MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_011004	CGC	2	6	5603080	5603085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17002	NC_011004	GGC	2	6	5603091	5603096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17003	NC_011004	GA	3	6	5603108	5603113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_011004	GC	3	6	5603139	5603144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17005	NC_011004	AT	3	6	5603155	5603160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17006	NC_011004	TA	3	6	5603166	5603171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_011004	AGA	2	6	5603185	5603190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17008	NC_011004	TGC	2	6	5603216	5603221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17009	NC_011004	TGT	2	6	5603258	5603263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_011004	CT	3	6	5603287	5603292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17011	NC_011004	T	6	6	5603301	5603306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_011004	CA	3	6	5603358	5603363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17013	NC_011004	CTG	2	6	5603375	5603380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17014	NC_011004	GAG	2	6	5603424	5603429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_011004	GCT	2	6	5603443	5603448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17016	NC_011004	CAG	2	6	5603449	5603454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17017	NC_011004	CGG	2	6	5603500	5603505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17018	NC_011004	CCG	2	6	5603513	5603518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17019	NC_011004	GAACG	2	10	5603538	5603547	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17020	NC_011004	TCT	2	6	5611384	5611389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17021	NC_011004	TTC	2	6	5611391	5611396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17022	NC_011004	GC	3	6	5611409	5611414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17023	NC_011004	CG	3	6	5611419	5611424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17024	NC_011004	ACC	2	6	5611440	5611445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17025	NC_011004	GC	3	6	5611470	5611475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17026	NC_011004	GC	3	6	5611478	5611483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17027	NC_011004	ACGA	2	8	5611495	5611502	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17028	NC_011004	CGG	2	6	5611552	5611557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17029	NC_011004	TGG	2	6	5611561	5611566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_011004	CGC	2	6	5611585	5611590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17031	NC_011004	GCA	2	6	5614719	5614724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17032	NC_011004	CTG	2	6	5614747	5614752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17033	NC_011004	CTC	2	6	5614789	5614794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17034	NC_011004	CACCC	2	10	5614830	5614839	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
17035	NC_011004	CG	4	8	5614846	5614853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17036	NC_011004	GC	3	6	5614863	5614868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17037	NC_011004	CGG	2	6	5614874	5614879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17038	NC_011004	GCT	2	6	5614881	5614886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17039	NC_011004	CCG	2	6	5614918	5614923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17040	NC_011004	CGC	2	6	5614939	5614944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17041	NC_011004	GC	3	6	5614953	5614958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17042	NC_011004	GCG	2	6	5614974	5614979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17043	NC_011004	CGGC	2	8	5615581	5615588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17044	NC_011004	CCATC	2	10	5615605	5615614	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17045	NC_011004	GGT	2	6	5615648	5615653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_011004	GCG	2	6	5615703	5615708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17047	NC_011004	CT	4	8	5616479	5616486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17048	NC_011004	AGCG	2	8	5616517	5616524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17049	NC_011004	CGG	2	6	5616554	5616559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17050	NC_011004	TCGC	2	8	5616650	5616657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17051	NC_011004	CG	3	6	5616688	5616693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17052	NC_011004	GAC	2	6	5616707	5616712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17053	NC_011004	GAG	2	6	5616713	5616718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_011004	CATA	2	8	5617208	5617215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17055	NC_011004	CCG	2	6	5617291	5617296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17056	NC_011004	GCCTC	2	10	5617324	5617333	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17057	NC_011004	GCC	2	6	5617359	5617364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17058	NC_011004	GGCA	2	8	5617370	5617377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17059	NC_011004	CG	3	6	5617386	5617391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17060	NC_011004	CGC	2	6	5617416	5617421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17061	NC_011004	TTGT	2	8	5617458	5617465	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17062	NC_011004	TCGC	2	8	5620073	5620080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17063	NC_011004	CG	3	6	5620141	5620146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17064	NC_011004	CG	3	6	5620152	5620157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17065	NC_011004	GC	3	6	5620180	5620185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17066	NC_011004	CGC	2	6	5620189	5620194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17067	NC_011004	CAT	2	6	5620199	5620204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17068	NC_011004	ATG	2	6	5620208	5620213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17069	NC_011004	GCG	2	6	5620237	5620242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17070	NC_011004	GGC	2	6	5620254	5620259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17071	NC_011004	CAA	2	6	5620272	5620277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17072	NC_011004	GC	3	6	5621144	5621149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17073	NC_011004	CG	4	8	5621152	5621159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17074	NC_011004	CTC	2	6	5622253	5622258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17075	NC_011004	ACG	2	6	5622298	5622303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17076	NC_011004	ATC	2	6	5622330	5622335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17077	NC_011004	GC	3	6	5623425	5623430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17078	NC_011004	CGC	2	6	5623441	5623446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17079	NC_011004	CGC	2	6	5623491	5623496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17080	NC_011004	C	6	6	5623506	5623511	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17081	NC_011004	CAA	2	6	5625153	5625158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17082	NC_011004	CGT	2	6	5625159	5625164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17083	NC_011004	CATC	2	8	5625186	5625193	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17084	NC_011004	GTT	2	6	5625218	5625223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17085	NC_011004	GATG	2	8	5625232	5625239	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17086	NC_011004	CG	3	6	5626564	5626569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17087	NC_011004	GC	3	6	5628810	5628815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17088	NC_011004	GCG	3	9	5628833	5628841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17089	NC_011004	CCG	2	6	5628884	5628889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17090	NC_011004	GCG	2	6	5628913	5628918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17091	NC_011004	GC	3	6	5628922	5628927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17092	NC_011004	CGG	2	6	5628935	5628940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17093	NC_011004	CACGC	2	10	5630618	5630627	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17094	NC_011004	GCC	2	6	5630639	5630644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17095	NC_011004	ACGG	2	8	5630677	5630684	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17096	NC_011004	GCCG	2	8	5631654	5631661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17097	NC_011004	CGA	2	6	5631662	5631667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17098	NC_011004	CGG	2	6	5632069	5632074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17099	NC_011004	AGC	2	6	5632097	5632102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17100	NC_011004	GC	3	6	5632101	5632106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17101	NC_011004	CG	3	6	5632147	5632152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17102	NC_011004	GCC	2	6	5632176	5632181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17103	NC_011004	TCGC	2	8	5632209	5632216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17104	NC_011004	TGGC	2	8	5632240	5632247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17105	NC_011004	TC	3	6	5634815	5634820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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17108	NC_011004	CGC	2	6	5634895	5634900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17109	NC_011004	GC	3	6	5634925	5634930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17110	NC_011004	AAC	2	6	5635369	5635374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17111	NC_011004	CGGCG	2	10	5635375	5635384	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17112	NC_011004	GGTTA	2	10	5635412	5635421	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17113	NC_011004	A	6	6	5635421	5635426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17114	NC_011004	CG	5	10	5635471	5635480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17121	NC_011004	GC	5	10	5639398	5639407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17126	NC_011004	GCG	2	6	5639785	5639790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17129	NC_011004	CGC	2	6	5642584	5642589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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17131	NC_011004	TTGT	2	8	5644411	5644418	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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17253	NC_011004	GCC	2	6	5673762	5673767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17254	NC_011004	GAAAC	2	10	5673821	5673830	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17255	NC_011004	GCC	2	6	5673833	5673838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17256	NC_011004	GGC	2	6	5673845	5673850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17257	NC_011004	ATT	2	6	5673858	5673863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17393	NC_011004	GCCGC	2	10	5711109	5711118	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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17500	NC_011004	GCG	2	6	5742622	5742627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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