MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_011004	TCCCCG	2	12	4893144	4893155	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14502	NC_011004	CTT	2	6	4893245	4893250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14503	NC_011004	ACA	2	6	4893322	4893327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14504	NC_011004	GCG	2	6	4893395	4893400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14505	NC_011004	GC	3	6	4893463	4893468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14506	NC_011004	TA	3	6	4893534	4893539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_011004	CTAG	2	8	4893542	4893549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14508	NC_011004	AGCG	2	8	4894282	4894289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14509	NC_011004	CAG	2	6	4895053	4895058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14510	NC_011004	CACT	2	8	4895060	4895067	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14511	NC_011004	TCGCT	2	10	4895087	4895096	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14512	NC_011004	CAT	2	6	4895128	4895133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14513	NC_011004	CGTC	2	8	4895142	4895149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14514	NC_011004	GC	4	8	4895158	4895165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14515	NC_011004	GACG	2	8	4895182	4895189	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14516	NC_011004	CCA	2	6	4895211	4895216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14517	NC_011004	CG	4	8	4895349	4895356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14518	NC_011004	TGG	2	6	4895390	4895395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_011004	CGC	2	6	4896934	4896939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14520	NC_011004	GGCTG	2	10	4896955	4896964	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14521	NC_011004	CCG	2	6	4898279	4898284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14522	NC_011004	CGG	2	6	4898290	4898295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14523	NC_011004	AGA	2	6	4898320	4898325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_011004	CCG	2	6	4899734	4899739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14525	NC_011004	ACG	2	6	4899748	4899753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_011004	CCA	2	6	4899797	4899802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14527	NC_011004	GGCG	2	8	4899839	4899846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14528	NC_011004	ACGGA	2	10	4899870	4899879	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14529	NC_011004	GCT	2	6	4901210	4901215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_011004	CGC	2	6	4901226	4901231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14531	NC_011004	CG	3	6	4901235	4901240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14532	NC_011004	TCCCC	2	10	4901244	4901253	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
14533	NC_011004	CCT	2	6	4901256	4901261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14534	NC_011004	GC	3	6	4901283	4901288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14535	NC_011004	GC	4	8	4901299	4901306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14536	NC_011004	GACC	2	8	4901324	4901331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14537	NC_011004	CAG	2	6	4901352	4901357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14538	NC_011004	CGT	2	6	4901387	4901392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14539	NC_011004	AAG	2	6	4901433	4901438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_011004	GGA	2	6	4901452	4901457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_011004	TGAGT	2	10	4902657	4902666	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_011004	GGT	2	6	4902725	4902730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_011004	GCG	2	6	4902754	4902759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14544	NC_011004	TTG	2	6	4902781	4902786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_011004	CGAT	2	8	4906095	4906102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14546	NC_011004	CGT	2	6	4906109	4906114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14547	NC_011004	ACA	2	6	4906196	4906201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14548	NC_011004	TCGC	2	8	4906219	4906226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14549	NC_011004	ACA	2	6	4906300	4906305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14550	NC_011004	AAGCG	2	10	4906313	4906322	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14551	NC_011004	ATC	2	6	4910849	4910854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14552	NC_011004	GC	4	8	4910944	4910951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14553	NC_011004	GC	3	6	4910978	4910983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14554	NC_011004	GC	3	6	4912253	4912258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14555	NC_011004	GAT	2	6	4912259	4912264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_011004	GGC	2	6	4912283	4912288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14557	NC_011004	CGA	2	6	4912307	4912312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14558	NC_011004	CGA	2	6	4912325	4912330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14559	NC_011004	CCG	2	6	4912347	4912352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14560	NC_011004	ATG	2	6	4912387	4912392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_011004	ATC	2	6	4912442	4912447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14562	NC_011004	GAC	2	6	4912487	4912492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14563	NC_011004	CGT	2	6	4912819	4912824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14564	NC_011004	TC	3	6	4912839	4912844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14565	NC_011004	GGC	2	6	4914329	4914334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14566	NC_011004	GCG	2	6	4914342	4914347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14567	NC_011004	CTG	2	6	4914368	4914373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14568	NC_011004	CGC	2	6	4914380	4914385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14569	NC_011004	CAC	2	6	4915318	4915323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14570	NC_011004	AGG	2	6	4915364	4915369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_011004	AAC	2	6	4915501	4915506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14572	NC_011004	GGA	2	6	4915530	4915535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_011004	AC	3	6	4916829	4916834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14574	NC_011004	GAC	2	6	4916869	4916874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14575	NC_011004	GGC	2	6	4916887	4916892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14576	NC_011004	G	6	6	4920668	4920673	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_011004	TTG	2	6	4923419	4923424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_011004	TC	3	6	4923529	4923534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14579	NC_011004	TCG	2	6	4923558	4923563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14580	NC_011004	GGT	2	6	4923564	4923569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_011004	AGCTA	2	10	4923571	4923580	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14582	NC_011004	GGC	2	6	4923615	4923620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14583	NC_011004	CAT	2	6	4926500	4926505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14584	NC_011004	GGAT	2	8	4926513	4926520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_011004	ACG	2	6	4926540	4926545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14586	NC_011004	AG	4	8	4927504	4927511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14587	NC_011004	GAT	2	6	4927524	4927529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_011004	AG	4	8	4927538	4927545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14589	NC_011004	GGA	2	6	4928677	4928682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_011004	CAGCG	2	10	4929986	4929995	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14591	NC_011004	ACAA	2	8	4930066	4930073	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14592	NC_011004	CGC	2	6	4930107	4930112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14593	NC_011004	ATC	2	6	4930127	4930132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14594	NC_011004	CGG	2	6	4930175	4930180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14595	NC_011004	CCA	2	6	4930200	4930205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14596	NC_011004	ACC	2	6	4930234	4930239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14597	NC_011004	GAC	2	6	4931084	4931089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14598	NC_011004	ACC	2	6	4931115	4931120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14599	NC_011004	CCG	3	9	4931207	4931215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14600	NC_011004	CG	4	8	4931226	4931233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14601	NC_011004	ACA	2	6	4931241	4931246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14602	NC_011004	T	6	6	4931264	4931269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_011004	GGA	2	6	4931306	4931311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_011004	GGGCG	2	10	4931314	4931323	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
14605	NC_011004	GAC	2	6	4931333	4931338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14606	NC_011004	T	6	6	4931376	4931381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_011004	TCG	2	6	4931466	4931471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14608	NC_011004	GAA	2	6	4931504	4931509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_011004	CAA	2	6	4931590	4931595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14610	NC_011004	GAC	2	6	4931777	4931782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14611	NC_011004	GCA	2	6	4931786	4931791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14612	NC_011004	AAG	2	6	4931802	4931807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_011004	TGA	2	6	4931990	4931995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_011004	AAG	2	6	4932064	4932069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_011004	TGG	2	6	4932090	4932095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_011004	GCA	2	6	4932140	4932145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14617	NC_011004	CGAG	2	8	4932157	4932164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14618	NC_011004	GAA	2	6	4932214	4932219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_011004	GGC	2	6	4932254	4932259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14620	NC_011004	CCCG	2	8	4933537	4933544	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14621	NC_011004	AGC	2	6	4933545	4933550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14622	NC_011004	CGG	2	6	4933553	4933558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14623	NC_011004	CCTG	2	8	4934719	4934726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14624	NC_011004	CCTCGC	2	12	4934729	4934740	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14625	NC_011004	CCG	2	6	4934776	4934781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14626	NC_011004	GGCC	2	8	4934795	4934802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14627	NC_011004	CG	3	6	4934824	4934829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14628	NC_011004	ATC	2	6	4936120	4936125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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