MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_011004	GC	3	6	5175456	5175461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15502	NC_011004	GAC	2	6	5175977	5175982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_011004	GC	3	6	5176055	5176060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15504	NC_011004	ACG	2	6	5176151	5176156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_011004	TCT	2	6	5178026	5178031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15506	NC_011004	AAG	2	6	5178121	5178126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_011004	GTC	2	6	5178152	5178157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15508	NC_011004	CG	3	6	5178179	5178184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15509	NC_011004	GC	3	6	5178227	5178232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15510	NC_011004	GCG	2	6	5178275	5178280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15511	NC_011004	GCC	2	6	5178294	5178299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15512	NC_011004	CAT	2	6	5178371	5178376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15513	NC_011004	CGG	2	6	5178406	5178411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15514	NC_011004	AGCGA	2	10	5178419	5178428	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15515	NC_011004	CCG	2	6	5179113	5179118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15516	NC_011004	TCGGC	2	10	5179419	5179428	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15517	NC_011004	GC	3	6	5179461	5179466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15518	NC_011004	GAG	2	6	5179495	5179500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_011004	C	6	6	5180794	5180799	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15520	NC_011004	CGC	2	6	5180835	5180840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15521	NC_011004	GCG	2	6	5180867	5180872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15522	NC_011004	CCT	2	6	5182469	5182474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15523	NC_011004	CTC	2	6	5182498	5182503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15524	NC_011004	CGA	2	6	5182528	5182533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15525	NC_011004	G	6	6	5182571	5182576	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_011004	GC	3	6	5182607	5182612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15527	NC_011004	CGC	2	6	5182646	5182651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15528	NC_011004	TG	3	6	5182660	5182665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_011004	GCG	2	6	5182682	5182687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15530	NC_011004	GC	3	6	5182697	5182702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15531	NC_011004	GCT	2	6	5182711	5182716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15532	NC_011004	TC	3	6	5182724	5182729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15533	NC_011004	CGG	2	6	5183687	5183692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15534	NC_011004	CCT	2	6	5183695	5183700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15535	NC_011004	GC	3	6	5183718	5183723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15536	NC_011004	GTAT	2	8	5183758	5183765	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_011004	CGC	2	6	5183797	5183802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15538	NC_011004	GCG	2	6	5183806	5183811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15539	NC_011004	GA	3	6	5183829	5183834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_011004	CCCCCT	2	12	5183868	5183879	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
15541	NC_011004	CCA	2	6	5184898	5184903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15542	NC_011004	GCC	3	9	5184909	5184917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15543	NC_011004	GCA	3	9	5184952	5184960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15544	NC_011004	AGC	2	6	5184981	5184986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15545	NC_011004	CAGC	2	8	5185049	5185056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15546	NC_011004	CTT	3	9	5185064	5185072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15547	NC_011004	GCG	2	6	5185077	5185082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15548	NC_011004	CG	3	6	5185167	5185172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15549	NC_011004	TGC	2	6	5185306	5185311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15550	NC_011004	ATA	2	6	5185319	5185324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_011004	CGCC	2	8	5185342	5185349	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15552	NC_011004	GGC	3	9	5185406	5185414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15553	NC_011004	CGA	2	6	5185417	5185422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15554	NC_011004	CGC	2	6	5185521	5185526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15555	NC_011004	CG	3	6	5187042	5187047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15556	NC_011004	CGC	2	6	5187078	5187083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15557	NC_011004	CCG	2	6	5187122	5187127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15558	NC_011004	GAT	2	6	5187156	5187161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_011004	GCG	2	6	5187232	5187237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_011004	CAA	2	6	5187267	5187272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15561	NC_011004	GGCG	2	8	5187298	5187305	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15562	NC_011004	CGTG	2	8	5187319	5187326	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15563	NC_011004	CCG	2	6	5189488	5189493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15564	NC_011004	ACC	2	6	5189496	5189501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15565	NC_011004	GCG	2	6	5189503	5189508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15566	NC_011004	GCG	2	6	5189514	5189519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15567	NC_011004	ACA	2	6	5190607	5190612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15568	NC_011004	GCG	2	6	5190620	5190625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15569	NC_011004	C	6	6	5190639	5190644	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15570	NC_011004	GAC	2	6	5193769	5193774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15574	NC_011004	CCT	2	6	5194312	5194317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15581	NC_011004	GCC	3	9	5194482	5194490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15582	NC_011004	GAA	2	6	5194555	5194560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15585	NC_011004	CCA	2	6	5195288	5195293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15588	NC_011004	CCTT	2	8	5195811	5195818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15591	NC_011004	TCG	2	6	5195900	5195905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15595	NC_011004	GCG	2	6	5196000	5196005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15596	NC_011004	TCGT	2	8	5196024	5196031	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15597	NC_011004	AGCG	2	8	5196036	5196043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15598	NC_011004	GCT	2	6	5196045	5196050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15599	NC_011004	CGTG	2	8	5196060	5196067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15600	NC_011004	TTC	2	6	5197340	5197345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15605	NC_011004	CGG	2	6	5197468	5197473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15606	NC_011004	CG	3	6	5197513	5197518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15607	NC_011004	CAA	2	6	5197520	5197525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15608	NC_011004	GGC	2	6	5198005	5198010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15609	NC_011004	TC	3	6	5198023	5198028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15610	NC_011004	CGC	2	6	5198037	5198042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15611	NC_011004	GCC	2	6	5198090	5198095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15612	NC_011004	CGGG	2	8	5198129	5198136	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15613	NC_011004	CG	3	6	5198195	5198200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15621	NC_011004	GCG	2	6	5199042	5199047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15622	NC_011004	CG	3	6	5199071	5199076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15623	NC_011004	CA	3	6	5199087	5199092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15624	NC_011004	CGGC	2	8	5199563	5199570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15627	NC_011004	T	6	6	5199627	5199632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_011004	CGG	2	6	5199662	5199667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15629	NC_011004	TCG	2	6	5199869	5199874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15630	NC_011004	TGG	2	6	5200974	5200979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15631	NC_011004	CAT	2	6	5201020	5201025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15632	NC_011004	TTG	2	6	5201031	5201036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15633	NC_011004	ACC	2	6	5201043	5201048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15634	NC_011004	CG	3	6	5201438	5201443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15635	NC_011004	GT	3	6	5202595	5202600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15636	NC_011004	CATC	2	8	5202664	5202671	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15637	NC_011004	ATG	2	6	5202683	5202688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15638	NC_011004	GAT	2	6	5204258	5204263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15639	NC_011004	CGC	2	6	5204278	5204283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15640	NC_011004	GCAG	2	8	5204304	5204311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15641	NC_011004	CG	3	6	5204648	5204653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15642	NC_011004	CTTC	2	8	5204710	5204717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15643	NC_011004	GCC	2	6	5204721	5204726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15644	NC_011004	GAC	2	6	5204814	5204819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15645	NC_011004	CGTT	2	8	5207703	5207710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15646	NC_011004	GCC	2	6	5207723	5207728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15647	NC_011004	GCCCT	2	10	5207800	5207809	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15648	NC_011004	CGT	2	6	5207841	5207846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15650	NC_011004	CCGCG	2	10	5207857	5207866	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15651	NC_011004	TGC	2	6	5208495	5208500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15652	NC_011004	CTCG	2	8	5208581	5208588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15653	NC_011004	CGT	2	6	5209628	5209633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15655	NC_011004	GC	4	8	5209671	5209678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15656	NC_011004	CCG	2	6	5209704	5209709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15659	NC_011004	CG	3	6	5209786	5209791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15660	NC_011004	GGC	2	6	5210379	5210384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15661	NC_011004	GCG	2	6	5210396	5210401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15662	NC_011004	GCG	2	6	5210426	5210431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15663	NC_011004	CAT	2	6	5210583	5210588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15665	NC_011004	GC	3	6	5211636	5211641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15666	NC_011004	CGC	2	6	5211695	5211700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15667	NC_011004	TGGA	2	8	5211711	5211718	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15668	NC_011004	C	7	7	5212576	5212582	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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15671	NC_011004	CGC	2	6	5212703	5212708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15677	NC_011004	GCT	2	6	5214265	5214270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15687	NC_011004	GC	3	6	5215922	5215927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15694	NC_011004	GGGGT	2	10	5219107	5219116	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15695	NC_011004	CCACC	2	10	5219147	5219156	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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15700	NC_011004	CGG	2	6	5219662	5219667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15701	NC_011004	CTG	2	6	5219669	5219674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15702	NC_011004	CG	4	8	5219710	5219717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15703	NC_011004	GCG	2	6	5219750	5219755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15707	NC_011004	GCA	2	6	5222658	5222663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15710	NC_011004	CG	3	6	5222721	5222726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15711	NC_011004	CGGC	2	8	5222730	5222737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15715	NC_011004	ACG	2	6	5224078	5224083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15722	NC_011004	CATT	2	8	5227372	5227379	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15725	NC_011004	CTG	3	9	5229783	5229791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15743	NC_011004	ACGA	2	8	5234477	5234484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15744	NC_011004	CGG	2	6	5234512	5234517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15745	NC_011004	GC	3	6	5234559	5234564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15746	NC_011004	CG	3	6	5234973	5234978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15747	NC_011004	GCG	2	6	5235035	5235040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15749	NC_011004	GAG	2	6	5235073	5235078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15751	NC_011004	CTC	2	6	5239650	5239655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15753	NC_011004	CGA	2	6	5239679	5239684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15758	NC_011004	CGC	2	6	5242006	5242011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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