MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_011004	GAA	2	6	2524706	2524711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_011004	AGC	2	6	2524777	2524782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7503	NC_011004	TCCA	2	8	2524810	2524817	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7504	NC_011004	GCC	2	6	2525524	2525529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7505	NC_011004	ACC	2	6	2525542	2525547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7506	NC_011004	TGT	2	6	2525591	2525596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_011004	CA	3	6	2525608	2525613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7508	NC_011004	GA	3	6	2525621	2525626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_011004	GATC	2	8	2528607	2528614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7510	NC_011004	CGC	2	6	2528615	2528620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7511	NC_011004	TGTTA	2	10	2528626	2528635	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_011004	TCGT	2	8	2529092	2529099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7513	NC_011004	CTG	2	6	2531383	2531388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_011004	AGC	2	6	2535007	2535012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_011004	GC	3	6	2535037	2535042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7516	NC_011004	CAAA	2	8	2535361	2535368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7517	NC_011004	GCG	2	6	2535370	2535375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7518	NC_011004	GTC	2	6	2536290	2536295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7519	NC_011004	GCT	2	6	2536360	2536365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7520	NC_011004	AAC	2	6	2536392	2536397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_011004	CG	3	6	2545336	2545341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7522	NC_011004	GCC	2	6	2545838	2545843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7523	NC_011004	AAC	2	6	2545867	2545872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_011004	AGCC	2	8	2547500	2547507	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7525	NC_011004	TGCC	2	8	2548024	2548031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7526	NC_011004	GGGGGT	2	12	2548036	2548047	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_011004	TGC	2	6	2548066	2548071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_011004	ACG	2	6	2548095	2548100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7529	NC_011004	GACG	2	8	2548118	2548125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7530	NC_011004	CCGT	2	8	2548139	2548146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7531	NC_011004	TGA	2	6	2548491	2548496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_011004	GAC	2	6	2548503	2548508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_011004	GCT	2	6	2549388	2549393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_011004	GAG	2	6	2551755	2551760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_011004	ATC	2	6	2553635	2553640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_011004	CCG	2	6	2553642	2553647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7537	NC_011004	CGAA	2	8	2553678	2553685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7538	NC_011004	GCG	2	6	2553742	2553747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_011004	GCG	2	6	2553812	2553817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_011004	CTCGG	2	10	2553836	2553845	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7541	NC_011004	TGC	2	6	2554019	2554024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7542	NC_011004	CTG	3	9	2554034	2554042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_011004	CG	3	6	2554061	2554066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7544	NC_011004	AAT	2	6	2554124	2554129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_011004	GCC	2	6	2554151	2554156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7546	NC_011004	TGC	2	6	2554164	2554169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_011004	TCGC	2	8	2554172	2554179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7548	NC_011004	TCG	2	6	2554185	2554190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_011004	GCT	2	6	2554210	2554215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_011004	CGT	2	6	2554221	2554226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7551	NC_011004	AGG	3	9	2554230	2554238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_011004	GGC	2	6	2554246	2554251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_011004	GGC	2	6	2554303	2554308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_011004	GCAG	2	8	2554408	2554415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7555	NC_011004	CAT	2	6	2554498	2554503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7556	NC_011004	TCG	2	6	2555717	2555722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7557	NC_011004	GCT	2	6	2555766	2555771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7558	NC_011004	CGG	2	6	2555823	2555828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_011004	CCGG	2	8	2555850	2555857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7560	NC_011004	GGC	2	6	2555909	2555914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_011004	GA	3	6	2555950	2555955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_011004	TGCGG	2	10	2555969	2555978	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7563	NC_011004	TCGG	2	8	2556053	2556060	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7564	NC_011004	CCGG	2	8	2556097	2556104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7565	NC_011004	CGG	2	6	2556136	2556141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7566	NC_011004	GTC	2	6	2556147	2556152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_011004	GTC	2	6	2557094	2557099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7568	NC_011004	CG	3	6	2557109	2557114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7569	NC_011004	CATCG	2	10	2561619	2561628	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7570	NC_011004	CG	3	6	2561631	2561636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7571	NC_011004	TCG	2	6	2565039	2565044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7572	NC_011004	CCG	2	6	2565098	2565103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7573	NC_011004	ACG	2	6	2565132	2565137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7574	NC_011004	GTC	2	6	2565176	2565181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_011004	GCAG	2	8	2565270	2565277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7576	NC_011004	GC	3	6	2565328	2565333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7577	NC_011004	CAT	2	6	2565370	2565375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7579	NC_011004	GCG	2	6	2567913	2567918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7580	NC_011004	TGG	2	6	2567934	2567939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_011004	GGC	2	6	2567955	2567960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7582	NC_011004	CGG	2	6	2567985	2567990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7583	NC_011004	TTCG	2	8	2568027	2568034	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7584	NC_011004	TGCGG	2	10	2568051	2568060	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7585	NC_011004	GAA	2	6	2568229	2568234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7586	NC_011004	CG	3	6	2568269	2568274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7587	NC_011004	CGT	2	6	2568298	2568303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7588	NC_011004	CG	3	6	2568320	2568325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7589	NC_011004	CGC	2	6	2568340	2568345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7591	NC_011004	GCG	2	6	2568384	2568389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7592	NC_011004	TGC	2	6	2570255	2570260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7593	NC_011004	GC	5	10	2570286	2570295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7594	NC_011004	TGG	2	6	2570324	2570329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_011004	GAC	2	6	2571933	2571938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7597	NC_011004	CTCG	2	8	2575248	2575255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7598	NC_011004	TGC	2	6	2575331	2575336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7599	NC_011004	GCGG	2	8	2575365	2575372	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7600	NC_011004	CCGC	2	8	2575374	2575381	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7601	NC_011004	GTC	2	6	2575438	2575443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7602	NC_011004	GGC	2	6	2575444	2575449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7603	NC_011004	CG	3	6	2575462	2575467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7604	NC_011004	GCG	2	6	2575477	2575482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7605	NC_011004	GGGCA	2	10	2575511	2575520	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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7607	NC_011004	CGA	2	6	2581237	2581242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7608	NC_011004	CGGGC	2	10	2581248	2581257	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7609	NC_011004	GAT	2	6	2583136	2583141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_011004	CGT	2	6	2583152	2583157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7611	NC_011004	CGG	2	6	2583159	2583164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7612	NC_011004	CTGG	2	8	2583180	2583187	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7613	NC_011004	CGC	2	6	2589468	2589473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7614	NC_011004	CGGC	2	8	2589545	2589552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7615	NC_011004	TCC	2	6	2589562	2589567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7616	NC_011004	GCA	2	6	2589612	2589617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7619	NC_011004	CCG	2	6	2592319	2592324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7621	NC_011004	GGC	2	6	2592348	2592353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7622	NC_011004	GGT	2	6	2592359	2592364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_011004	AGG	2	6	2592402	2592407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_011004	CGG	3	9	2593813	2593821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7625	NC_011004	TC	3	6	2593832	2593837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7626	NC_011004	CGC	2	6	2593838	2593843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7627	NC_011004	GCC	2	6	2593880	2593885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7628	NC_011004	ACG	2	6	2593933	2593938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7630	NC_011004	GACC	2	8	2595715	2595722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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