MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_011004	CAG	2	6	2884865	2884870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_011004	TGG	2	6	2884907	2884912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_011004	TCT	2	6	2884916	2884921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_011004	A	6	6	2884936	2884941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_011004	GAA	2	6	2884971	2884976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_011004	CG	3	6	2885017	2885022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8507	NC_011004	GCT	2	6	2885087	2885092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_011004	CTG	2	6	2885169	2885174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_011004	CGAT	2	8	2885197	2885204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8510	NC_011004	GAT	2	6	2885216	2885221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_011004	GAT	2	6	2885293	2885298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_011004	GTG	2	6	2885321	2885326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_011004	GCC	2	6	2885363	2885368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8514	NC_011004	CCGG	2	8	2885392	2885399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8515	NC_011004	GTG	2	6	2885408	2885413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_011004	TCG	2	6	2885415	2885420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_011004	GCC	2	6	2885467	2885472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8518	NC_011004	CAT	3	9	2885477	2885485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_011004	GCC	2	6	2885514	2885519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8520	NC_011004	TGC	2	6	2885602	2885607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_011004	CGG	2	6	2885657	2885662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_011004	CGA	2	6	2885663	2885668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8523	NC_011004	CGC	2	6	2885713	2885718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8524	NC_011004	GCTG	2	8	2885744	2885751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8525	NC_011004	GGC	2	6	2885757	2885762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_011004	CCG	2	6	2885935	2885940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8527	NC_011004	GCC	2	6	2886026	2886031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8528	NC_011004	AGC	2	6	2886079	2886084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_011004	CCGC	2	8	2886238	2886245	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8530	NC_011004	CG	3	6	2886256	2886261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8531	NC_011004	GAC	2	6	2886362	2886367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_011004	CCACGA	2	12	2886406	2886417	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8533	NC_011004	CAA	2	6	2886473	2886478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_011004	TTG	2	6	2886485	2886490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_011004	TTG	2	6	2886496	2886501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_011004	CG	3	6	2886512	2886517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8537	NC_011004	ACG	2	6	2886537	2886542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_011004	GCC	2	6	2886713	2886718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8539	NC_011004	CGG	2	6	2886768	2886773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_011004	CTGC	2	8	2886821	2886828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8541	NC_011004	GTACC	2	10	2886871	2886880	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8542	NC_011004	AATC	2	8	2886920	2886927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8543	NC_011004	CGC	2	6	2886935	2886940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8544	NC_011004	GCC	2	6	2887998	2888003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8545	NC_011004	GCG	2	6	2889875	2889880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_011004	CT	3	6	2889885	2889890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8547	NC_011004	ATC	2	6	2889927	2889932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8548	NC_011004	GATC	2	8	2889943	2889950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8549	NC_011004	TTG	2	6	2890096	2890101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_011004	CGC	2	6	2890111	2890116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8551	NC_011004	CGGC	2	8	2890140	2890147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8552	NC_011004	AAC	2	6	2890155	2890160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8553	NC_011004	AAC	2	6	2890231	2890236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8554	NC_011004	AGC	2	6	2890255	2890260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_011004	GC	3	6	2890298	2890303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8556	NC_011004	ACC	2	6	2890692	2890697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8557	NC_011004	TGC	2	6	2890743	2890748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_011004	AGGCG	2	10	2890757	2890766	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8559	NC_011004	GCG	2	6	2890769	2890774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8560	NC_011004	GCGA	2	8	2890805	2890812	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8561	NC_011004	TGC	2	6	2890833	2890838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_011004	CAA	2	6	2890870	2890875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8563	NC_011004	CTTGA	2	10	2890880	2890889	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8564	NC_011004	CGA	2	6	2890900	2890905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8565	NC_011004	TGGT	2	8	2890992	2890999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_011004	TTTTTG	2	12	2891036	2891047	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_011004	GCG	2	6	2894129	2894134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8568	NC_011004	TCG	2	6	2894191	2894196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8569	NC_011004	GAGC	2	8	2900399	2900406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8570	NC_011004	TG	3	6	2901201	2901206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_011004	ATG	2	6	2901212	2901217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_011004	AC	3	6	2901245	2901250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8573	NC_011004	GCGAC	2	10	2901283	2901292	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8574	NC_011004	GTG	2	6	2901324	2901329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_011004	AGC	2	6	2901348	2901353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_011004	TGC	2	6	2901388	2901393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8577	NC_011004	GC	4	8	2901392	2901399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8578	NC_011004	GCG	3	9	2901448	2901456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8579	NC_011004	TCG	2	6	2901466	2901471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8580	NC_011004	CCT	2	6	2904192	2904197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8581	NC_011004	GACG	2	8	2904198	2904205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8582	NC_011004	GGC	2	6	2904217	2904222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8583	NC_011004	CG	3	6	2904298	2904303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8584	NC_011004	GCG	2	6	2905387	2905392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8585	NC_011004	TGG	2	6	2906011	2906016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8586	NC_011004	TCCG	2	8	2906094	2906101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8587	NC_011004	CAG	3	9	2906153	2906161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8588	NC_011004	GGGC	2	8	2906194	2906201	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8589	NC_011004	CGGGC	2	10	2907382	2907391	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8590	NC_011004	GCCG	2	8	2908119	2908126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8591	NC_011004	GA	3	6	2910759	2910764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_011004	GC	3	6	2910775	2910780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8593	NC_011004	ATC	2	6	2910787	2910792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8594	NC_011004	GCA	2	6	2910799	2910804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8595	NC_011004	GAC	2	6	2910813	2910818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8596	NC_011004	GTG	2	6	2910828	2910833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_011004	CAA	2	6	2910844	2910849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8598	NC_011004	TTAT	2	8	2910864	2910871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_011004	GCA	2	6	2910876	2910881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_011004	GCTGC	2	10	2910894	2910903	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8601	NC_011004	GCC	2	6	2910904	2910909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8602	NC_011004	CG	3	6	2910933	2910938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8603	NC_011004	GCT	2	6	2910941	2910946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8604	NC_011004	TCGC	2	8	2910986	2910993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8605	NC_011004	GGC	2	6	2910997	2911002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_011004	ATC	2	6	2911063	2911068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8607	NC_011004	CGATCG	2	12	2911075	2911086	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8608	NC_011004	GAT	2	6	2911121	2911126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_011004	CGG	2	6	2911164	2911169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8610	NC_011004	GTT	2	6	2911192	2911197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_011004	TTCT	2	8	2911247	2911254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8612	NC_011004	TCGT	2	8	2911273	2911280	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8613	NC_011004	TCT	2	6	2915075	2915080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_011004	TGCG	2	8	2915083	2915090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8615	NC_011004	ATC	2	6	2915114	2915119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8616	NC_011004	TGCG	2	8	2915153	2915160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8617	NC_011004	TCGCT	2	10	2915192	2915201	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8618	NC_011004	TCA	2	6	2915308	2915313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_011004	CG	3	6	2918291	2918296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8620	NC_011004	CGT	2	6	2918314	2918319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8621	NC_011004	GC	3	6	2918325	2918330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8622	NC_011004	TC	4	8	2918336	2918343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8623	NC_011004	CCT	2	6	2918344	2918349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8624	NC_011004	GCG	2	6	2918373	2918378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8625	NC_011004	T	6	6	2918381	2918386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_011004	GTCG	2	8	2918411	2918418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8627	NC_011004	CCGCGG	2	12	2918422	2918433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8628	NC_011004	CCCG	2	8	2920104	2920111	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8629	NC_011004	CGG	2	6	2920170	2920175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8631	NC_011004	GCG	2	6	2920188	2920193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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