MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_011004	CGC	2	6	2710556	2710561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8002	NC_011004	CGT	2	6	2710569	2710574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_011004	GAT	2	6	2710582	2710587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_011004	ACC	2	6	2710589	2710594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_011004	AGCGA	2	10	2710613	2710622	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8006	NC_011004	TCAG	2	8	2710643	2710650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8007	NC_011004	TGC	2	6	2710652	2710657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_011004	CGA	2	6	2710669	2710674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_011004	GGC	2	6	2710696	2710701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_011004	TCC	2	6	2711680	2711685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8011	NC_011004	GGC	2	6	2713288	2713293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_011004	TGC	2	6	2713352	2713357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_011004	GTA	2	6	2714647	2714652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_011004	CGGGC	2	10	2714729	2714738	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8015	NC_011004	A	6	6	2714766	2714771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_011004	CGG	2	6	2716321	2716326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_011004	GGCGA	2	10	2718209	2718218	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8018	NC_011004	GCCGC	2	10	2718233	2718242	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8019	NC_011004	CCG	2	6	2718298	2718303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8020	NC_011004	CG	3	6	2718315	2718320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8021	NC_011004	GAC	2	6	2721034	2721039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_011004	TAG	2	6	2721043	2721048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_011004	CAG	2	6	2721076	2721081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_011004	TGC	2	6	2721083	2721088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_011004	GGC	2	6	2721137	2721142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_011004	AGG	2	6	2721268	2721273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_011004	GAC	3	9	2721286	2721294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_011004	TCGG	2	8	2721296	2721303	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8029	NC_011004	TCGG	2	8	2721348	2721355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8030	NC_011004	CGTCA	2	10	2721522	2721531	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8031	NC_011004	CAG	2	6	2723906	2723911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_011004	CGA	2	6	2723944	2723949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_011004	CCT	2	6	2724278	2724283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_011004	GC	3	6	2724327	2724332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8035	NC_011004	GAG	2	6	2724353	2724358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_011004	GTC	2	6	2724364	2724369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_011004	GTC	2	6	2724393	2724398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_011004	GAGG	2	8	2724414	2724421	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_011004	CCG	2	6	2724427	2724432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_011004	CCG	2	6	2724454	2724459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8041	NC_011004	TGA	2	6	2724497	2724502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_011004	ATCC	2	8	2726186	2726193	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8043	NC_011004	TGC	2	6	2726215	2726220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_011004	GC	3	6	2726219	2726224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8045	NC_011004	GC	3	6	2726228	2726233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8046	NC_011004	GATG	2	8	2726234	2726241	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_011004	GAC	2	6	2726262	2726267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_011004	CA	3	6	2726296	2726301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8049	NC_011004	GCC	2	6	2726345	2726350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8050	NC_011004	GCG	3	9	2726363	2726371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_011004	CGC	2	6	2726372	2726377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8052	NC_011004	CG	3	6	2726417	2726422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8053	NC_011004	CG	3	6	2726442	2726447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8054	NC_011004	GCG	2	6	2726455	2726460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_011004	CGG	2	6	2726469	2726474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_011004	GCG	2	6	2726559	2726564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_011004	GTA	2	6	2726572	2726577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_011004	GCG	2	6	2726578	2726583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_011004	CGG	2	6	2726716	2726721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_011004	ACG	2	6	2726772	2726777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_011004	AGC	2	6	2726849	2726854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_011004	GC	3	6	2727007	2727012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8063	NC_011004	AAG	2	6	2727034	2727039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_011004	TGC	2	6	2727131	2727136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_011004	CGA	2	6	2727158	2727163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_011004	CGT	2	6	2730199	2730204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_011004	CGGGG	2	10	2730236	2730245	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8068	NC_011004	GCA	3	9	2732306	2732314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_011004	AC	4	8	2732354	2732361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8070	NC_011004	TCAGC	2	10	2732363	2732372	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8071	NC_011004	GC	3	6	2732416	2732421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8072	NC_011004	ATCGG	2	10	2732445	2732454	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8073	NC_011004	GGACGC	2	12	2732487	2732498	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_011004	CGG	2	6	2732525	2732530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_011004	GGC	2	6	2733062	2733067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_011004	CTT	2	6	2733106	2733111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_011004	A	6	6	2733197	2733202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_011004	CAGA	2	8	2733271	2733278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8079	NC_011004	CCG	2	6	2736366	2736371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8080	NC_011004	GGT	2	6	2736474	2736479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_011004	AGG	2	6	2736482	2736487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_011004	TCG	2	6	2740330	2740335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_011004	TGA	2	6	2740337	2740342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_011004	TCC	2	6	2741079	2741084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8085	NC_011004	AAG	2	6	2741123	2741128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_011004	TCG	2	6	2741160	2741165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_011004	TGA	2	6	2741208	2741213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_011004	GCG	2	6	2741963	2741968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_011004	GT	3	6	2741976	2741981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_011004	CCGG	2	8	2742006	2742013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8091	NC_011004	GCGCC	2	10	2742025	2742034	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8092	NC_011004	GCC	2	6	2742114	2742119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8093	NC_011004	CCGT	2	8	2742158	2742165	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8094	NC_011004	ACGAA	2	10	2742211	2742220	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8095	NC_011004	GTATC	2	10	2742224	2742233	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8096	NC_011004	CG	3	6	2742299	2742304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8097	NC_011004	GCC	2	6	2742316	2742321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8098	NC_011004	CTT	2	6	2742339	2742344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_011004	GCG	2	6	2742354	2742359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_011004	CT	3	6	2742368	2742373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8101	NC_011004	GC	3	6	2743534	2743539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8102	NC_011004	GAT	2	6	2743583	2743588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_011004	GC	3	6	2743595	2743600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8104	NC_011004	CAA	2	6	2743620	2743625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_011004	CG	3	6	2743736	2743741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8106	NC_011004	GGGCGA	2	12	2743781	2743792	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8107	NC_011004	AACG	2	8	2746591	2746598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8108	NC_011004	CGG	3	9	2746602	2746610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_011004	TTC	3	9	2746627	2746635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_011004	GA	3	6	2746645	2746650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_011004	GAC	2	6	2747234	2747239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_011004	TC	3	6	2747240	2747245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8113	NC_011004	CG	3	6	2747282	2747287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8114	NC_011004	GCG	2	6	2748085	2748090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_011004	GTC	2	6	2748111	2748116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_011004	CTG	2	6	2748124	2748129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_011004	TTC	2	6	2748138	2748143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_011004	CTT	2	6	2748144	2748149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_011004	GTG	2	6	2748186	2748191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_011004	GC	3	6	2748194	2748199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_011004	CG	3	6	2748202	2748207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8122	NC_011004	TGT	2	6	2748249	2748254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_011004	CGTGG	2	10	2748281	2748290	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8124	NC_011004	GTGA	2	8	2748319	2748326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_011004	CGA	2	6	2748339	2748344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_011004	TCCT	2	8	2749995	2750002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_011004	CCG	2	6	2750063	2750068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8128	NC_011004	CAA	2	6	2750112	2750117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_011004	GAA	2	6	2750129	2750134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_011004	ATC	2	6	2751844	2751849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_011004	GCG	2	6	2752621	2752626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8132	NC_011004	CAAA	2	8	2752646	2752653	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8133	NC_011004	AGT	2	6	2754999	2755004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8140	NC_011004	CGG	2	6	2755231	2755236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8142	NC_011004	CGTA	2	8	2755322	2755329	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8143	NC_011004	TG	3	6	2755342	2755347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8144	NC_011004	CGC	2	6	2755941	2755946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8153	NC_011004	GA	3	6	2758502	2758507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8164	NC_011004	GCG	2	6	2763552	2763557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8243	NC_011004	CGTG	2	8	2803642	2803649	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8255	NC_011004	GT	3	6	2805138	2805143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8256	NC_011004	AAGTC	2	10	2805193	2805202	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8257	NC_011004	GGC	2	6	2806582	2806587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8259	NC_011004	TGG	2	6	2806681	2806686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8263	NC_011004	ACT	2	6	2807277	2807282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8388	NC_011004	CCCG	2	8	2830375	2830382	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8389	NC_011004	GAGCA	2	10	2830416	2830425	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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8393	NC_011004	CGC	3	9	2830580	2830588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8432	NC_011004	CG	3	6	2853094	2853099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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