MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011004	GCA	2	6	3410981	3410986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_011004	GCG	2	6	3411025	3411030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_011004	GTTC	2	8	3411076	3411083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10004	NC_011004	TCGTT	2	10	3411111	3411120	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10005	NC_011004	AAG	2	6	3411127	3411132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_011004	GCCCG	2	10	3411134	3411143	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10007	NC_011004	ATC	2	6	3411168	3411173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_011004	GAC	2	6	3411190	3411195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_011004	GCC	2	6	3412126	3412131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_011004	CGG	2	6	3412148	3412153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_011004	CGG	2	6	3412276	3412281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_011004	CGT	2	6	3412311	3412316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_011004	GAG	2	6	3412380	3412385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_011004	TCC	2	6	3412399	3412404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10015	NC_011004	TTCC	2	8	3412459	3412466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_011004	GCA	2	6	3412498	3412503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_011004	GCT	2	6	3412509	3412514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_011004	TTC	2	6	3412556	3412561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_011004	GAA	2	6	3412563	3412568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_011004	CGCC	2	8	3412782	3412789	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10021	NC_011004	GGCG	2	8	3412794	3412801	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10022	NC_011004	CGGTC	2	10	3414341	3414350	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10023	NC_011004	TCG	2	6	3415617	3415622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_011004	GCG	2	6	3415637	3415642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_011004	C	6	6	3415644	3415649	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10026	NC_011004	TGG	2	6	3415694	3415699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_011004	GGCC	2	8	3415724	3415731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10028	NC_011004	CGG	2	6	3415740	3415745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_011004	CT	3	6	3416889	3416894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10030	NC_011004	CCGGC	2	10	3419021	3419030	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10031	NC_011004	G	6	6	3419047	3419052	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_011004	CG	3	6	3419061	3419066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10033	NC_011004	CCG	2	6	3419075	3419080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_011004	ATT	2	6	3420202	3420207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_011004	CA	3	6	3420290	3420295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10036	NC_011004	GGC	2	6	3420296	3420301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_011004	GGTCG	2	10	3422048	3422057	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10038	NC_011004	GCCG	2	8	3422080	3422087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10039	NC_011004	CGC	2	6	3422911	3422916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10040	NC_011004	CGG	2	6	3422917	3422922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_011004	GC	3	6	3423004	3423009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_011004	CAAA	2	8	3424649	3424656	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_011004	CGGGC	2	10	3424671	3424680	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10044	NC_011004	TCT	2	6	3424684	3424689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_011004	ACTC	2	8	3426136	3426143	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10046	NC_011004	TTG	2	6	3426217	3426222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_011004	CAG	2	6	3426965	3426970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_011004	CGG	2	6	3427091	3427096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_011004	A	6	6	3428057	3428062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_011004	CGC	2	6	3428135	3428140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10051	NC_011004	CGC	2	6	3428176	3428181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_011004	CT	3	6	3429030	3429035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10053	NC_011004	TCTT	2	8	3429041	3429048	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10054	NC_011004	CGT	2	6	3429054	3429059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_011004	CCGGC	2	10	3429065	3429074	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10056	NC_011004	CGGC	2	8	3429110	3429117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10057	NC_011004	C	6	6	3429119	3429124	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10058	NC_011004	GC	3	6	3429147	3429152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_011004	GC	3	6	3429164	3429169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10060	NC_011004	GCC	2	6	3429215	3429220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_011004	GATC	2	8	3429361	3429368	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10062	NC_011004	AGCG	2	8	3429398	3429405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10063	NC_011004	CCG	2	6	3429436	3429441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_011004	CTG	2	6	3429443	3429448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_011004	TGC	2	6	3429490	3429495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_011004	AGCG	2	8	3429548	3429555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10067	NC_011004	CG	3	6	3429580	3429585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10068	NC_011004	TCGA	2	8	3429723	3429730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10069	NC_011004	GGT	2	6	3429737	3429742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_011004	C	6	6	3429760	3429765	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10071	NC_011004	GTG	2	6	3429777	3429782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_011004	ACG	2	6	3429799	3429804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_011004	CAG	2	6	3429848	3429853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_011004	GC	3	6	3429858	3429863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10075	NC_011004	TGG	3	9	3429889	3429897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_011004	GCCG	2	8	3429940	3429947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10077	NC_011004	GGC	3	9	3430025	3430033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_011004	GCG	3	9	3430089	3430097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_011004	TCG	2	6	3430122	3430127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_011004	GCCA	2	8	3430147	3430154	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10081	NC_011004	TGG	2	6	3430437	3430442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_011004	GTA	2	6	3430468	3430473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_011004	GTC	2	6	3430573	3430578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_011004	TCG	2	6	3430640	3430645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_011004	CCG	2	6	3430766	3430771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10086	NC_011004	GCA	2	6	3430809	3430814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_011004	GC	3	6	3430942	3430947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10088	NC_011004	GCCG	2	8	3430975	3430982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10089	NC_011004	GACCGA	2	12	3431044	3431055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10091	NC_011004	CGA	2	6	3431112	3431117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10093	NC_011004	CGG	2	6	3431179	3431184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_011004	GCG	2	6	3431212	3431217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_011004	CTG	2	6	3431218	3431223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_011004	GCG	2	6	3431236	3431241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_011004	GC	4	8	3431246	3431253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10098	NC_011004	CAG	2	6	3431330	3431335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10100	NC_011004	CAA	2	6	3431418	3431423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_011004	GCC	2	6	3431554	3431559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10102	NC_011004	CG	3	6	3431589	3431594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_011004	ACG	2	6	3431601	3431606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10106	NC_011004	AG	4	8	3434165	3434172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_011004	GC	3	6	3435583	3435588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10108	NC_011004	CCG	2	6	3435590	3435595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10109	NC_011004	CGG	2	6	3435626	3435631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_011004	GTGC	2	8	3435696	3435703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10111	NC_011004	GC	3	6	3435980	3435985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10112	NC_011004	CTT	2	6	3437411	3437416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_011004	CG	3	6	3439292	3439297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10114	NC_011004	CCG	2	6	3439318	3439323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10115	NC_011004	GAC	2	6	3440991	3440996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_011004	CCGA	2	8	3444095	3444102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10117	NC_011004	CG	4	8	3444105	3444112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10118	NC_011004	TGCGG	2	10	3444136	3444145	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10119	NC_011004	TTG	2	6	3444158	3444163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_011004	GCG	2	6	3444204	3444209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_011004	GCG	2	6	3444567	3444572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10124	NC_011004	GC	3	6	3444710	3444715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_011004	CG	3	6	3444723	3444728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10126	NC_011004	GCG	2	6	3446864	3446869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_011004	GTCGC	2	10	3447618	3447627	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10128	NC_011004	TCT	2	6	3447636	3447641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_011004	GCA	2	6	3447662	3447667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_011004	CCG	2	6	3447691	3447696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10131	NC_011004	TTACC	2	10	3447708	3447717	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10132	NC_011004	ATTGC	2	10	3448800	3448809	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10133	NC_011004	CGC	2	6	3449220	3449225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10134	NC_011004	GCG	2	6	3449263	3449268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_011004	GCACG	2	10	3449327	3449336	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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10138	NC_011004	GGC	2	6	3450229	3450234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10141	NC_011004	CGC	2	6	3450318	3450323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10142	NC_011004	GCC	2	6	3451607	3451612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10144	NC_011004	GCG	2	6	3451704	3451709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10152	NC_011004	CTT	2	6	3455204	3455209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10155	NC_011004	AAG	2	6	3455342	3455347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10160	NC_011004	CT	3	6	3457989	3457994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10161	NC_011004	GC	3	6	3458035	3458040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10162	NC_011004	TCGT	2	8	3458082	3458089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10163	NC_011004	CG	3	6	3458458	3458463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10164	NC_011004	CGG	2	6	3458498	3458503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10240	NC_011004	CGAC	2	8	3489389	3489396	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10241	NC_011004	ACGC	2	8	3489951	3489958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10242	NC_011004	TGA	2	6	3489976	3489981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10245	NC_011004	AGGCGA	2	12	3490883	3490894	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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10250	NC_011004	GC	3	6	3490977	3490982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10251	NC_011004	AGC	2	6	3491031	3491036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10252	NC_011004	AC	3	6	3492293	3492298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10253	NC_011004	CGA	2	6	3492343	3492348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10254	NC_011004	AC	3	6	3492384	3492389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10255	NC_011004	GCG	2	6	3493144	3493149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10257	NC_011004	CGG	2	6	3495539	3495544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10258	NC_011004	GC	3	6	3497371	3497376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10259	NC_011004	TTCCC	2	10	3497389	3497398	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10260	NC_011004	GCC	2	6	3498861	3498866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10261	NC_011004	TCGC	2	8	3498925	3498932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10262	NC_011004	TCG	2	6	3500290	3500295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10265	NC_011004	CGGC	2	8	3501155	3501162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10266	NC_011004	GCCG	2	8	3503210	3503217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10271	NC_011004	ACG	2	6	3512509	3512514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10272	NC_011004	CCG	2	6	3512536	3512541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10291	NC_011004	CGGC	2	8	3522718	3522725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10292	NC_011004	GCA	2	6	3522726	3522731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10301	NC_011004	TCGC	2	8	3523584	3523591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10329	NC_011004	CGAT	2	8	3539370	3539377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10347	NC_011004	GCG	2	6	3550977	3550982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10372	NC_011004	GGC	2	6	3557930	3557935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10380	NC_011004	GCC	2	6	3558157	3558162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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