MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_011004	GCT	2	6	5467870	5467875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16502	NC_011004	GAAT	2	8	5468010	5468017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16503	NC_011004	CAT	2	6	5468065	5468070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16504	NC_011004	GC	3	6	5468112	5468117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16505	NC_011004	AGA	2	6	5468118	5468123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16506	NC_011004	CAG	2	6	5468481	5468486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16507	NC_011004	CGC	2	6	5468966	5468971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16508	NC_011004	CGG	2	6	5468995	5469000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16509	NC_011004	CG	3	6	5469003	5469008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16510	NC_011004	CCG	2	6	5469014	5469019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16511	NC_011004	TTCG	2	8	5469022	5469029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16512	NC_011004	GATT	2	8	5469048	5469055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16513	NC_011004	AAG	2	6	5469063	5469068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16514	NC_011004	CGC	2	6	5469754	5469759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16515	NC_011004	CAC	2	6	5469923	5469928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16516	NC_011004	TG	3	6	5469971	5469976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16517	NC_011004	AAGC	2	8	5469987	5469994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16518	NC_011004	CGAAG	2	10	5470000	5470009	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16519	NC_011004	AGG	2	6	5470015	5470020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16520	NC_011004	CG	3	6	5470038	5470043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16521	NC_011004	CCT	2	6	5471712	5471717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16522	NC_011004	CT	3	6	5472834	5472839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16523	NC_011004	GAC	2	6	5473727	5473732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16524	NC_011004	CGA	2	6	5473802	5473807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16525	NC_011004	GCG	2	6	5473880	5473885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16526	NC_011004	GACC	2	8	5473887	5473894	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16527	NC_011004	GCG	2	6	5473952	5473957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16528	NC_011004	GCA	2	6	5473965	5473970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16529	NC_011004	CGC	2	6	5473979	5473984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16530	NC_011004	GC	3	6	5474020	5474025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16531	NC_011004	TGT	2	6	5474395	5474400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16532	NC_011004	CGC	2	6	5474401	5474406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16533	NC_011004	GC	3	6	5477810	5477815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16534	NC_011004	ACT	2	6	5478227	5478232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16535	NC_011004	TCG	2	6	5478280	5478285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16536	NC_011004	TCGC	2	8	5478308	5478315	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16537	NC_011004	CGT	2	6	5478390	5478395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16538	NC_011004	CTC	2	6	5479485	5479490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16539	NC_011004	TCTCGC	2	12	5479750	5479761	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16540	NC_011004	TGCTC	2	10	5480654	5480663	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16541	NC_011004	CGT	2	6	5480675	5480680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16542	NC_011004	GCG	2	6	5483531	5483536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16543	NC_011004	GGT	2	6	5483550	5483555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16544	NC_011004	CGG	2	6	5485169	5485174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16545	NC_011004	GTT	2	6	5486683	5486688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16546	NC_011004	GCC	2	6	5486702	5486707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16547	NC_011004	GGC	2	6	5486713	5486718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16548	NC_011004	TC	3	6	5487654	5487659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16549	NC_011004	CTT	2	6	5487703	5487708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16550	NC_011004	GT	4	8	5487837	5487844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16551	NC_011004	CGC	2	6	5487903	5487908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16552	NC_011004	GAC	2	6	5487915	5487920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16553	NC_011004	GAAAC	2	10	5487941	5487950	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16554	NC_011004	CCGG	2	8	5487960	5487967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16555	NC_011004	CTGCG	2	10	5488004	5488013	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16556	NC_011004	TGCG	2	8	5488018	5488025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16557	NC_011004	ATG	2	6	5488189	5488194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16558	NC_011004	GGT	2	6	5489630	5489635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16559	NC_011004	GCC	2	6	5489646	5489651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16560	NC_011004	GCG	2	6	5489652	5489657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16561	NC_011004	CGT	2	6	5492115	5492120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16562	NC_011004	CGC	2	6	5493697	5493702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16563	NC_011004	ACG	2	6	5493703	5493708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16564	NC_011004	GGC	2	6	5493709	5493714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16565	NC_011004	GGTG	2	8	5493720	5493727	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16566	NC_011004	TGC	2	6	5493732	5493737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16567	NC_011004	GCG	2	6	5493774	5493779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16568	NC_011004	GCT	2	6	5494055	5494060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16569	NC_011004	TGA	2	6	5494095	5494100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16570	NC_011004	GAT	2	6	5494217	5494222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16571	NC_011004	CAGA	2	8	5494240	5494247	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16572	NC_011004	GGCGC	2	10	5494251	5494260	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16573	NC_011004	TGA	2	6	5494282	5494287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16574	NC_011004	TAC	2	6	5496228	5496233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16575	NC_011004	CCG	3	9	5496246	5496254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16576	NC_011004	CAGC	2	8	5496299	5496306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16577	NC_011004	CGC	2	6	5496310	5496315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16578	NC_011004	TGA	2	6	5497217	5497222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16579	NC_011004	ACG	2	6	5497325	5497330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16580	NC_011004	TTG	2	6	5497356	5497361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16581	NC_011004	TCA	2	6	5497372	5497377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16582	NC_011004	CG	3	6	5497396	5497401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16583	NC_011004	CCA	2	6	5497435	5497440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16584	NC_011004	GTG	3	9	5497515	5497523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16585	NC_011004	TCA	2	6	5498383	5498388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16586	NC_011004	CAG	2	6	5498500	5498505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16587	NC_011004	AAG	2	6	5500424	5500429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16588	NC_011004	TTC	2	6	5500741	5500746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16589	NC_011004	AGCG	2	8	5500906	5500913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16590	NC_011004	ATC	2	6	5500948	5500953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16591	NC_011004	CAC	2	6	5501303	5501308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16592	NC_011004	TC	3	6	5501317	5501322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16593	NC_011004	GAG	2	6	5501326	5501331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16594	NC_011004	CGGCG	2	10	5501417	5501426	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16595	NC_011004	CGGC	2	8	5503188	5503195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16596	NC_011004	ACT	2	6	5503269	5503274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16597	NC_011004	A	6	6	5503334	5503339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16598	NC_011004	CGA	2	6	5503368	5503373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16599	NC_011004	GA	3	6	5503442	5503447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16600	NC_011004	GCC	2	6	5503469	5503474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16601	NC_011004	GAT	2	6	5503475	5503480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16602	NC_011004	CGGC	2	8	5503491	5503498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16603	NC_011004	CAT	2	6	5505199	5505204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16604	NC_011004	A	6	6	5505213	5505218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16605	NC_011004	CG	3	6	5505224	5505229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16606	NC_011004	CGT	2	6	5505231	5505236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16607	NC_011004	CCG	2	6	5505306	5505311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16608	NC_011004	CCGA	2	8	5505378	5505385	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16609	NC_011004	AG	4	8	5505393	5505400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16610	NC_011004	CGC	2	6	5505871	5505876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16611	NC_011004	AGC	2	6	5505889	5505894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16612	NC_011004	ACC	2	6	5505896	5505901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16613	NC_011004	GCG	2	6	5505970	5505975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16614	NC_011004	GCG	3	9	5507493	5507501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16615	NC_011004	GCC	2	6	5507507	5507512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16616	NC_011004	GAC	2	6	5508640	5508645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16617	NC_011004	CGT	3	9	5508649	5508657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16618	NC_011004	GTT	2	6	5508658	5508663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16619	NC_011004	GAG	2	6	5511601	5511606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16620	NC_011004	TTCCAA	2	12	5511611	5511622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16621	NC_011004	GA	3	6	5511627	5511632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16622	NC_011004	ACC	2	6	5512774	5512779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16623	NC_011004	TA	3	6	5512791	5512796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16624	NC_011004	GCC	2	6	5512801	5512806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16625	NC_011004	TATT	2	8	5512813	5512820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16626	NC_011004	CGG	2	6	5512831	5512836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16628	NC_011004	CCG	2	6	5512869	5512874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16862	NC_011004	ACA	3	9	5547853	5547861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16868	NC_011004	GC	3	6	5550466	5550471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16871	NC_011004	CCACC	2	10	5550529	5550538	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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16885	NC_011004	ATC	2	6	5554407	5554412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16887	NC_011004	TCC	2	6	5556076	5556081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16888	NC_011004	GTC	2	6	5556118	5556123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16892	NC_011004	CTG	2	6	5558257	5558262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16904	NC_011004	GCC	2	6	5565098	5565103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16997	NC_011004	TA	3	6	5602197	5602202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16998	NC_011004	GAC	2	6	5602238	5602243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16999	NC_011004	ACA	2	6	5602481	5602486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17000	NC_011004	CCCA	2	8	5602494	5602501	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

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