MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011004	ACC	2	6	3948562	3948567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11502	NC_011004	CACC	2	8	3948574	3948581	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11503	NC_011004	TGCC	2	8	3948648	3948655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11504	NC_011004	CCGGCT	2	12	3948664	3948675	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11505	NC_011004	CGC	2	6	3948726	3948731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11506	NC_011004	GC	3	6	3948995	3949000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11507	NC_011004	GC	3	6	3949005	3949010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11508	NC_011004	CCCT	2	8	3949109	3949116	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11509	NC_011004	CGG	2	6	3949126	3949131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_011004	GTGA	2	8	3949138	3949145	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_011004	TCG	2	6	3949242	3949247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_011004	AGC	2	6	3949248	3949253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_011004	ATG	2	6	3949326	3949331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_011004	GAC	2	6	3949338	3949343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_011004	GTTGG	2	10	3949412	3949421	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_011004	TGTT	2	8	3950389	3950396	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_011004	CAAA	2	8	3950410	3950417	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11518	NC_011004	ATC	3	9	3950453	3950461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_011004	CGG	2	6	3951628	3951633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_011004	GTG	2	6	3951645	3951650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_011004	CAGAG	2	10	3951699	3951708	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11522	NC_011004	CATC	2	8	3951752	3951759	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11523	NC_011004	GAA	2	6	3951779	3951784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_011004	AACCC	2	10	3952617	3952626	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
11525	NC_011004	C	6	6	3952774	3952779	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11526	NC_011004	CGT	2	6	3952855	3952860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_011004	CTC	2	6	3955834	3955839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11528	NC_011004	ACC	2	6	3955856	3955861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11529	NC_011004	TCG	2	6	3959505	3959510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_011004	CTG	2	6	3959530	3959535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_011004	CGG	2	6	3959545	3959550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_011004	CGAA	2	8	3961205	3961212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11533	NC_011004	C	6	6	3961230	3961235	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11534	NC_011004	CCA	2	6	3961251	3961256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11535	NC_011004	AGC	2	6	3961265	3961270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_011004	CGC	2	6	3961281	3961286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11537	NC_011004	CGG	2	6	3961362	3961367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_011004	GCC	2	6	3961377	3961382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11539	NC_011004	CCG	2	6	3961391	3961396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11540	NC_011004	GC	3	6	3961405	3961410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11541	NC_011004	CGC	2	6	3961415	3961420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11542	NC_011004	GCCG	2	8	3961442	3961449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11543	NC_011004	GCG	2	6	3961487	3961492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_011004	GCC	2	6	3961501	3961506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11545	NC_011004	TGA	2	6	3961518	3961523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11547	NC_011004	CTG	2	6	3961678	3961683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_011004	TCGA	2	8	3962044	3962051	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11549	NC_011004	GGC	2	6	3963279	3963284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_011004	CAA	2	6	3963405	3963410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_011004	TC	3	6	3964663	3964668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11552	NC_011004	TCT	2	6	3964712	3964717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_011004	CG	3	6	3964752	3964757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11554	NC_011004	TC	4	8	3965578	3965585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11555	NC_011004	ATT	2	6	3965594	3965599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_011004	GTGA	2	8	3965600	3965607	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_011004	TCG	2	6	3965707	3965712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_011004	CTC	2	6	3965718	3965723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11559	NC_011004	TTCG	2	8	3965740	3965747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11560	NC_011004	ATG	2	6	3965750	3965755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_011004	TG	3	6	3966583	3966588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_011004	CG	3	6	3966594	3966599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11563	NC_011004	TCGA	2	8	3966603	3966610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11564	NC_011004	TCG	2	6	3966615	3966620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_011004	CAG	2	6	3966656	3966661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_011004	GC	3	6	3967477	3967482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11567	NC_011004	CG	3	6	3967489	3967494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11568	NC_011004	ACG	2	6	3967561	3967566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11574	NC_011004	CG	3	6	3969849	3969854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11575	NC_011004	CGCGC	2	10	3969858	3969867	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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11579	NC_011004	ACG	2	6	3971346	3971351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11585	NC_011004	GCG	2	6	3973889	3973894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11594	NC_011004	CG	3	6	3974475	3974480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11595	NC_011004	CCGG	2	8	3974493	3974500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11599	NC_011004	CGGC	2	8	3974586	3974593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11600	NC_011004	GC	3	6	3978399	3978404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11601	NC_011004	CGAC	2	8	3978424	3978431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11602	NC_011004	CCGG	2	8	3978433	3978440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11603	NC_011004	ATT	2	6	3978502	3978507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11606	NC_011004	TC	3	6	3979968	3979973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11607	NC_011004	TCT	2	6	3979992	3979997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_011004	GTCGC	2	10	3980010	3980019	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11609	NC_011004	GC	3	6	3980024	3980029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11610	NC_011004	GCT	2	6	3980044	3980049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11612	NC_011004	CTG	2	6	3980246	3980251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11619	NC_011004	GC	4	8	3981845	3981852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11621	NC_011004	CG	3	6	3981918	3981923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11627	NC_011004	CAG	2	6	3984274	3984279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11629	NC_011004	TAA	2	6	3984301	3984306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11639	NC_011004	GTC	2	6	3991501	3991506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11643	NC_011004	CGG	2	6	3992781	3992786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11644	NC_011004	CCG	2	6	3992793	3992798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11645	NC_011004	TGT	2	6	3992807	3992812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11740	NC_011004	TATT	2	8	4015177	4015184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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