MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011004	GCG	2	6	4192836	4192841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_011004	CG	3	6	4192840	4192845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12503	NC_011004	TCAGG	2	10	4192852	4192861	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12504	NC_011004	AGC	3	9	4192924	4192932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_011004	CTTC	2	8	4192934	4192941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12506	NC_011004	CCA	2	6	4192944	4192949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12507	NC_011004	ATG	2	6	4193021	4193026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_011004	CGA	2	6	4193046	4193051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_011004	CGC	2	6	4193207	4193212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12510	NC_011004	CG	3	6	4193219	4193224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12511	NC_011004	CCT	2	6	4193264	4193269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12512	NC_011004	TGA	2	6	4193276	4193281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_011004	AGC	2	6	4193308	4193313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_011004	TGC	2	6	4193325	4193330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_011004	CAC	2	6	4193381	4193386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12516	NC_011004	GAC	2	6	4193489	4193494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_011004	GCC	2	6	4193530	4193535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12518	NC_011004	GAGG	2	8	4193538	4193545	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_011004	TGG	2	6	4194406	4194411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_011004	CGG	2	6	4194440	4194445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_011004	CGT	2	6	4194477	4194482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_011004	GAG	2	6	4194507	4194512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_011004	TTCG	2	8	4194618	4194625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12524	NC_011004	CGAT	2	8	4194637	4194644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12525	NC_011004	GAC	2	6	4194662	4194667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_011004	CGA	2	6	4194923	4194928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_011004	AGCC	2	8	4194942	4194949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12528	NC_011004	GAA	2	6	4195004	4195009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_011004	CGA	2	6	4195079	4195084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_011004	GATT	2	8	4195094	4195101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_011004	CAA	2	6	4195106	4195111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_011004	TTCA	2	8	4195211	4195218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12533	NC_011004	GGC	3	9	4195350	4195358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_011004	TGGA	2	8	4195363	4195370	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_011004	GCC	2	6	4195376	4195381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12536	NC_011004	TCT	2	6	4195405	4195410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_011004	GCT	2	6	4195413	4195418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_011004	CCT	2	6	4195423	4195428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12539	NC_011004	AGCA	2	8	4195438	4195445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12540	NC_011004	GAT	2	6	4195452	4195457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_011004	GGA	2	6	4195496	4195501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_011004	CGC	2	6	4195510	4195515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_011004	GCTG	2	8	4195583	4195590	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12544	NC_011004	TTGTT	2	10	4195601	4195610	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_011004	CTG	2	6	4195625	4195630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_011004	TGC	2	6	4195639	4195644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12547	NC_011004	GCCG	2	8	4195668	4195675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12548	NC_011004	CGC	4	12	4195749	4195760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12549	NC_011004	ACG	2	6	4195791	4195796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12550	NC_011004	AAGCT	2	10	4195827	4195836	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12551	NC_011004	AC	3	6	4195855	4195860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12552	NC_011004	CCG	2	6	4195878	4195883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12553	NC_011004	GCA	2	6	4195908	4195913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_011004	CCCG	2	8	4196064	4196071	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12555	NC_011004	GGCA	2	8	4196084	4196091	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12556	NC_011004	TGCT	2	8	4196181	4196188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12557	NC_011004	C	7	7	4196198	4196204	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12558	NC_011004	ATC	2	6	4196858	4196863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_011004	TTTG	2	8	4196879	4196886	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_011004	CGGA	2	8	4196893	4196900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12561	NC_011004	GCA	2	6	4197081	4197086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12562	NC_011004	GTT	2	6	4197177	4197182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_011004	G	6	6	4197231	4197236	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_011004	GTC	2	6	4197247	4197252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_011004	CGGG	2	8	4197299	4197306	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12566	NC_011004	CCG	2	6	4198916	4198921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12567	NC_011004	T	7	7	4198932	4198938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_011004	TCA	2	6	4198987	4198992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12569	NC_011004	CGC	2	6	4199026	4199031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12570	NC_011004	CGA	2	6	4199112	4199117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12571	NC_011004	CGAT	2	8	4199148	4199155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12572	NC_011004	GCGAC	2	10	4199157	4199166	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12573	NC_011004	TGA	2	6	4199177	4199182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_011004	CTG	2	6	4199196	4199201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_011004	AGCGC	2	10	4199247	4199256	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12576	NC_011004	GAG	2	6	4199278	4199283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_011004	GCG	2	6	4199478	4199483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12578	NC_011004	CGC	3	9	4199485	4199493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12579	NC_011004	GCA	2	6	4200064	4200069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12580	NC_011004	GCG	2	6	4200070	4200075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12581	NC_011004	CGA	2	6	4200468	4200473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12582	NC_011004	GCC	2	6	4200476	4200481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12583	NC_011004	A	6	6	4200493	4200498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_011004	GAA	3	9	4200512	4200520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_011004	TGGC	2	8	4201580	4201587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12586	NC_011004	TCG	2	6	4201609	4201614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12587	NC_011004	CG	3	6	4201613	4201618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12588	NC_011004	TCG	2	6	4201675	4201680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12589	NC_011004	CT	3	6	4202556	4202561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12590	NC_011004	AGCC	2	8	4202662	4202669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12591	NC_011004	CG	3	6	4202697	4202702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12592	NC_011004	GGC	2	6	4202723	4202728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12593	NC_011004	CGT	2	6	4203535	4203540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_011004	ATA	2	6	4203543	4203548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_011004	GGGC	2	8	4203585	4203592	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12596	NC_011004	CGTCG	2	10	4203612	4203621	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12597	NC_011004	ACGA	2	8	4203622	4203629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12598	NC_011004	TCA	2	6	4204879	4204884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12599	NC_011004	AGG	2	6	4204909	4204914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_011004	CAC	2	6	4204925	4204930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12601	NC_011004	GC	3	6	4206539	4206544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12602	NC_011004	TG	3	6	4206963	4206968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_011004	TGA	2	6	4207001	4207006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_011004	CGG	2	6	4207019	4207024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12605	NC_011004	GTTT	2	8	4207044	4207051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_011004	CG	3	6	4207546	4207551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12607	NC_011004	CCG	2	6	4207554	4207559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12608	NC_011004	CTTGC	2	10	4207567	4207576	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12609	NC_011004	CGC	2	6	4207604	4207609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12610	NC_011004	ATCG	2	8	4207613	4207620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12611	NC_011004	GAGC	2	8	4207632	4207639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12612	NC_011004	TTGA	2	8	4208536	4208543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_011004	CTT	2	6	4214237	4214242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12614	NC_011004	CTA	2	6	4214247	4214252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12615	NC_011004	GCA	2	6	4214332	4214337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12616	NC_011004	TCT	2	6	4214487	4214492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12617	NC_011004	GCGG	2	8	4214524	4214531	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12618	NC_011004	GCC	2	6	4214624	4214629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12619	NC_011004	GGC	2	6	4214637	4214642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12620	NC_011004	GCG	2	6	4214644	4214649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12621	NC_011004	CGG	2	6	4214664	4214669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12622	NC_011004	GCG	2	6	4214721	4214726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12623	NC_011004	GCG	2	6	4214752	4214757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12624	NC_011004	CG	3	6	4214769	4214774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12625	NC_011004	GCG	2	6	4214820	4214825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12626	NC_011004	GCG	2	6	4214832	4214837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12627	NC_011004	TC	4	8	4214839	4214846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12628	NC_011004	GCCGAT	2	12	4214849	4214860	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12629	NC_011004	CTC	2	6	4214876	4214881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12630	NC_011004	TGCCC	2	10	4214882	4214891	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12631	NC_011004	TGCA	2	8	4214909	4214916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12632	NC_011004	GCC	2	6	4214918	4214923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12633	NC_011004	GTC	2	6	4217570	4217575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12634	NC_011004	CATC	2	8	4217610	4217617	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12635	NC_011004	GATG	2	8	4217629	4217636	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12636	NC_011004	CGT	2	6	4217659	4217664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12637	NC_011004	ACAA	2	8	4217665	4217672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12638	NC_011004	GGA	2	6	4217682	4217687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12639	NC_011004	CCT	2	6	4218605	4218610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12640	NC_011004	GC	3	6	4218631	4218636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12641	NC_011004	CG	3	6	4218651	4218656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12642	NC_011004	GCA	2	6	4218701	4218706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12644	NC_011004	CGC	2	6	4218866	4218871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12653	NC_011004	CGC	2	6	4219130	4219135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12661	NC_011004	CGT	2	6	4219340	4219345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12668	NC_011004	CCAT	2	8	4223053	4223060	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12669	NC_011004	GATG	2	8	4223076	4223083	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12670	NC_011004	TCC	2	6	4224041	4224046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12686	NC_011004	CCG	2	6	4230994	4230999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12743	NC_011004	CG	3	6	4256211	4256216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12749	NC_011004	C	6	6	4261813	4261818	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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12757	NC_011004	CG	3	6	4262346	4262351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12758	NC_011004	GCA	2	6	4262352	4262357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12759	NC_011004	CGT	2	6	4262379	4262384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12760	NC_011004	GC	3	6	4262399	4262404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12761	NC_011004	GGC	2	6	4262564	4262569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12763	NC_011004	CG	3	6	4262611	4262616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12764	NC_011004	CCG	2	6	4262644	4262649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12765	NC_011004	ATCGG	2	10	4262657	4262666	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12766	NC_011004	CGT	2	6	4267779	4267784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12772	NC_011004	CGC	2	6	4267936	4267941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12779	NC_011004	CAA	2	6	4268222	4268227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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