MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011004	GC	4	8	3042861	3042868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9002	NC_011004	GTC	2	6	3042869	3042874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_011004	AGAAA	2	10	3042899	3042908	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_011004	GCT	2	6	3042915	3042920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_011004	GCG	2	6	3042966	3042971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_011004	GAA	2	6	3042987	3042992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_011004	CAG	2	6	3042999	3043004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_011004	ATG	2	6	3043006	3043011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_011004	TCC	2	6	3043065	3043070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9010	NC_011004	GTTG	2	8	3043071	3043078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_011004	CGT	2	6	3043102	3043107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_011004	GC	4	8	3043127	3043134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9013	NC_011004	ACG	2	6	3043144	3043149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_011004	TGG	2	6	3043625	3043630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_011004	CGG	2	6	3043702	3043707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9016	NC_011004	GCTC	2	8	3043781	3043788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9017	NC_011004	GCG	2	6	3043815	3043820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_011004	CGG	2	6	3043828	3043833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_011004	CGA	2	6	3043862	3043867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_011004	CG	3	6	3043890	3043895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9021	NC_011004	AGG	2	6	3043908	3043913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_011004	A	7	7	3043967	3043973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_011004	CGG	2	6	3044015	3044020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_011004	TCG	2	6	3044043	3044048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_011004	GC	3	6	3044067	3044072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9026	NC_011004	CGA	2	6	3044084	3044089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_011004	T	7	7	3044931	3044937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_011004	CGG	2	6	3044985	3044990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_011004	AGT	2	6	3045001	3045006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_011004	ATC	2	6	3045026	3045031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_011004	TCG	2	6	3045033	3045038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9032	NC_011004	CGA	2	6	3045045	3045050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_011004	TGA	2	6	3045057	3045062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_011004	GC	3	6	3045811	3045816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9035	NC_011004	CG	3	6	3045820	3045825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9036	NC_011004	CGCC	2	8	3045874	3045881	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9037	NC_011004	GCG	2	6	3045897	3045902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_011004	GCA	3	9	3046750	3046758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_011004	GAG	2	6	3046826	3046831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9041	NC_011004	GCG	2	6	3047774	3047779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9042	NC_011004	GCA	2	6	3047804	3047809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_011004	CG	3	6	3047835	3047840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9044	NC_011004	CGA	2	6	3047845	3047850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_011004	AGC	2	6	3047892	3047897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9046	NC_011004	GTCG	2	8	3047929	3047936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9047	NC_011004	CG	5	10	3047935	3047944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9048	NC_011004	CGCA	2	8	3047995	3048002	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9049	NC_011004	CG	3	6	3048005	3048010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9050	NC_011004	GCT	2	6	3048216	3048221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_011004	TTG	2	6	3050580	3050585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_011004	CCG	2	6	3050592	3050597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9053	NC_011004	GAAAC	2	10	3050647	3050656	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9054	NC_011004	CGG	2	6	3050729	3050734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9055	NC_011004	CGC	2	6	3050751	3050756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9056	NC_011004	CCA	2	6	3050759	3050764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9057	NC_011004	GCG	2	6	3051125	3051130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_011004	GCG	2	6	3051183	3051188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_011004	CTGCG	2	10	3051205	3051214	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9060	NC_011004	GGC	2	6	3051239	3051244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_011004	GAC	2	6	3055040	3055045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_011004	AG	3	6	3056024	3056029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_011004	GGT	2	6	3056030	3056035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_011004	TC	3	6	3058993	3058998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9065	NC_011004	TGT	2	6	3059011	3059016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_011004	GGC	2	6	3059060	3059065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_011004	CGGA	2	8	3059069	3059076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9068	NC_011004	CGA	2	6	3059080	3059085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_011004	GTGCG	2	10	3059102	3059111	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9070	NC_011004	TTG	2	6	3059116	3059121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9074	NC_011004	GGC	2	6	3059214	3059219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9077	NC_011004	ATCAC	2	10	3059249	3059258	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9078	NC_011004	GCG	2	6	3059520	3059525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9090	NC_011004	TGATT	2	10	3059803	3059812	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_011004	TCT	2	6	3059878	3059883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9092	NC_011004	GC	3	6	3059909	3059914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9093	NC_011004	GTG	2	6	3059995	3060000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9097	NC_011004	CGAC	2	8	3063160	3063167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9098	NC_011004	CGT	2	6	3063686	3063691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_011004	AAT	2	6	3064060	3064065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_011004	CG	5	10	3064203	3064212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9101	NC_011004	GTC	2	6	3065919	3065924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9104	NC_011004	GT	3	6	3065965	3065970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_011004	GAGC	2	8	3065981	3065988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9106	NC_011004	GCC	2	6	3065994	3065999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9107	NC_011004	GCG	2	6	3066013	3066018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9108	NC_011004	GGC	2	6	3066068	3066073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9109	NC_011004	GC	3	6	3066072	3066077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9110	NC_011004	GGC	2	6	3066078	3066083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9111	NC_011004	TTCTC	2	10	3066662	3066671	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9112	NC_011004	GAC	2	6	3066699	3066704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9113	NC_011004	AGAT	2	8	3066725	3066732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_011004	GAA	2	6	3066780	3066785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9119	NC_011004	GCG	2	6	3068381	3068386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9126	NC_011004	TGG	2	6	3079848	3079853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9129	NC_011004	GGC	2	6	3080021	3080026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9130	NC_011004	CGC	2	6	3080057	3080062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9131	NC_011004	CGT	2	6	3080074	3080079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9132	NC_011004	ATG	2	6	3080091	3080096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9133	NC_011004	GCT	3	9	3080105	3080113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9134	NC_011004	GGC	2	6	3080150	3080155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9135	NC_011004	GAC	2	6	3080202	3080207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9136	NC_011004	GAG	2	6	3080271	3080276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9137	NC_011004	AC	3	6	3080305	3080310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9138	NC_011004	AACG	2	8	3080436	3080443	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9139	NC_011004	CCG	2	6	3080444	3080449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9140	NC_011004	AGA	2	6	3080464	3080469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9141	NC_011004	CGGC	2	8	3080510	3080517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9142	NC_011004	GCGCC	2	10	3080545	3080554	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9143	NC_011004	CTG	2	6	3080559	3080564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9144	NC_011004	CGG	2	6	3080594	3080599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9145	NC_011004	GCT	2	6	3080624	3080629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9146	NC_011004	GCGCC	2	10	3080660	3080669	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9147	NC_011004	CG	3	6	3080702	3080707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9148	NC_011004	GA	3	6	3080763	3080768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9149	NC_011004	CGCGG	2	10	3080801	3080810	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9150	NC_011004	GCG	2	6	3080852	3080857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9151	NC_011004	GCC	2	6	3080956	3080961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9152	NC_011004	T	7	7	3081129	3081135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9153	NC_011004	GTCG	2	8	3082384	3082391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9154	NC_011004	TGG	2	6	3083623	3083628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9158	NC_011004	GTCT	2	8	3083757	3083764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9159	NC_011004	GCA	2	6	3083808	3083813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9161	NC_011004	CGG	2	6	3083860	3083865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9162	NC_011004	CGGC	2	8	3088806	3088813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9163	NC_011004	CG	3	6	3088839	3088844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9164	NC_011004	GGC	2	6	3088861	3088866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9165	NC_011004	TTG	2	6	3088909	3088914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9246	NC_011004	TTGC	2	8	3128880	3128887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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9251	NC_011004	GCC	2	6	3133596	3133601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9252	NC_011004	TCG	2	6	3133630	3133635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9254	NC_011004	GTC	2	6	3134055	3134060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9255	NC_011004	TCG	2	6	3134165	3134170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9256	NC_011004	AAAC	2	8	3134206	3134213	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9257	NC_011004	CG	3	6	3134263	3134268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9258	NC_011004	CGGTT	2	10	3134280	3134289	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9259	NC_011004	AAAT	2	8	3134299	3134306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9261	NC_011004	CGGCG	2	10	3134355	3134364	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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9263	NC_011004	CGGC	2	8	3136407	3136414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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