MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011004	CGG	2	6	5296120	5296125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16002	NC_011004	CGG	2	6	5296200	5296205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_011004	GAC	2	6	5296322	5296327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_011004	CT	3	6	5298377	5298382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16005	NC_011004	CT	3	6	5298391	5298396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16006	NC_011004	TCG	2	6	5298399	5298404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_011004	CTG	2	6	5298428	5298433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_011004	CCG	2	6	5298471	5298476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16009	NC_011004	AAC	2	6	5298491	5298496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_011004	CGCTG	2	10	5300182	5300191	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16011	NC_011004	GCG	2	6	5300203	5300208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_011004	CT	3	6	5300227	5300232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16013	NC_011004	CGCC	2	8	5300330	5300337	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16014	NC_011004	CG	3	6	5303109	5303114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16015	NC_011004	CCG	2	6	5303135	5303140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16016	NC_011004	GTC	2	6	5303170	5303175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_011004	GCG	3	9	5303265	5303273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_011004	CT	3	6	5304120	5304125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16019	NC_011004	TCT	2	6	5304161	5304166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_011004	CG	3	6	5304184	5304189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16021	NC_011004	GATG	2	8	5304191	5304198	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_011004	CGC	2	6	5304209	5304214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16023	NC_011004	CT	4	8	5305036	5305043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16024	NC_011004	CTC	2	6	5305050	5305055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16025	NC_011004	GTT	2	6	5307283	5307288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_011004	GCCG	2	8	5307303	5307310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16027	NC_011004	CCG	2	6	5307459	5307464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16028	NC_011004	GCC	2	6	5308364	5308369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16029	NC_011004	CGA	2	6	5308370	5308375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_011004	CGC	2	6	5310443	5310448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16031	NC_011004	CGT	2	6	5310475	5310480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_011004	AG	3	6	5310511	5310516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_011004	CGG	2	6	5310532	5310537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16034	NC_011004	GC	4	8	5310602	5310609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16035	NC_011004	TC	3	6	5310624	5310629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16036	NC_011004	GGA	2	6	5310674	5310679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_011004	GAC	2	6	5310683	5310688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16038	NC_011004	GC	3	6	5310764	5310769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16039	NC_011004	GCGG	2	8	5310811	5310818	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16040	NC_011004	ATTT	2	8	5310841	5310848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_011004	T	6	6	5310846	5310851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_011004	AAT	2	6	5310860	5310865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_011004	AG	3	6	5312513	5312518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_011004	GCC	2	6	5312538	5312543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16045	NC_011004	GGC	2	6	5312544	5312549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_011004	CCG	2	6	5312622	5312627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16047	NC_011004	CGG	2	6	5312657	5312662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_011004	CAA	2	6	5312686	5312691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16049	NC_011004	AAC	2	6	5312756	5312761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_011004	GC	3	6	5312802	5312807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16051	NC_011004	CGC	2	6	5313517	5313522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16052	NC_011004	T	7	7	5313567	5313573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_011004	GTG	2	6	5313590	5313595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_011004	TTG	2	6	5313726	5313731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_011004	GCTTC	2	10	5313753	5313762	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16056	NC_011004	CG	4	8	5313785	5313792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16057	NC_011004	TCG	2	6	5313807	5313812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_011004	AAGAC	2	10	5314961	5314970	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16059	NC_011004	AGG	2	6	5315030	5315035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_011004	TGC	2	6	5316750	5316755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16061	NC_011004	ACT	2	6	5316884	5316889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16062	NC_011004	CACCC	2	10	5317380	5317389	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
16063	NC_011004	GC	4	8	5317416	5317423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16064	NC_011004	ACT	2	6	5317437	5317442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_011004	CGG	2	6	5317451	5317456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_011004	GCC	2	6	5317513	5317518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16067	NC_011004	CG	3	6	5317520	5317525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16068	NC_011004	GCC	2	6	5317568	5317573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16069	NC_011004	GCG	2	6	5317596	5317601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16070	NC_011004	CG	3	6	5318932	5318937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16071	NC_011004	ATA	2	6	5320580	5320585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_011004	CGC	2	6	5320609	5320614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16073	NC_011004	GCC	2	6	5320619	5320624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16074	NC_011004	GCC	3	9	5320671	5320679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16075	NC_011004	GCG	2	6	5320699	5320704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16076	NC_011004	AGCC	2	8	5320803	5320810	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16077	NC_011004	CTTC	2	8	5320854	5320861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16078	NC_011004	GAC	2	6	5320873	5320878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16079	NC_011004	GT	3	6	5320942	5320947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_011004	GCT	2	6	5321057	5321062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16081	NC_011004	GTC	2	6	5321068	5321073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16082	NC_011004	CTG	2	6	5321087	5321092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16083	NC_011004	TCT	2	6	5321115	5321120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16084	NC_011004	TCCGTC	2	12	5321123	5321134	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16085	NC_011004	CG	6	12	5321141	5321152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16086	NC_011004	GAT	2	6	5321180	5321185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16087	NC_011004	GA	3	6	5321196	5321201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_011004	TGC	2	6	5321259	5321264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16089	NC_011004	TGT	2	6	5321293	5321298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_011004	CGGC	2	8	5323030	5323037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16091	NC_011004	C	6	6	5323039	5323044	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16092	NC_011004	GCCG	2	8	5323049	5323056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16093	NC_011004	TCGT	2	8	5327533	5327540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16094	NC_011004	GCG	2	6	5327560	5327565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16095	NC_011004	CAC	2	6	5327583	5327588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16096	NC_011004	GAA	2	6	5327598	5327603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_011004	CG	3	6	5327614	5327619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16098	NC_011004	GC	3	6	5327660	5327665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16099	NC_011004	GC	3	6	5327669	5327674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16100	NC_011004	CGG	2	6	5329196	5329201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_011004	GGC	2	6	5329208	5329213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_011004	CGC	2	6	5329255	5329260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16103	NC_011004	A	6	6	5329264	5329269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_011004	AT	3	6	5329407	5329412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_011004	CCG	2	6	5329461	5329466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16107	NC_011004	GGC	2	6	5330073	5330078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_011004	AAG	2	6	5330279	5330284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16110	NC_011004	GCGA	2	8	5330910	5330917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16111	NC_011004	CCG	2	6	5330951	5330956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16112	NC_011004	CG	3	6	5333181	5333186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16113	NC_011004	TTG	2	6	5334491	5334496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_011004	TCC	2	6	5334927	5334932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16115	NC_011004	GC	3	6	5334951	5334956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16116	NC_011004	AAG	2	6	5336074	5336079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_011004	CGT	2	6	5336115	5336120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_011004	TTC	2	6	5336134	5336139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_011004	TCC	2	6	5336168	5336173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16120	NC_011004	CAC	2	6	5336276	5336281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16121	NC_011004	CGC	2	6	5340106	5340111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16122	NC_011004	CCG	3	9	5340120	5340128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16123	NC_011004	GGT	2	6	5340187	5340192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_011004	CGG	2	6	5340196	5340201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16125	NC_011004	CGT	2	6	5340209	5340214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16126	NC_011004	TCC	2	6	5341068	5341073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16127	NC_011004	CAT	2	6	5341148	5341153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16128	NC_011004	GC	3	6	5341189	5341194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16129	NC_011004	GGA	2	6	5341232	5341237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16130	NC_011004	GGA	2	6	5341239	5341244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16131	NC_011004	CAC	2	6	5342827	5342832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16132	NC_011004	CGC	2	6	5342873	5342878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16134	NC_011004	CT	3	6	5342938	5342943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16135	NC_011004	GAC	2	6	5342953	5342958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16136	NC_011004	GA	3	6	5342963	5342968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16137	NC_011004	GC	3	6	5343519	5343524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16142	NC_011004	TCGT	2	8	5343668	5343675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16156	NC_011004	CG	3	6	5347844	5347849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16252	NC_011004	GCG	2	6	5375001	5375006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16253	NC_011004	TCAG	2	8	5375072	5375079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16254	NC_011004	CAAC	2	8	5375109	5375116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16255	NC_011004	GCC	2	6	5375126	5375131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16256	NC_011004	CAG	2	6	5375145	5375150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16388	NC_011004	CCCG	2	8	5411538	5411545	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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16499	NC_011004	CCT	2	6	5466528	5466533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16500	NC_011004	CGT	2	6	5467787	5467792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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