MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 11442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011369	TGG	2	6	2305671	2305676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_011369	GCG	2	6	2305689	2305694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_011369	CGC	2	6	2305714	2305719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_011369	A	6	6	2305742	2305747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_011369	CGAT	2	8	2305748	2305755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_011369	TCGA	2	8	2305798	2305805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6007	NC_011369	CGG	2	6	2305826	2305831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_011369	CAA	2	6	2305832	2305837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_011369	ATG	2	6	2305885	2305890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_011369	AGC	2	6	2305900	2305905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_011369	GAA	2	6	2305971	2305976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_011369	CCG	2	6	2305985	2305990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_011369	GAAA	2	8	2306197	2306204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_011369	TGAA	2	8	2306233	2306240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_011369	GAT	2	6	2306249	2306254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_011369	CGA	2	6	2306330	2306335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_011369	GCC	2	6	2306412	2306417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_011369	GGC	2	6	2306437	2306442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_011369	AAC	2	6	2306450	2306455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_011369	CCT	2	6	2306496	2306501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_011369	A	6	6	2306523	2306528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_011369	TG	3	6	2306577	2306582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_011369	GTGA	2	8	2308558	2308565	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_011369	TGCCC	2	10	2310151	2310160	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6025	NC_011369	TGCC	2	8	2310183	2310190	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6026	NC_011369	ACG	2	6	2310228	2310233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_011369	TGC	2	6	2310285	2310290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_011369	ATCA	2	8	2310292	2310299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6029	NC_011369	TGC	2	6	2310322	2310327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_011369	TCC	2	6	2310331	2310336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_011369	AGGAA	2	10	2310354	2310363	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_011369	GCC	2	6	2311164	2311169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_011369	GCCG	2	8	2311181	2311188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_011369	TCC	2	6	2311198	2311203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_011369	GCA	2	6	2311252	2311257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_011369	GCT	2	6	2311592	2311597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_011369	ACG	2	6	2313204	2313209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_011369	AAT	2	6	2313289	2313294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_011369	TGAA	2	8	2313317	2313324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_011369	GCC	2	6	2313362	2313367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_011369	GA	3	6	2313412	2313417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_011369	TCG	2	6	2314943	2314948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_011369	CGG	2	6	2314996	2315001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_011369	TGT	2	6	2315034	2315039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_011369	CGG	2	6	2315135	2315140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_011369	CGG	2	6	2315156	2315161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_011369	ACT	2	6	2315163	2315168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_011369	TGG	2	6	2318228	2318233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_011369	GCC	2	6	2318262	2318267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_011369	GA	3	6	2318311	2318316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_011369	CAA	2	6	2318410	2318415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_011369	GCC	2	6	2319684	2319689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_011369	GCC	2	6	2319775	2319780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_011369	CAA	2	6	2319801	2319806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_011369	GAG	2	6	2319821	2319826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_011369	GCC	2	6	2319889	2319894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_011369	AG	4	8	2319937	2319944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_011369	CG	3	6	2319961	2319966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_011369	CGC	2	6	2319970	2319975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_011369	CAA	2	6	2319997	2320002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_011369	GAG	2	6	2320017	2320022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_011369	GAGG	2	8	2320047	2320054	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_011369	GCC	2	6	2320084	2320089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_011369	GA	3	6	2320131	2320136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_011369	GCC	2	6	2320173	2320178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_011369	CAA	2	6	2320198	2320203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_011369	CCT	2	6	2320209	2320214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_011369	GAG	2	6	2320218	2320223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_011369	TGGC	2	8	2320257	2320264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6070	NC_011369	GGC	2	6	2321331	2321336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_011369	CAT	2	6	2321337	2321342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_011369	TCG	2	6	2321351	2321356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_011369	CAT	2	6	2321371	2321376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_011369	CCG	2	6	2321416	2321421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6075	NC_011369	TGA	2	6	2322034	2322039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_011369	GAC	2	6	2322419	2322424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_011369	CCT	2	6	2323153	2323158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_011369	TC	3	6	2325651	2325656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6079	NC_011369	CGG	2	6	2325716	2325721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_011369	CTC	3	9	2326557	2326565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_011369	TAT	2	6	2326611	2326616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_011369	GCC	2	6	2326661	2326666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_011369	TCC	2	6	2327119	2327124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_011369	TC	3	6	2327157	2327162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_011369	GTGG	2	8	2327167	2327174	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_011369	GTT	2	6	2327177	2327182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_011369	CGA	2	6	2328277	2328282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_011369	GCC	2	6	2328316	2328321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6089	NC_011369	GCGA	2	8	2328357	2328364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_011369	GCGAAA	2	12	2328460	2328471	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6091	NC_011369	GGC	2	6	2328474	2328479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_011369	CTC	2	6	2329642	2329647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6093	NC_011369	CG	3	6	2332530	2332535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_011369	CG	4	8	2332552	2332559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6095	NC_011369	AGG	2	6	2332568	2332573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_011369	ATGC	2	8	2332588	2332595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6097	NC_011369	CCCG	2	8	2332651	2332658	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6098	NC_011369	AT	3	6	2332729	2332734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_011369	TGGC	2	8	2332773	2332780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6100	NC_011369	GAT	2	6	2332790	2332795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_011369	GTC	2	6	2332847	2332852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_011369	CG	3	6	2332925	2332930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_011369	GGA	2	6	2332948	2332953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_011369	TGG	2	6	2332961	2332966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_011369	A	6	6	2332970	2332975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_011369	CT	3	6	2333039	2333044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6107	NC_011369	TCC	2	6	2333051	2333056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_011369	CCTC	2	8	2333090	2333097	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6109	NC_011369	CGC	2	6	2333139	2333144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_011369	CT	3	6	2333244	2333249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_011369	TCC	2	6	2333267	2333272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_011369	CCTC	2	8	2333306	2333313	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6113	NC_011369	CGC	2	6	2333357	2333362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_011369	GCT	2	6	2333366	2333371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_011369	CTGC	2	8	2334676	2334683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_011369	GCC	2	6	2334755	2334760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_011369	GCC	2	6	2334809	2334814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_011369	CCCGG	2	10	2334818	2334827	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6119	NC_011369	CGC	2	6	2334853	2334858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_011369	CTTG	2	8	2334861	2334868	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6121	NC_011369	GCAT	2	8	2334875	2334882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6122	NC_011369	CGA	2	6	2334894	2334899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_011369	GAC	2	6	2334901	2334906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_011369	CG	3	6	2334936	2334941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_011369	GGGC	2	8	2334952	2334959	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6126	NC_011369	CCG	2	6	2334974	2334979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_011369	GCT	2	6	2334981	2334986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_011369	GCG	2	6	2335020	2335025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_011369	GGC	2	6	2335110	2335115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_011369	CCG	2	6	2335120	2335125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6131	NC_011369	GGC	2	6	2335237	2335242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_011369	GTC	2	6	2335245	2335250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6134	NC_011369	GATC	2	8	2335400	2335407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6244	NC_011369	GGTG	2	8	2362742	2362749	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_011369	CCA	2	6	2362843	2362848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6248	NC_011369	AAC	2	6	2363028	2363033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6249	NC_011369	CGT	2	6	2363040	2363045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6250	NC_011369	TGATC	2	10	2363065	2363074	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6251	NC_011369	GGA	2	6	2363076	2363081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6253	NC_011369	CT	3	6	2363830	2363835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6254	NC_011369	T	7	7	2363835	2363841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_011369	GCC	2	6	2363853	2363858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6256	NC_011369	AAG	2	6	2365522	2365527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_011369	GCG	2	6	2365535	2365540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6258	NC_011369	GGA	2	6	2365592	2365597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_011369	GCC	2	6	2365599	2365604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6260	NC_011369	AGG	2	6	2365620	2365625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6262	NC_011369	CAT	2	6	2365674	2365679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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