MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_011004	GAG	2	6	5038322	5038327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_011004	CCCG	2	8	5038328	5038335	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15003	NC_011004	TATC	2	8	5038346	5038353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15004	NC_011004	CG	3	6	5038468	5038473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15005	NC_011004	CTC	2	6	5038488	5038493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15006	NC_011004	AAT	2	6	5038496	5038501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_011004	CAT	2	6	5038506	5038511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15008	NC_011004	TTC	2	6	5038518	5038523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_011004	GCC	2	6	5038524	5038529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15010	NC_011004	AAG	2	6	5038530	5038535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_011004	CG	4	8	5039449	5039456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15012	NC_011004	GGCA	2	8	5039467	5039474	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15013	NC_011004	ATGC	2	8	5039482	5039489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15014	NC_011004	AGCCG	2	10	5039513	5039522	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15015	NC_011004	GCCG	2	8	5039579	5039586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15016	NC_011004	GCCG	2	8	5040496	5040503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15017	NC_011004	GAG	2	6	5040505	5040510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_011004	TTGC	2	8	5041028	5041035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15019	NC_011004	AG	3	6	5041044	5041049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_011004	GCG	2	6	5041064	5041069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_011004	CCT	2	6	5041369	5041374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15022	NC_011004	CGAG	2	8	5041436	5041443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15023	NC_011004	CAG	2	6	5043371	5043376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15024	NC_011004	TGA	2	6	5043400	5043405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_011004	TAGT	2	8	5043448	5043455	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_011004	ATC	2	6	5043475	5043480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_011004	GTA	2	6	5043540	5043545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_011004	CGG	2	6	5043868	5043873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15029	NC_011004	CCT	2	6	5043951	5043956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15030	NC_011004	CGC	2	6	5044017	5044022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15031	NC_011004	CGAC	2	8	5045719	5045726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15032	NC_011004	GTC	2	6	5045754	5045759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15033	NC_011004	GGA	2	6	5045803	5045808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_011004	GCG	2	6	5046691	5046696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15035	NC_011004	GCG	2	6	5047895	5047900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_011004	ACG	2	6	5048510	5048515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15037	NC_011004	GTT	2	6	5048525	5048530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_011004	GGC	2	6	5048561	5048566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15039	NC_011004	ACCGA	2	10	5048579	5048588	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15040	NC_011004	CG	3	6	5048598	5048603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15041	NC_011004	A	6	6	5048604	5048609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_011004	AAAC	2	8	5048617	5048624	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15043	NC_011004	AACGGC	2	12	5048651	5048662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15044	NC_011004	CGG	2	6	5049802	5049807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15045	NC_011004	CGC	2	6	5049858	5049863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15046	NC_011004	CGA	2	6	5049895	5049900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15047	NC_011004	CGG	2	6	5049907	5049912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15048	NC_011004	CGC	2	6	5049969	5049974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15049	NC_011004	GCC	2	6	5050065	5050070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15050	NC_011004	CAG	2	6	5050076	5050081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15051	NC_011004	CGG	2	6	5050083	5050088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15052	NC_011004	TTC	2	6	5050116	5050121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15054	NC_011004	CG	3	6	5050172	5050177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15055	NC_011004	GA	3	6	5050216	5050221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_011004	GA	3	6	5050225	5050230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_011004	CGC	2	6	5050435	5050440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15058	NC_011004	ATC	2	6	5050448	5050453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_011004	TTG	2	6	5050495	5050500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_011004	GGC	2	6	5051455	5051460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15061	NC_011004	GC	3	6	5051475	5051480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15062	NC_011004	TCAA	2	8	5051487	5051494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15063	NC_011004	GAG	2	6	5051516	5051521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_011004	CGA	2	6	5051527	5051532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15065	NC_011004	ATT	2	6	5055541	5055546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15075	NC_011004	GGC	2	6	5055802	5055807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15078	NC_011004	CCG	2	6	5058159	5058164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15079	NC_011004	GC	3	6	5058174	5058179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15081	NC_011004	GCAC	2	8	5058503	5058510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15082	NC_011004	T	6	6	5058517	5058522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15084	NC_011004	CCGG	2	8	5058595	5058602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15085	NC_011004	AC	3	6	5058818	5058823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15091	NC_011004	GCC	2	6	5060553	5060558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15095	NC_011004	CG	3	6	5062322	5062327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15096	NC_011004	C	6	6	5062435	5062440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15097	NC_011004	TG	3	6	5062471	5062476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_011004	TAAA	2	8	5062537	5062544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15101	NC_011004	CGT	2	6	5062571	5062576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15102	NC_011004	CGG	2	6	5063445	5063450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15104	NC_011004	CGG	2	6	5064385	5064390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15108	NC_011004	GAA	2	6	5066267	5066272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_011004	CGG	2	6	5066314	5066319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_011004	CGA	2	6	5066374	5066379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15111	NC_011004	GAG	2	6	5067100	5067105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_011004	AGC	2	6	5067106	5067111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15113	NC_011004	CGC	2	6	5067140	5067145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15115	NC_011004	CGG	2	6	5067210	5067215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15117	NC_011004	CGC	2	6	5067246	5067251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15118	NC_011004	GCA	3	9	5067259	5067267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15120	NC_011004	CGG	2	6	5067339	5067344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15122	NC_011004	CGGCT	2	10	5067406	5067415	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15123	NC_011004	GC	3	6	5067418	5067423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15127	NC_011004	ACCG	2	8	5067568	5067575	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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15129	NC_011004	GCG	2	6	5067604	5067609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15130	NC_011004	ATG	2	6	5067643	5067648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15252	NC_011004	CG	3	6	5121445	5121450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15253	NC_011004	CT	3	6	5121497	5121502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15254	NC_011004	GC	3	6	5121518	5121523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15255	NC_011004	GCG	2	6	5121570	5121575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15258	NC_011004	GC	3	6	5121638	5121643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15259	NC_011004	CGT	2	6	5121669	5121674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15261	NC_011004	GGA	2	6	5121737	5121742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15372	NC_011004	TGC	2	6	5140473	5140478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15378	NC_011004	AGCG	2	8	5141565	5141572	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15379	NC_011004	CG	3	6	5141643	5141648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15380	NC_011004	CAG	2	6	5141684	5141689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15382	NC_011004	CAC	2	6	5141703	5141708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15383	NC_011004	GC	3	6	5141726	5141731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15384	NC_011004	CCG	2	6	5141769	5141774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15385	NC_011004	TCGC	2	8	5141801	5141808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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15387	NC_011004	ATG	2	6	5141844	5141849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15388	NC_011004	GC	3	6	5141870	5141875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15389	NC_011004	GC	3	6	5141887	5141892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15390	NC_011004	TCG	2	6	5142426	5142431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15391	NC_011004	GGC	2	6	5142511	5142516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15392	NC_011004	CTG	2	6	5142520	5142525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15393	NC_011004	GC	3	6	5142546	5142551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15394	NC_011004	GCA	2	6	5144014	5144019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15395	NC_011004	CG	3	6	5144031	5144036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15396	NC_011004	CGC	2	6	5144049	5144054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15397	NC_011004	CATG	2	8	5144071	5144078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15398	NC_011004	GGC	2	6	5145069	5145074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15399	NC_011004	GC	3	6	5145073	5145078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15400	NC_011004	CGC	2	6	5145087	5145092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15401	NC_011004	GC	3	6	5145091	5145096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15402	NC_011004	GCGA	2	8	5145148	5145155	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15403	NC_011004	GCA	2	6	5145167	5145172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15417	NC_011004	GCC	2	6	5149236	5149241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15424	NC_011004	GC	3	6	5151239	5151244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15425	NC_011004	GAG	2	6	5152968	5152973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15431	NC_011004	C	6	6	5154971	5154976	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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15441	NC_011004	CG	3	6	5158199	5158204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15486	NC_011004	CAA	2	6	5168565	5168570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15487	NC_011004	AAC	2	6	5168577	5168582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15488	NC_011004	AAC	2	6	5168588	5168593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15489	NC_011004	GGA	2	6	5168595	5168600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15490	NC_011004	CTG	2	6	5169516	5169521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15497	NC_011004	CGC	2	6	5175257	5175262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15498	NC_011004	AC	3	6	5175320	5175325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15499	NC_011004	ACG	2	6	5175350	5175355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15500	NC_011004	GAT	2	6	5175357	5175362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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