MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_011004	GGC	2	6	3224337	3224342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9502	NC_011004	GAA	2	6	3224362	3224367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9503	NC_011004	GGA	2	6	3224387	3224392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9504	NC_011004	TTCCGG	2	12	3224402	3224413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9505	NC_011004	AGC	2	6	3224420	3224425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9506	NC_011004	GTT	2	6	3224432	3224437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9507	NC_011004	GGAG	2	8	3224457	3224464	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9508	NC_011004	CGG	2	6	3224485	3224490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9509	NC_011004	ACA	2	6	3224513	3224518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9510	NC_011004	GGTCGT	2	12	3224554	3224565	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9511	NC_011004	CGC	2	6	3224633	3224638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9512	NC_011004	TGT	2	6	3225640	3225645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_011004	CAG	2	6	3225676	3225681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9514	NC_011004	GGTT	2	8	3229989	3229996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9515	NC_011004	CGT	2	6	3229998	3230003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9516	NC_011004	GAT	2	6	3231865	3231870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9517	NC_011004	GCT	2	6	3231889	3231894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9518	NC_011004	CACT	2	8	3231947	3231954	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9519	NC_011004	CT	4	8	3231959	3231966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9520	NC_011004	CCG	2	6	3233137	3233142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9521	NC_011004	CCG	2	6	3233149	3233154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9522	NC_011004	GAG	2	6	3233222	3233227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9523	NC_011004	CCA	2	6	3234646	3234651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9524	NC_011004	ATCC	2	8	3235731	3235738	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9525	NC_011004	CGA	2	6	3235748	3235753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9526	NC_011004	CGA	2	6	3235760	3235765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9527	NC_011004	GCTTC	2	10	3235797	3235806	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9528	NC_011004	TC	3	6	3237175	3237180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9529	NC_011004	TGT	2	6	3237188	3237193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9530	NC_011004	CTT	2	6	3237197	3237202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9531	NC_011004	T	6	6	3237236	3237241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9532	NC_011004	TTTC	2	8	3237315	3237322	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9533	NC_011004	AAG	2	6	3237327	3237332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9534	NC_011004	TGT	2	6	3237338	3237343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9535	NC_011004	TGC	2	6	3237436	3237441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9536	NC_011004	GCC	2	6	3237450	3237455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9537	NC_011004	T	6	6	3237974	3237979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9538	NC_011004	TGC	2	6	3238026	3238031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9539	NC_011004	T	6	6	3238060	3238065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9540	NC_011004	TGCAA	2	10	3238151	3238160	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9541	NC_011004	GCGA	2	8	3240496	3240503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9542	NC_011004	CAA	2	6	3240508	3240513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9543	NC_011004	TCG	2	6	3240545	3240550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9544	NC_011004	CTC	2	6	3240556	3240561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9545	NC_011004	GTG	2	6	3240572	3240577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9546	NC_011004	ACA	2	6	3241877	3241882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9547	NC_011004	CG	3	6	3241892	3241897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9548	NC_011004	CCAGT	2	10	3241998	3242007	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9549	NC_011004	CG	3	6	3242015	3242020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9550	NC_011004	GGCG	2	8	3244941	3244948	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9551	NC_011004	CG	4	8	3245744	3245751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9552	NC_011004	GGT	2	6	3246654	3246659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9553	NC_011004	AGG	2	6	3246708	3246713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9554	NC_011004	CGCC	2	8	3249511	3249518	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9555	NC_011004	GC	3	6	3249520	3249525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9556	NC_011004	CGTT	2	8	3249542	3249549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9557	NC_011004	GGC	2	6	3251234	3251239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9558	NC_011004	GCC	2	6	3251377	3251382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9559	NC_011004	TCA	2	6	3251408	3251413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9560	NC_011004	CTT	2	6	3251430	3251435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9561	NC_011004	AAG	2	6	3251455	3251460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9562	NC_011004	GATG	2	8	3251485	3251492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9563	NC_011004	CGC	2	6	3251499	3251504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9564	NC_011004	AAC	2	6	3253821	3253826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9565	NC_011004	GTC	2	6	3257918	3257923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9566	NC_011004	GCG	2	6	3258568	3258573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9567	NC_011004	CCG	2	6	3258614	3258619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9568	NC_011004	GAG	2	6	3258654	3258659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9569	NC_011004	CTG	2	6	3259742	3259747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9570	NC_011004	GATT	2	8	3259834	3259841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9571	NC_011004	CGG	2	6	3259851	3259856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9572	NC_011004	ACCGC	2	10	3259874	3259883	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9573	NC_011004	ACC	3	9	3259884	3259892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9574	NC_011004	AGCCG	2	10	3259901	3259910	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9575	NC_011004	GGC	2	6	3260411	3260416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9578	NC_011004	CGAA	2	8	3262123	3262130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9579	NC_011004	TCG	2	6	3262330	3262335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9582	NC_011004	CGGC	2	8	3262916	3262923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9583	NC_011004	CCG	2	6	3262927	3262932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9584	NC_011004	GCT	2	6	3262937	3262942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9586	NC_011004	CG	3	6	3262959	3262964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9587	NC_011004	GTC	2	6	3262983	3262988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9591	NC_011004	CGG	2	6	3263566	3263571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9592	NC_011004	GCC	2	6	3264147	3264152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9593	NC_011004	GCC	2	6	3264159	3264164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9594	NC_011004	G	6	6	3264180	3264185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9595	NC_011004	CAT	2	6	3264190	3264195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9598	NC_011004	CG	4	8	3265679	3265686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9599	NC_011004	CAG	2	6	3265722	3265727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9601	NC_011004	GCC	2	6	3265830	3265835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9602	NC_011004	CGA	2	6	3265862	3265867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9604	NC_011004	GAC	2	6	3265882	3265887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9606	NC_011004	TG	3	6	3266151	3266156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9607	NC_011004	AGCG	2	8	3268078	3268085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9608	NC_011004	CTCA	2	8	3268102	3268109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9609	NC_011004	GAATC	2	10	3268124	3268133	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9610	NC_011004	GC	3	6	3268137	3268142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9611	NC_011004	GCG	2	6	3268181	3268186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9612	NC_011004	GTC	2	6	3268197	3268202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9613	NC_011004	CGG	2	6	3268229	3268234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9614	NC_011004	TCG	3	9	3268258	3268266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9616	NC_011004	CGA	2	6	3268324	3268329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9617	NC_011004	CCAGA	2	10	3268362	3268371	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9618	NC_011004	TCG	2	6	3268378	3268383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9619	NC_011004	AGGC	2	8	3268449	3268456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9620	NC_011004	CGG	2	6	3268527	3268532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9621	NC_011004	TTG	2	6	3268537	3268542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9623	NC_011004	GAG	2	6	3268626	3268631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9624	NC_011004	GCG	2	6	3268703	3268708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9625	NC_011004	GCG	3	9	3268727	3268735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9626	NC_011004	AGT	2	6	3268776	3268781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9627	NC_011004	GTC	2	6	3268824	3268829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9628	NC_011004	GTC	2	6	3268856	3268861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9630	NC_011004	AGC	2	6	3268945	3268950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9663	NC_011004	GC	3	6	3280117	3280122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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