MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011004	GCC	2	6	4711420	4711425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14002	NC_011004	CCA	2	6	4711431	4711436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14003	NC_011004	GCG	2	6	4711469	4711474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_011004	GA	3	6	4711480	4711485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_011004	CG	3	6	4711559	4711564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14006	NC_011004	GC	3	6	4711617	4711622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14007	NC_011004	GCC	2	6	4711630	4711635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14008	NC_011004	AGC	2	6	4711854	4711859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_011004	CGC	2	6	4711860	4711865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14010	NC_011004	GCC	2	6	4711872	4711877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14011	NC_011004	T	6	6	4711957	4711962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_011004	GTGG	2	8	4711963	4711970	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_011004	CGT	2	6	4712018	4712023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_011004	TGA	2	6	4712042	4712047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_011004	CGC	2	6	4712055	4712060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14016	NC_011004	CG	4	8	4712102	4712109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14017	NC_011004	GC	3	6	4712111	4712116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14018	NC_011004	CGC	2	6	4712154	4712159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14019	NC_011004	GCC	2	6	4712615	4712620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14020	NC_011004	CGG	2	6	4712633	4712638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14021	NC_011004	CGG	2	6	4712698	4712703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_011004	GC	3	6	4713023	4713028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14023	NC_011004	CGC	2	6	4713036	4713041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14024	NC_011004	CGAA	2	8	4713772	4713779	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14025	NC_011004	TGAG	2	8	4713786	4713793	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_011004	TTCC	2	8	4713831	4713838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14027	NC_011004	CAT	2	6	4713842	4713847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_011004	A	6	6	4713861	4713866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_011004	ACC	2	6	4713881	4713886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14030	NC_011004	CGC	2	6	4713894	4713899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14031	NC_011004	GCC	2	6	4714374	4714379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14032	NC_011004	GGATG	2	10	4714424	4714433	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_011004	CGC	2	6	4714442	4714447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14034	NC_011004	GA	3	6	4714476	4714481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_011004	GCG	2	6	4714956	4714961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_011004	CCT	2	6	4716463	4716468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14037	NC_011004	GCCG	2	8	4716470	4716477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14038	NC_011004	GAA	2	6	4716549	4716554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_011004	GGT	2	6	4716613	4716618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_011004	GC	3	6	4716652	4716657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14041	NC_011004	CCT	2	6	4718514	4718519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14042	NC_011004	TGT	2	6	4718520	4718525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_011004	CA	3	6	4718543	4718548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14044	NC_011004	GCC	2	6	4719485	4719490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14045	NC_011004	GCGA	2	8	4719975	4719982	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14046	NC_011004	TCG	2	6	4720024	4720029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14047	NC_011004	CCT	2	6	4720036	4720041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14048	NC_011004	CGA	2	6	4720068	4720073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_011004	TTC	2	6	4720814	4720819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_011004	GGAC	2	8	4720838	4720845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14051	NC_011004	AC	3	6	4720844	4720849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14052	NC_011004	CCG	2	6	4720873	4720878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14053	NC_011004	CCGA	2	8	4720929	4720936	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14054	NC_011004	CCG	2	6	4720945	4720950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14055	NC_011004	CCG	2	6	4721605	4721610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14056	NC_011004	C	6	6	4721611	4721616	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14057	NC_011004	GTTGC	2	10	4721679	4721688	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14058	NC_011004	TCC	2	6	4723084	4723089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14059	NC_011004	TGCAC	2	10	4723117	4723126	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14060	NC_011004	GCAGA	2	10	4723151	4723160	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14061	NC_011004	GGC	2	6	4723211	4723216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_011004	TTGT	2	8	4723227	4723234	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_011004	GGC	2	6	4723258	4723263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_011004	AGCG	2	8	4723660	4723667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14065	NC_011004	GCTC	2	8	4723731	4723738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14066	NC_011004	GCC	2	6	4723785	4723790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14067	NC_011004	CGG	2	6	4725494	4725499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_011004	CTA	2	6	4726077	4726082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_011004	GGC	2	6	4726702	4726707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14070	NC_011004	TCCC	2	8	4726709	4726716	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14071	NC_011004	GC	3	6	4726775	4726780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14072	NC_011004	GCG	2	6	4726793	4726798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14073	NC_011004	ATC	2	6	4726801	4726806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14074	NC_011004	GCC	2	6	4726847	4726852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14075	NC_011004	ACC	2	6	4726853	4726858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14078	NC_011004	CG	3	6	4727161	4727166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14079	NC_011004	CCG	2	6	4727188	4727193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14080	NC_011004	GC	3	6	4727609	4727614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14081	NC_011004	CG	3	6	4727621	4727626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14082	NC_011004	GTG	2	6	4727643	4727648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_011004	CG	3	6	4727671	4727676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14084	NC_011004	CG	3	6	4727682	4727687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14085	NC_011004	AG	3	6	4727705	4727710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14087	NC_011004	A	6	6	4728507	4728512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14093	NC_011004	GCG	2	6	4732622	4732627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14095	NC_011004	CTC	2	6	4732642	4732647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14098	NC_011004	GC	3	6	4734556	4734561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14099	NC_011004	CG	3	6	4734585	4734590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14100	NC_011004	GCG	2	6	4734593	4734598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_011004	CGG	2	6	4734600	4734605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14102	NC_011004	GCG	2	6	4734620	4734625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_011004	GA	3	6	4734907	4734912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_011004	TGC	2	6	4734931	4734936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14106	NC_011004	CGA	2	6	4734976	4734981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_011004	GCTT	2	8	4735014	4735021	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14108	NC_011004	TCGC	2	8	4735026	4735033	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14109	NC_011004	GCC	2	6	4735060	4735065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14110	NC_011004	TGA	2	6	4735396	4735401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_011004	GCC	2	6	4736264	4736269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14112	NC_011004	GCC	2	6	4736284	4736289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14113	NC_011004	CCG	2	6	4736298	4736303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14114	NC_011004	GCC	2	6	4736318	4736323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14115	NC_011004	GCG	2	6	4736381	4736386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_011004	TGG	2	6	4736421	4736426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14120	NC_011004	GCC	2	6	4736486	4736491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14121	NC_011004	GTT	2	6	4736561	4736566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14125	NC_011004	GAAG	2	8	4738660	4738667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14130	NC_011004	CAA	2	6	4742457	4742462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14131	NC_011004	CGGCG	2	10	4742489	4742498	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14132	NC_011004	GC	3	6	4742502	4742507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14133	NC_011004	GGT	2	6	4742549	4742554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_011004	TCG	2	6	4742562	4742567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14135	NC_011004	CTCGG	2	10	4742588	4742597	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14136	NC_011004	TGCCC	2	10	4742715	4742724	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14137	NC_011004	ACG	2	6	4742759	4742764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14141	NC_011004	TGG	2	6	4745502	4745507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14146	NC_011004	CGG	2	6	4748610	4748615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14148	NC_011004	CAA	2	6	4748650	4748655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14151	NC_011004	CG	3	6	4748756	4748761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14152	NC_011004	GGC	2	6	4748814	4748819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14156	NC_011004	CTT	2	6	4752318	4752323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14159	NC_011004	GCC	2	6	4756787	4756792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14160	NC_011004	TGGT	2	8	4756806	4756813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14163	NC_011004	CGC	2	6	4756885	4756890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14164	NC_011004	CG	3	6	4757471	4757476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14165	NC_011004	CGC	2	6	4757485	4757490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14166	NC_011004	CCG	2	6	4757597	4757602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14168	NC_011004	CG	4	8	4757948	4757955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14172	NC_011004	GACA	2	8	4758523	4758530	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14173	NC_011004	CGG	2	6	4758558	4758563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14175	NC_011004	CGC	2	6	4759026	4759031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14197	NC_011004	ACCT	2	8	4765736	4765743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14201	NC_011004	CGCT	2	8	4765927	4765934	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14202	NC_011004	GGGCC	2	10	4765955	4765964	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14203	NC_011004	ATT	2	6	4765979	4765984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14243	NC_011004	CCG	2	6	4796708	4796713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14250	NC_011004	TTG	2	6	4800649	4800654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14253	NC_011004	GCTT	2	8	4801364	4801371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14259	NC_011004	GGC	2	6	4801552	4801557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14260	NC_011004	GCC	2	6	4801570	4801575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14261	NC_011004	CCG	2	6	4801576	4801581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14262	NC_011004	GGA	2	6	4801582	4801587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14263	NC_011004	GCG	2	6	4802734	4802739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14264	NC_011004	GTG	2	6	4802768	4802773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14265	NC_011004	TTG	2	6	4804853	4804858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14271	NC_011004	CGG	2	6	4808386	4808391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14278	NC_011004	TCTT	2	8	4812929	4812936	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14282	NC_011004	GC	3	6	4813025	4813030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14283	NC_011004	CGGTC	2	10	4814126	4814135	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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14285	NC_011004	GCG	2	6	4814710	4814715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14289	NC_011004	GCC	2	6	4814780	4814785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14290	NC_011004	AAAC	2	8	4814814	4814821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14291	NC_011004	GA	3	6	4814828	4814833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14292	NC_011004	CG	3	6	4814850	4814855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14293	NC_011004	TCG	2	6	4815210	4815215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14295	NC_011004	GTG	2	6	4815857	4815862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14299	NC_011004	C	6	6	4822265	4822270	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14300	NC_011004	GGCC	2	8	4822309	4822316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14342	NC_011004	GC	3	6	4841003	4841008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14343	NC_011004	CGG	2	6	4841072	4841077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14355	NC_011004	TC	3	6	4848861	4848866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14358	NC_011004	GGCA	2	8	4855405	4855412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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14370	NC_011004	CGGGCG	2	12	4862817	4862828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14373	NC_011004	ATTC	2	8	4862967	4862974	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14374	NC_011004	TCCG	2	8	4862992	4862999	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14375	NC_011004	CGG	3	9	4870175	4870183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14381	NC_011004	CGG	2	6	4870266	4870271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14382	NC_011004	C	6	6	4870351	4870356	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14383	NC_011004	GAGC	2	8	4870433	4870440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14384	NC_011004	CCG	2	6	4870906	4870911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14385	NC_011004	CAA	2	6	4870936	4870941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14386	NC_011004	TC	3	6	4871656	4871661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14388	NC_011004	CG	4	8	4877095	4877102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14389	NC_011004	CGG	2	6	4877173	4877178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14390	NC_011004	CCG	2	6	4877206	4877211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14393	NC_011004	TGG	2	6	4879503	4879508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14423	NC_011004	CGG	2	6	4882301	4882306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14424	NC_011004	CG	3	6	4882348	4882353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14425	NC_011004	CTG	2	6	4882388	4882393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14497	NC_011004	GA	3	6	4892792	4892797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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