MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011004	CG	3	6	4535719	4535724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13502	NC_011004	ACGA	2	8	4535735	4535742	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13503	NC_011004	TTC	2	6	4537291	4537296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_011004	GAT	2	6	4537302	4537307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_011004	CCCAC	2	10	4537323	4537332	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
13506	NC_011004	CGG	2	6	4537408	4537413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_011004	CAAT	2	8	4537418	4537425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13508	NC_011004	TGC	2	6	4537457	4537462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13509	NC_011004	CCG	2	6	4537482	4537487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13510	NC_011004	GCT	2	6	4539699	4539704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_011004	TGC	2	6	4539726	4539731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13512	NC_011004	GAG	2	6	4539761	4539766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_011004	TGT	2	6	4539856	4539861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_011004	CGC	2	6	4539911	4539916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13515	NC_011004	T	7	7	4539954	4539960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_011004	GCAA	2	8	4540038	4540045	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13517	NC_011004	CTC	2	6	4540488	4540493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13518	NC_011004	GCG	2	6	4540503	4540508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_011004	GGC	2	6	4540512	4540517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_011004	GC	4	8	4543943	4543950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13521	NC_011004	CG	3	6	4543955	4543960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13522	NC_011004	CAAG	2	8	4543985	4543992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13523	NC_011004	AG	3	6	4543991	4543996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_011004	GAC	2	6	4544033	4544038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_011004	GC	3	6	4544196	4544201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13526	NC_011004	C	6	6	4544201	4544206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13527	NC_011004	T	6	6	4545018	4545023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_011004	GTC	2	6	4545027	4545032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13529	NC_011004	TTG	2	6	4545079	4545084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_011004	CCCG	2	8	4545193	4545200	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13531	NC_011004	CCG	2	6	4545214	4545219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13532	NC_011004	GAC	2	6	4545220	4545225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13533	NC_011004	CG	4	8	4545233	4545240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13534	NC_011004	GCG	2	6	4545262	4545267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_011004	GC	3	6	4546452	4546457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13536	NC_011004	CAG	2	6	4546514	4546519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_011004	GCTC	2	8	4546536	4546543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13538	NC_011004	GCG	2	6	4546569	4546574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13539	NC_011004	TCC	2	6	4547775	4547780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13540	NC_011004	GTC	2	6	4547809	4547814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_011004	GGGGT	2	10	4547860	4547869	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_011004	CCCG	2	8	4547920	4547927	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13543	NC_011004	CG	4	8	4547949	4547956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13544	NC_011004	CCG	2	6	4547976	4547981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13545	NC_011004	CTCCC	2	10	4550933	4550942	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
13546	NC_011004	GGGGT	2	10	4550961	4550970	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_011004	GGGAGA	2	12	4551021	4551032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_011004	GTTT	2	8	4553168	4553175	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_011004	AATT	2	8	4553187	4553194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_011004	ACG	2	6	4553240	4553245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13551	NC_011004	GCC	2	6	4557675	4557680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13552	NC_011004	CG	3	6	4557720	4557725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13553	NC_011004	GC	3	6	4557749	4557754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13554	NC_011004	CGATC	2	10	4557774	4557783	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13555	NC_011004	CCG	2	6	4559034	4559039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13556	NC_011004	GGC	2	6	4559081	4559086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_011004	CTG	2	6	4559087	4559092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13558	NC_011004	TGC	2	6	4559120	4559125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13559	NC_011004	CA	3	6	4559168	4559173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13560	NC_011004	AGA	2	6	4559174	4559179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_011004	CGG	2	6	4560526	4560531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13562	NC_011004	GCC	2	6	4560536	4560541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13563	NC_011004	TCGCA	2	10	4560639	4560648	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13564	NC_011004	CGA	2	6	4560677	4560682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13565	NC_011004	TCG	2	6	4560717	4560722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13566	NC_011004	CCA	2	6	4560728	4560733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13567	NC_011004	ACA	2	6	4560750	4560755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13568	NC_011004	CA	3	6	4560758	4560763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13569	NC_011004	CAA	3	9	4562041	4562049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13570	NC_011004	TCG	2	6	4562080	4562085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13571	NC_011004	CCG	2	6	4562093	4562098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13572	NC_011004	CGA	2	6	4562701	4562706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13573	NC_011004	TCGC	2	8	4562720	4562727	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13574	NC_011004	ATC	2	6	4562752	4562757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13575	NC_011004	TTCG	2	8	4562773	4562780	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13576	NC_011004	CGC	2	6	4562828	4562833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13577	NC_011004	TGC	2	6	4562857	4562862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13578	NC_011004	CCG	2	6	4563946	4563951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13579	NC_011004	GCC	2	6	4563963	4563968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13580	NC_011004	CGG	2	6	4564012	4564017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13581	NC_011004	CCG	2	6	4564065	4564070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13582	NC_011004	GCA	2	6	4564089	4564094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13583	NC_011004	GC	3	6	4566282	4566287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13584	NC_011004	TCG	2	6	4566337	4566342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13585	NC_011004	CTC	2	6	4566348	4566353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13587	NC_011004	TTG	2	6	4571643	4571648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_011004	CCG	2	6	4571652	4571657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13589	NC_011004	CTTT	2	8	4571693	4571700	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13590	NC_011004	CGG	2	6	4571791	4571796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13591	NC_011004	G	7	7	4571795	4571801	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_011004	CTTG	2	8	4571838	4571845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13593	NC_011004	CCCG	2	8	4571912	4571919	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13594	NC_011004	GCG	2	6	4571947	4571952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13596	NC_011004	CCG	2	6	4574609	4574614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13597	NC_011004	TCGA	2	8	4574624	4574631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13598	NC_011004	GT	3	6	4574694	4574699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_011004	TGC	2	6	4574751	4574756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_011004	TTGCGG	2	12	4574784	4574795	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13601	NC_011004	TGC	2	6	4574837	4574842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13602	NC_011004	GTG	2	6	4574866	4574871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_011004	AGA	2	6	4575847	4575852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_011004	T	6	6	4577071	4577076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_011004	CT	3	6	4578110	4578115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13606	NC_011004	ATC	2	6	4579382	4579387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13607	NC_011004	CGC	2	6	4579399	4579404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13608	NC_011004	GGC	2	6	4579412	4579417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13609	NC_011004	ATCG	2	8	4579453	4579460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13610	NC_011004	GTC	2	6	4579519	4579524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13611	NC_011004	CGC	2	6	4580487	4580492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13612	NC_011004	GGC	2	6	4580500	4580505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13613	NC_011004	CTG	2	6	4583224	4583229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13614	NC_011004	A	7	7	4586254	4586260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_011004	GGCCG	2	10	4586277	4586286	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13616	NC_011004	GACG	2	8	4586342	4586349	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13617	NC_011004	CGC	3	9	4586377	4586385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13618	NC_011004	CGG	2	6	4586413	4586418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13619	NC_011004	CGC	2	6	4586420	4586425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13620	NC_011004	CTTC	2	8	4586670	4586677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13621	NC_011004	GCC	2	6	4586724	4586729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13622	NC_011004	ATG	2	6	4586767	4586772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_011004	ACGC	2	8	4586811	4586818	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13624	NC_011004	CGGG	2	8	4586826	4586833	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13625	NC_011004	AGC	2	6	4586909	4586914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13626	NC_011004	GCGG	2	8	4586915	4586922	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13627	NC_011004	GCG	2	6	4586956	4586961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13628	NC_011004	AC	3	6	4586994	4586999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13629	NC_011004	CAC	2	6	4587026	4587031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13632	NC_011004	CAC	2	6	4590129	4590134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13633	NC_011004	GACC	2	8	4590148	4590155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13634	NC_011004	CCA	2	6	4590187	4590192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13642	NC_011004	GACG	2	8	4596639	4596646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13643	NC_011004	GCT	2	6	4603493	4603498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13669	NC_011004	TCGC	2	8	4610574	4610581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13690	NC_011004	TCC	2	6	4617315	4617320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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