011369	CGCAT	2	10	3039624	3039633	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8050	NC_011369	TTA	2	6	3039747	3039752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_011369	ACGCT	2	10	3039821	3039830	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8052	NC_011369	AT	3	6	3039833	3039838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_011369	TCT	2	6	3041720	3041725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_011369	CT	3	6	3041736	3041741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8055	NC_011369	CCG	2	6	3041742	3041747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8056	NC_011369	TTCT	2	8	3041768	3041775	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8057	NC_011369	TTC	2	6	3041787	3041792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_011369	TTC	2	6	3041808	3041813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_011369	CTA	2	6	3041870	3041875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_011369	CGG	2	6	3041910	3041915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_011369	CAA	2	6	3041966	3041971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_011369	GAC	2	6	3041985	3041990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_011369	AG	3	6	3042005	3042010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_011369	ATT	2	6	3042063	3042068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_011369	ATTG	2	8	3042109	3042116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_011369	CTT	2	6	3042130	3042135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_011369	GAA	2	6	3042143	3042148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_011369	TTA	2	6	3042183	3042188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_011369	CCG	2	6	3042202	3042207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8070	NC_011369	TG	3	6	3042235	3042240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_011369	ATT	2	6	3042243	3042248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_011369	CT	4	8	3042295	3042302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8073	NC_011369	AT	3	6	3042307	3042312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_011369	GA	3	6	3042366	3042371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_011369	TCA	2	6	3043092	3043097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8077	NC_011369	CGC	2	6	3043118	3043123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_011369	GCG	2	6	3043128	3043133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_011369	CCG	2	6	3043198	3043203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8080	NC_011369	CAA	2	6	3046199	3046204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_011369	TCA	2	6	3046946	3046951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_011369	TA	3	6	3046959	3046964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_011369	GCC	2	6	3046966	3046971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8084	NC_011369	CGAT	2	8	3046987	3046994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_011369	A	6	6	3048401	3048406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_011369	TTC	2	6	3049943	3049948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_011369	GCA	2	6	3049957	3049962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8089	NC_011369	GCCAT	2	10	3050173	3050182	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8090	NC_011369	GCA	2	6	3050850	3050855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8092	NC_011369	GGC	2	6	3050905	3050910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_011369	GCG	2	6	3050978	3050983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_011369	GACG	2	8	3051053	3051060	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8095	NC_011369	TGC	2	6	3051065	3051070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_011369	GCA	2	6	3051074	3051079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_011369	CGC	2	6	3052467	3052472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8098	NC_011369	CGT	2	6	3053616	3053621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_011369	TCC	2	6	3053642	3053647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8100	NC_011369	TGC	2	6	3053736	3053741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_011369	ATT	2	6	3053877	3053882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_011369	CAG	2	6	3053888	3053893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_011369	CCG	2	6	3053903	3053908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8104	NC_011369	CCAAA	2	10	3053917	3053926	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8105	NC_011369	A	6	6	3053965	3053970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_011369	A	7	7	3054004	3054010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_011369	ATG	3	9	3054054	3054062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_011369	GC	3	6	3056015	3056020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8109	NC_011369	TCT	2	6	3056062	3056067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_011369	GAAC	2	8	3056074	3056081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8111	NC_011369	AC	3	6	3056835	3056840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8112	NC_011369	TCGGC	2	10	3056876	3056885	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8113	NC_011369	GA	3	6	3056912	3056917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_011369	CCGT	2	8	3056945	3056952	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8115	NC_011369	T	6	6	3058478	3058483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_011369	CA	3	6	3059954	3059959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8117	NC_011369	GA	3	6	3060029	3060034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_011369	GAC	2	6	3061352	3061357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_011369	CCG	2	6	3061358	3061363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8120	NC_011369	GCA	2	6	3061394	3061399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_011369	GGC	3	9	3061411	3061419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_011369	CGG	2	6	3061437	3061442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_011369	GGCAG	2	10	3061456	3061465	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8124	NC_011369	GCA	2	6	3061487	3061492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_011369	GGC	2	6	3061495	3061500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_011369	ACC	2	6	3061502	3061507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8127	NC_011369	CTT	2	6	3061538	3061543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_011369	GA	3	6	3061600	3061605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_011369	CGG	2	6	3063010	3063015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8131	NC_011369	GC	3	6	3063247	3063252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8395	NC_011369	TAA	2	6	3190652	3190657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8396	NC_011369	CGA	2	6	3190702	3190707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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